UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F45F2.1F45F2.10chrV 8,538,519contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
2Y62H9A.14Y62H9A.14n/achrX 11,922,107contains similarity to Interpro domain IPR009010 (Aspartate decarboxylase-like fold)
3srh-203F20E11.10n/achrV 17,455,364C. elegans SRH-203 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4T21B6.4T21B6.4n/achrX 10,934,829contains similarity to Interpro domain IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site)
5F58G11.4F58G11.4n/achrV 13,674,239contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
6srg-32T21C9.7n/achrV 10,587,952C. elegans SRG-32 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
7C46E10.2C46E10.2n/achrII 3,723,631
8F38E9.4F38E9.4n/achrX 16,452,168
9srh-49C10G11.4n/achrI 6,298,750C. elegans SRH-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10R11D1.4R11D1.4n/achrV 12,713,623contains similarity to Xenopus laevis Similar to kinesin-like 1.; TR:Q8AVK8
11srw-10ZC482.6n/achrIII 12,755,860C. elegans SRW-10 protein ;
12srj-27T01G5.3n/achrV 15,126,838C. elegans SRJ-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13C06B3.1C06B3.1n/achrV 13,903,319contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14C50E3.9C50E3.9n/achrV 7,599,821contains similarity to Interpro domain IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
15ubc-1C35B1.1n/achrIV 4,104,634ubc-1 encodes an E2 ubiquitin-conjugating enzyme that contains a novel 40 amino acid C-terminal tail, and is homologous to Saccharomyces cerevisiae RAD6/UBC2 which is involved in DNA repair; although loss of UBC-1 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, UBC-1 is able to complement the DNA repair defects of a Saccharomyces cerevisiae rad6 null mutant, suggesting that UBC-1 can function in the DNA repair pathway; ubc-1 mRNA is detectable in embryos.
16ceh-30C33D12.7n/achrX 3,064,554ceh-30 encodes a homeodomain protein most similar to Drosophila and mammalian BarH1 (OMIM:605211) which function in neuronal cell fate determination; the precise biological role of CEH-30 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
17F44A2.2F44A2.2n/achrV 9,319,570contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF07885 (Ion channel) , PF00520 (Ion transport protein) contains similarity to Interpro domains IPR005821 (Ion transport), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003971 (Potassium channel, voltage dependent, Kv9), IPR003968 (Potassium channel, voltage dependent, Kv), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation), IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003974 (Potassium channel, voltage dependent, Kv3)
18T05A6.5T05A6.5n/achrII 7,824,034contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
19ins-3ZK75.3n/achrII 5,990,388ins-3 encodes one of several insulin-related peptides; INS-3 is classified as a Type-beta insulin based on the predicted arrangement of disulfide bonds; gfp gene fusions with the promoter and enhancer regions indicate that INS-3 is expressed in some amphid sensory neurons.
20F41H8.2F41H8.2n/achrV 827,588contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
21Y54G9A.1Y54G9A.1n/achrII 13,700,041contains similarity to Carabus linnei NADH dehydrogenase subunit 5 (Fragment).; TR:O79584
22Y70C5C.3Y70C5C.3n/achrV 16,714,293contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
23M01G12.10M01G12.10n/achrI 12,119,338contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0477; ENSEMBL:ENSP00000316434
24lgc-6F17E9.8n/achrIV 8,341,064C. elegans LGC-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
25C03C10.7C03C10.7n/achrIII 4,096,446contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Profilin synthetic lethal protein, has region of coiled-coil structure; subunit of the Exocyst complex--the Exocyst complex contains the gene products encoded by SEC3, SEC5, SEC6, SEC8, SEC10, SEC15 and EXO70 and is required for exocytosis; SGD:YER008C
26sre-51C50E10.10n/achrII 12,312,675C. elegans SRE-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
27K06A1.1K06A1.1n/achrII 6,455,658K06A1.1 encodes an AP-2-like transcription factor.
28srh-109T19C9.4n/achrV 17,219,817C. elegans SRH-109 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29srz-48F20E11.1n/achrV 17,459,315C. elegans SRZ-48 protein ;
30F39F10.5F39F10.5n/achrX 16,913,317
31T08G5.8T08G5.8n/achrV 14,048,191contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
32Y116A8C.1Y116A8C.1n/achrIV 16,901,344contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
33srw-35T08G3.10n/achrV 16,472,391C. elegans SRW-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
34srh-209ZK262.11n/achrV 18,404,256C. elegans SRH-209 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35srz-53Y102A5C.23n/achrV 16,977,768C. elegans SRZ-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
36F25E2.1F25E2.1n/achrX 803,494contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
37B0244.5B0244.5n/achrIII 5,745,987
38R160.4R160.4n/achrX 4,367,984
39C24A11.5C24A11.5n/achrI 5,385,191
40T09F5.2T09F5.2n/achrV 15,151,275contains similarity to Saccharomyces cerevisiae cell wall mannoprotein; SGD:YOR009W
41F11A5.7F11A5.7n/achrV 16,205,976contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
42srh-154F20E11.12n/achrV 17,441,133C. elegans SRH-154 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit)
43ttx-3C40H5.5n/achrX 11,766,841ttx-3 encodes a LIM homeodomain protein required for functions of the interneuron AIY, including thermosensory behavior and olfactory learning.
44str-207F26G5.4n/achrV 4,952,370C. elegans STR-207 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45B0410.1B0410.1n/achrX 2,894,901
46ceh-16C13G5.1n/achrIII 8,624,237ceh-16 encodes a homeodomain protein orthologous to Drosophila and vertebrate Engrailed proteins involved in segment and appendage development; ceh-16 is an essential gene required for proper specification and differentiation of the lateral seam cells during embryonic development; in specifying seam cell fates, CEH-16 appears to act as a transcriptional regulator, repressing expression of the eff-1 gene required for cell fusion and inducing expression of seam cell-specific genes such as elt-5/GATA, nhr-73, and nhr-74; a rescuing CEH-16::GFP fusion protein is first expressed in the early embryo in cells of the AB lineage; in later embryonic stages CEH-16::GFP is seen in all lateral seam cell nuclei as well as in some anterior neurons; during postembryonic development, CEH-16::GFP is expressed in the DA1 and DD1 motorneurons.
47gst-11R11G1.3n/achrX 3,633,139C. elegans GST-11 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR003080 (Glutathione S-transferase, alpha class), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
48srbc-15F15E11.10n/achrV 2,346,927C. elegans SRBC-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
49T04C12.1T04C12.1n/achrV 11,058,930n/a
50str-204F10D2.1n/achrV 7,160,334C. elegans STR-204 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)