UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K11H12.9K11H12.90chrIV 650,728contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
2C26B2.7C26B2.7n/achrIV 8,016,527
3rpt-5F56H1.4n/achrI 5,742,805rpt-5 encodes a triple A ATPase subunit of the 26S proteasome's 19S regulatory particle (RP) base subcomplex; RPT-5 is required for embryonic, larval, and germline development and by homology, is predicted to function in unfolding protein substrates and translocating them into the core proteolytic particle (CP) of the proteasome.
4R07C3.9R07C3.9n/achrII 912,522
5nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
6srh-21C02E7.2n/achrV 4,927,412C. elegans SRH-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7ZC53.2ZC53.2n/achrX 1,923,975
8F26D11.6F26D11.6n/achrV 7,955,880
9C13A2.11C13A2.11n/achrV 7,281,405contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
10C33F10.4C33F10.4n/achrII 4,796,475
11srd-32T19H12.5n/achrV 4,867,995C. elegans SRD-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5)
12C05D11.8C05D11.8n/achrIII 6,424,823contains similarity to Homo sapiens Isoform 2 of UPF0518 protein C11orf56; ENSEMBL:ENSP00000265978
13pde-1T04D3.3n/achrI 13,314,797C. elegans PDE-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF08499 (3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase N-terminal) , PF00233 (3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase) contains similarity to Interpro domains IPR002073 (3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase), IPR013706 (3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase N-terminal), IPR003607 (Metal-dependent phosphohydrolase, HD region)
14T10H10.2T10H10.2n/achrX 2,296,444contains similarity to Pfam domains PF04777 (Erv1 / Alr family) , PF00085 (Thioredoxin) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR006863 (Erv1/Alr), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
15T23H2.4T23H2.4n/achrI 6,455,456
16C53B4.6C53B4.6n/achrIV 8,985,786contains similarity to Pfam domain PF08449 UAA transporter family contains similarity to Interpro domain IPR013657 (UAA transporter)
17vab-15R07B1.1n/achrX 9,848,439The vab-15 gene encodes a msh-like homeobox gene that appears required for production of touch cell precursors, and that is orthologous to the human gene MSH HOMEO BOX HOMOLOG 1 (MSX1; OMIM:142983) which when mutated leads to disease.
18str-243K02H11.7n/achrV 1,523,505C. elegans STR-243 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19F18A12.3F18A12.3n/achrII 3,408,455F18A12.3 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F18A12.3 has no clear orthologs in other organisms.
20F45C12.16F45C12.16n/achrII 1,737,908contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
21F19D8.2F19D8.2n/achrX 13,835,397contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q9UMN6 Myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia protein 4; ENSEMBL:ENSP00000222270
22grk-1F19C6.1n/achrX 9,995,164grk-1 encodes a serine/threonine protein kinase that is most closely related to G protein-coupled receptor (GPCR) kinases.
23stdh-2F11A5.12n/achrV 16,224,881stdh-2 encodes a putative steroid dehydrogenase required for normally short lifespan; STDH-2 is orthologous to human HSD17B3 (OMIM:605573, mutated in pseudohermaphroditism), HSD17B12 (OMIM:609574), and HSDL1, and paralogous to LET-767, STDH-1, and STDH-3/-4.
24twk-16F52E4.4n/achrX 3,083,226C. elegans TWK-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR000694 (Proline-rich region), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
25mdt-1.2T23C6.1n/achrX 17,152,950C. elegans MDT-1.2 protein ;
26F36F12.8F36F12.8n/achrV 2,091,148contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
27F14B6.4F14B6.4n/achrI 12,237,119contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
28Y39A1A.10Y39A1A.10n/achrIII 10,632,788contains similarity to Arabidopsis thaliana ORF protein (Fragment).; TR:Q39170
29ZK858.2ZK858.2n/achrI 9,123,812contains similarity to Homo sapiens Selenoprotein V; ENSEMBL:ENSP00000333956
30F46C5.6F46C5.6n/achrII 8,842,371contains similarity to Pfam domain PF02985 HEAT repeat contains similarity to Interpro domains IPR011989 (Armadillo-like helical), IPR001953 (Na+/H+ exchanger, isoform 2 (NHE2)), IPR000357 (HEAT), IPR016024 (Armadillo-type fold)
31col-37ZK863.2n/achrV 12,167,206col-37 encodes a cuticle collagen.
32ZK688.3ZK688.3n/achrIII 7,894,068contains similarity to Pfam domain PF01557 Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family contains similarity to Interpro domains IPR010916 (TonB box, conserved site), IPR011234 (Fumarylacetoacetase, C-terminal-related), IPR002529 (Fumarylacetoacetase, C-terminal-like)
33sra-24T06G6.2n/achrI 12,706,029C. elegans SRA-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
34C15B12.2C15B12.2n/achrX 6,464,379
35ZC266.2ZC266.2n/achrV 4,696,862
36T22E5.3T22E5.3n/achrX 6,386,631contains similarity to Pfam domains PF01682 (DB module) , PF00041 (Fibronectin type III domain) contains similarity to Interpro domains IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR002602 (Protein of unknown function DB), IPR007110 (Immunoglobulin-like)
37F41H10.4F41H10.4n/achrIV 5,365,559contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Viral A-type inclusion protein, putative.; TR:A2DDX5
38rnt-1B0414.2n/achrI 5,782,356rnt-1 encodes a transcription factor that is the sole C. elegans member of the RUNX family of transcriptional regulators; rnt-1 activity is required for several developmental processes, including regulation of hypodermal seam cell proliferation and proper development of the male tail; RNT-1 can physically interact with SMA-4 and regulates, either directly or indirectly, expression of tlp-1 and cki-1, which encode a C2H2 zinc finger and CDK inhibitor, respectively; RNT-1::GFP reporter fusions are reportedly expressed in the nuclei of hypodermal seam cells, intestinal cells, body wall muscles, and, in males, cells derived from the V5, V6 and T lineages that give rise to the sensory rays.
39C54A12.3C54A12.3n/achrII 5,261,141
40T08D2.8T08D2.8n/achrX 196,174contains similarity to Pfam domain PF02985 HEAT repeat contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000357 (HEAT), IPR016024 (Armadillo-type fold)
41F54D12.5F54D12.5n/achrII 1,370,835contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
42sod-4F55H2.1n/achrIII 9,499,079C. elegans SOD-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00080 Copper/zinc superoxide dismutase (SODC) contains similarity to Interpro domain IPR001424 (Superoxide dismutase, copper/zinc binding)
43srh-227C35D6.2n/achrIV 16,343,304C. elegans SRH-227 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
44C31B8.1C31B8.1n/achrV 2,932,269
45F07G11.3F07G11.3n/achrV 7,300,103contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
46T28H10.1T28H10.1n/achrV 12,504,477contains similarity to Pfam domain PF01648 4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily contains similarity to Interpro domain IPR008278 (4'-phosphopantetheinyl transferase)
47F59H5.1F59H5.1n/achrII 2,509,863F59H5.1 encodes an unfamiliar protein with a low-complexity N-terminal region and a C-terminal DUF545 motif (of unknown function, found solely in nematode proteins); F59H5.1 is expressed in neuronal head ganglia, intestinal cells, hypodermal cells, and coelomocytes, with strong expression in embryos; F59H5.1 has no obvious function or phenotype in RNAi assays, whether in a normal background or in goa-1(-) or goa-1(gf) mutant backgrounds.
48D1022.5D1022.5n/achrII 7,458,058
49ugt-6ZC455.4n/achrV 12,796,799C. elegans UGT-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
50fut-4K12H6.3n/achrII 2,820,961fut-4 encodes a member of the glycosyltransferase 10 family.