Affine Alignment
 
Alignment between KCNQ2 (top ENST00000359125.7_10 872aa) and KCNQ2 (bottom ENST00000359125.7_10 872aa) score 87552

001 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKRGSILSKPRAG 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKRGSILSKPRAG 060

061 GAGAGKPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEK 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 GAGAGKPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEK 120

121 SSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASI 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 SSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASI 180

181 AVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGF 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 AVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGF 240

241 LCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLI 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 LCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLI 300

301 GVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTW 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 GVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTW 360

361 QYYERTVTVPMYSSQTQTYGASRLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPSKGSP 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 QYYERTVTVPMYSSQTQTYGASRLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPSKGSP 420

421 CRGPLCGCCPGRSSQKVSLKDRVFSSPRGVAAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKV 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 CRGPLCGCCPGRSSQKVSLKDRVFSSPRGVAAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKV 480

481 PKSWSFGDRSRARQAFRIKGAASRQNSEEASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSI 540
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 PKSWSFGDRSRARQAFRIKGAASRQNSEEASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSI 540

541 RAVCVMRFLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAIT 600
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
541 RAVCVMRFLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAIT 600

601 DKDRTKGPAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRMGIPPTETEAYFG 660
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
601 DKDRTKGPAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRMGIPPTETEAYFG 660

661 AKEPEPAPPYHSPEDSREHVDRHGCIVKIVRSSSSTGQKNFSAPPAAPPVQCPPSTSWQP 720
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
661 AKEPEPAPPYHSPEDSREHVDRHGCIVKIVRSSSSTGQKNFSAPPAAPPVQCPPSTSWQP 720

721 QSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHERSLSAYGGGNRASMEFLRQEDTPGCRPPEGN 780
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
721 QSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHERSLSAYGGGNRASMEFLRQEDTPGCRPPEGN 780

781 LRDSDTSISIPSVDHEELERSFSGFSISQSKENLDALNSCYAAVAPCAKVRPYIAEGESD 840
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
781 LRDSDTSISIPSVDHEELERSFSGFSISQSKENLDALNSCYAAVAPCAKVRPYIAEGESD 840

841 TDSDLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK 872
    ||||||||||||||||||||||||||||||||
841 TDSDLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK 872