UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1H04J21.1H04J21.10chrIII 2,369,757contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR010996 (DNA-directed DNA polymerase, family X, beta-like, N-terminal), IPR000626 (Ubiquitin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
2R01H2.2R01H2.2n/achrIII 7,057,468contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
3W03D8.3W03D8.3n/achrI 2,821,478contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
4K02B12.6K02B12.6n/achrI 8,519,194contains similarity to Schistosoma mansoni Putative eggshell protein (Fragment).; SW:P08016
5R07C3.13R07C3.13n/achrII 927,201
6F19B6.3F19B6.3n/achrIV 12,327,905contains similarity to Lactococcus lactis Unknown protein.; TR:Q9CF64
7K06B4.3K06B4.3n/achrV 15,672,799contains similarity to Saccharomyces cerevisiae mRNA binding protein; SGD:YPR042C
8W03B1.1W03B1.1n/achrIV 4,334,581
9twk-6F17C8.5n/achrIII 4,743,772twk-6 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; as loss of TWK-6 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of TWK-6 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; TWK-6 may, however, function redundantly with other TWK channels; TWK-6 is expressed in the hypodermis.
10C36F7.5C36F7.5n/achrI 9,575,404contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR003979 (Tropoelastin), IPR013286 (Annexin, type VII)
11K08E7.4K08E7.4n/achrIV 12,570,933contains similarity to Plasmodium falciparum Gene 11-1 protein precursor.; TR:Q8I6U6
12F58G1.9F58G1.9n/achrII 12,924,971contains similarity to Homo sapiens Adapter-related protein complex 4 mu 1 subunit; SW:O00189
13ZK930.5ZK930.5n/achrII 11,882,963contains similarity to Methanobacterium thermoautotrophicum Phosphoserine phosphatase.; TR:O27663
14F42G8.9F42G8.9n/achrIV 8,117,087
15sfxn-1.4C47D12.3n/achrII 11,680,034C. elegans SFXN-1.4 protein; contains similarity to Pfam domain PF03820 Tricarboxylate carrier contains similarity to Interpro domain IPR004686 (Tricarboxylate/iron carrier)
16C32C4.3C32C4.3n/achrV 10,646,016contains similarity to Yersinia pestis Putative phage-related membrane protein.; TR:Q8ZEA4
17K09F6.4K09F6.40.00000003chrII 2,263,817contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
18M70.2M70.2n/achrIV 2,243,378contains similarity to Homo sapiens Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog; ENSEMBL:ENSP00000283003
19wht-9Y49E10.9n/achrIII 12,393,102C. elegans WHT-9 protein; contains similarity to Pfam domains PF01061 (ABC-2 type transporter) , PF00005 (ABC transporter) contains similarity to Interpro domains IPR003439 (ABC transporter-like), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR013525 (ABC-2 type transporter)
20R09H10.2R09H10.2n/achrIV 10,606,027contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
21col-177F59F3.2n/achrX 11,000,722C. elegans COL-177 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
22K02H11.6K02H11.6n/achrV 1,534,154contains similarity to Pfam domains PF00085 (Thioredoxin) , PF08534 (Redoxin) , PF00578 (AhpC/TSA family) contains similarity to Interpro domains IPR011594 (Thioredoxin-like), IPR013740 (Redoxin), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR000866 (Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
23Y49A3A.4Y49A3A.4n/achrV 14,357,603contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
24D2045.5D2045.5n/achrIII 10,468,691contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
25W09C3.8W09C3.8n/achrI 4,716,751
26C44F1.2C44F1.2n/achrIII 3,769,375contains similarity to Pfam domains PF01342 (SAND domain) , PF02178 (AT hook motif) contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR010919 (SAND-like), IPR000770 (SAND)
27kin-31B0523.1n/achrIII 8,672,572kin-31 encodes a predicted tyrosine protein kinase expressed in the nucleus and cytoplasm of body-wall muscle cells; the expression of kin-31 was experimentally verified by RT-PCR.
28M05B5.3M05B5.3n/achrI 7,187,440contains similarity to Homo sapiens Similar to Suppressor protein SRP40; VG:OTTHUMP00000170311
29Y6B3B.7Y6B3B.7n/achrI 13,748,017contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
30C18H2.3C18H2.3n/achrIII 7,685,691contains similarity to Pfam domains PF00023 (Ankyrin repeat) (2), PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR001357 (BRCT)
31F19C7.5F19C7.5n/achrIV 4,596,309
32F26C11.1F26C11.1n/achrII 9,894,986contains similarity to Pfam domain PF00328 Histidine acid phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000560 (Histidine acid phosphatase)
33Y113G7B.11Y113G7B.11n/achrV 20,209,977contains similarity to Naja atra Cardiotoxin 10 precursor.; TR:Q9W6W6
34ZK418.6ZK418.6n/achrIII 7,076,490contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
35R01E6.5R01E6.5n/achrX 13,537,467contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
36K02F6.1K02F6.1n/achrII 2,555,138contains similarity to Pfam domain PF00098 Zinc knuckle contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR013084 (Zinc finger, CCHC retroviral-type), IPR001969 (Peptidase aspartic, active site), IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
37tsp-19D2092.7n/achrI 6,617,424C. elegans TSP-19 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
38Y7A5A.5Y7A5A.5n/achrX 15,786,599contains similarity to Pseudomonas aeruginosa NosL protein.; TR:Q9HYK8
39clec-152F10F2.6n/achrIII 4,633,383C. elegans CLEC-152 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
40ZK892.5ZK892.5n/achrII 10,008,728contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
41W01B6.4W01B6.4n/achrIV 10,075,527contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000173 (Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase)
42C31H1.2C31H1.2n/achrIV 5,792,361contains similarity to Pfam domain PF02013 Cellulose or protein binding domain contains similarity to Interpro domains IPR003616 (Post-SET zinc-binding region), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin), IPR002883 (Dockerin, cellulose-binding family V)
43K08D10.9K08D10.9n/achrIV 4,159,983
44F58F12.3F58F12.3n/achrII 6,390,234
45F28C10.4F28C10.4n/achrX 539,044
46R11.2R11.2n/achrX 16,184,757contains similarity to Homo sapiens Chromosome-associated kinesin KIF4A; ENSEMBL:ENSP00000262784
47C49A1.2C49A1.2n/achrI 14,210,845contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
48R155.2R155.27e-37chrIII 1,967,000contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR013992 (Adenylate cyclase-associated CAP, N-terminal), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
49K10C9.7K10C9.7n/achrV 1,066,687
50Y57G11C.5Y57G11C.5n/achrIV 14,763,509contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)