UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1scl-3F49E11.112.0000000000000003e-125chrIV 13,060,112C. elegans SCL-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
2F20B6.6F20B6.6n/achrX 4,201,908contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
3M04G7.1M04G7.1n/achrIV 456,400contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domains IPR000877 (Proteinase inhibitor I12, Bowman-Birk), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
4C10G11.1C10G11.1n/achrI 6,307,930
5sul-2D1014.1n/achrV 8,158,775sul-2 is orthologous to the human gene ARYLSULFATASE A (ARSA; OMIM:250100), which when mutated leads to metachromatic leukodystrophy.
6ttr-26Y51A2D.11n/achrV 18,559,496C. elegans TTR-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domains IPR001534 (Transthyretin-like), IPR008964 (Invasin/intimin cell-adhesion)
7flp-13F33D4.3n/achrIV 7,697,747C. elegans FLP-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01581 FMRFamide related peptide family
8F41G3.10F41G3.10n/achrII 6,749,016contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
9C15C7.4C15C7.4n/achrX 3,146,822
10T16G1.7T16G1.7n/achrV 12,933,975T16G1.7 is orthologous to the human gene ALIAS DLC1~CANDIDATE TUMOR SUPPRESSOR GENE (DLEC1; OMIM:604050), which when mutated leads to disease.
11pqn-60R11G11.7n/achrV 504,306pqn-60 encodes a 154-residue, glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion'-like) protein, predicted to have coiled-coil structure, with many paralogs in nematodes but no obvious non-nematode orthologs; PQN-60 inhibits CEP-1- and HUS-1-dependent germline apoptosis, as do BMK-1, RAD-50, and RAD-51.
12C01G10.6C01G10.6n/achrV 15,087,952contains similarity to Staphylococcus aureus Staphylococcal secretory antigen ssaA2 precursor.; SW:Q6GED5
13F08G2.5F08G2.5n/achrII 13,833,272contains similarity to Homo sapiens Similar to Dentin sialophosphoprotein preproprotein; ENSEMBL:ENSP00000282478
14B0238.12B0238.12n/achrV 5,268,306B0238.12 encodes a putative secreted TIL-domain protease inhibitor paralogous to SWM-1, ISL-1, and the products of 11 other C. elegans genes; B0238.12 and its relatives are collectively similar to other TIL-domain protease inhibitors from nematodes, insects, and vertebrates; B0238.12 has no obvious function in mass RNAi assays.
15ida-1B0244.2n/achrIII 5,760,627ida-1 encodes a protein tyrosine phosphatase-like receptor, orthologous to the mammalian type I diabetes autoantigens IA-2 and phogrin that are expressed in dense core vesicles of neuroendocrine tissue and involved in regulated protein secretion; in C. elegans, IDA-1 appears to be required for regulating presynaptic neurotransmission and in particular, for the neuropeptidergic control of egg-laying; ida-1 interacts genetically with unc-31 and unc-64, which encode proteins required for dense core vesicle fusion and exocytosis; ida-1 expression is detected in a subset of neurons in the anterior nerve ring, the ventral nerve cord, the tail, and the vulva, including the VC vulval motoneurons and the HSN egg-laying neurons; ida-1 is also detected in the vulval uv1 cells, non-neuronal cells that contain neurosecretory-like vesicles.
16K09D9.1K09D9.1n/achrV 4,025,632
17ins-30ZC334.2n/achrI 14,035,617ins-30 encodes an insulin-like peptide.
18F21F3.1F21F3.1n/achrI 4,909,304contains similarity to Pfam domain PF01436 NHL repeat contains similarity to Interpro domains IPR000720 (Peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR013017 (NHL repeat, subgroup), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like), IPR001258 (NHL repeat)
19C49G7.5C49G7.5n/achrV 4,042,984
20ZC204.1ZC204.1n/achrII 1,666,906contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
21ttr-21F09F3.6n/achrV 13,854,097C. elegans TTR-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
22F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
23snt-4T23H2.2n/achrI 6,438,658C. elegans SNT-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR001565 (Synaptotagmin), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
24cyp-14A5F08F3.7n/achrV 5,422,142cyp-14A5 encodes a member of the cytochrome P450 family.
25C49G7.10C49G7.10n/achrV 4,041,191contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
26C01B4.8C01B4.8n/achrV 2,491,606contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
27F20A1.10F20A1.10n/achrV 7,052,940
28M7.12M7.12n/achrIV 11,097,281contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
29C01G10.4C01G10.4n/achrV 15,089,864contains similarity to Staphylococcus aureus Staphylococcal secretory antigen ssaA2 precursor.; SW:Q5HDQ9
30ttr-28R90.3n/achrV 12,904,670C. elegans TTR-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
31R06F6.7R06F6.7n/achrII 10,811,543contains similarity to Saccharomyces cerevisiae FLO5- and FLO8-determined flocculation are considerably less sensitive to mannose than FLO1-determined flocculation.; SGD:YHR211W
32drn-1C54A12.4n/achrII 5,271,026C. elegans DRN-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00071 Ras family contains similarity to Interpro domains IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR013753 (Ras)
33C49G7.6C49G7.6n/achrV 4,041,399
34F35A5.2F35A5.2n/achrX 3,805,400
35tbb-6T04H1.9n/achrV 12,262,563C. elegans TBB-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF00091 (Tubulin/FtsZ family, GTPase domain) , PF03953 (Tubulin/FtsZ family, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR002454 (Gamma tubulin), IPR002452 (Alpha tubulin), IPR002453 (Beta tubulin), IPR000217 (Tubulin), IPR003008 (Tubulin/FtsZ, GTPase), IPR004057 (Epsilon tubulin), IPR002967 (Delta tubulin), IPR008280 (Tubulin/FtsZ, C-terminal)
36E02C12.11E02C12.11n/achrV 9,379,644contains similarity to Pfam domain PF07914 Protein of unknown function (DUF1679) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species)
37F43G9.5F43G9.5n/achrI 8,615,863F43G9.5 encodes a NUDIX hydrolase that that inhibits DHC-1 in vivo, and is a (perhaps evolutionarily conserved) target of transcriptional activation by DAF-16; F43G9.5(RNAi) suppresses the lethality of conditional dhc-1 mutations, as well as the spindle length and cytokinesis defects of dhc-1(or195), indicating that F43G9.5 negatively regulates dynein; while loss of F43G9.5 function has no obvious effect on lifespan, dauer formation, or fat storage, F43G9.5 is required for embryonic development, fertility, and general health in mass RNAi assays.
38hen-1C36B7.7n/achrX 7,116,551hen-1 encodes a secreted protein that contains a low-density lipoprotein (LDL) receptor motif A; HEN-1 activity is required for integration of sensory stimuli and behavioral plasticity; a hen-1::GFP reporter is expressed in pharyngeal muscles, the vulva, and weakly in a subset of neurons; antibodies to HEN-1 protein detect expression exclusively in the AIY and ASE neurons, where HEN-1 appears to localize to cell bodies and in a punctate pattern in nerve ring axons at sites of synapse formation; HEN-1 expression in AIY appears to be under the control of the TTX-3 LIM domain transcription factor.
39F53F4.13F53F4.13n/achrV 13,611,622contains similarity to Agrobacterium tumefaciens Flagellar motor protein.; TR:Q8U9I2
40scl-25T19C9.50.00000000002chrV 17,227,538C. elegans SCL-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
41flp-3W07E11.2n/achrX 10,092,469flp-3 encodes nine copies of a GTMRFamide-containing peptide that is predicted to function as a neuropeptide that inhibits pharyngeal action potential in a manner similar to octopamine without having a significant effect on basal resting membrane potential; expressed in three pairs of neurons IL1D, OL1, URB.
42F28A12.3F28A12.3n/achrV 8,641,003
43nlp-1C01C4.1n/achrX 3,727,992nlp-1 encodes a predicted neuropeptide-like protein of the MSFamide family with similarity to Aplysia californica (sea hare) buccalin, a neuropeptide that regulates acetylcholine-induced muscle contraction; NLP-1 is expressed in the phasmid PHB tail sensory neuron, lateral neurons, head neurons, and the intestine; the precise role of NLP-1 in nervous system function and development is not yet known.
44E02C12.10E02C12.10n/achrV 9,376,724contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
45dod-6T20G5.7n/achrIII 10,197,925C. elegans DOD-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
46fipr-14F13E9.2n/achrIV 10,877,191C. elegans FIPR-14 protein; contains similarity to Interpro domain IPR005137 (Photosystem I assembly BtpA)
47tsp-1C02F5.8n/achrIII 8,238,638C. elegans TSP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin), IPR013305 (ABC transporter, ABCB2), IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel)
48C33G8.4C33G8.4n/achrV 7,006,530
49C55A6.6C55A6.6n/achrV 11,514,222contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
50R11D1.3R11D1.3n/achrV 12,711,700contains similarity to Proteus mirabilis Hypothetical protein (Fragment).; TR:O86985