Affine Alignment
  
Alignment between H2AJ (top ENST00000544848.3_4 129aa) and H2AJ (bottom ENST00000544848.3_4 129aa) score 12103

001 MSGRGKQGGKVRAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLT 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MSGRGKQGGKVRAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLT 060

061 AEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKK 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 AEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKK 120

121 TESQKTKSK 129
    |||||||||
121 TESQKTKSK 129