UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C55C2.3C55C2.35.0000000000000004e-105chrI 2,561,372
2F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
3T26H2.7T26H2.7n/achrV 19,220,389contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
4sru-48T03G11.2n/achrX 5,180,802C. elegans SRU-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
5fbxa-201T08B1.5n/achrV 1,976,339C. elegans FBXA-201 protein ;
6C08H9.14C08H9.14n/achrII 9,872,219contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
7F40E3.5F40E3.5n/achrI 2,646,674contains similarity to Interpro domain IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
8T24D5.5T24D5.5n/achrX 12,599,103contains similarity to Plasmodium falciparum PfEMP1-like protein.; TR:Q8IC59
9ZK666.2ZK666.2n/achrII 10,471,714contains similarity to Homo sapiens ASH1; ENSEMBL:ENSP00000265206
10F37A4.5F37A4.5n/achrIII 6,712,464contains similarity to Pfam domain PF01398 Mov34/MPN/PAD-1 family contains similarity to Interpro domains IPR000555 (Mov34/MPN/PAD-1), IPR006162 (Phosphopantetheine attachment site), IPR003639 (Mov34-1)
11C06C6.7C06C6.7n/achrV 15,993,879contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
12W03G1.5W03G1.5n/achrIV 505,834contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR000694 (Proline-rich region), IPR002964 (Adhesive plaque protein)
13F09C3.2F09C3.2n/achrI 14,273,068contains similarity to Pfam domain PF00702 haloacid dehalogenase-like hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR005833 (Haloacid dehydrogenase/epoxide hydrolase), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase)
14far-4F15B9.2n/achrV 12,999,023far-4 encodes a fatty acid and retinol-binding protein, paralogous to FAR-3 and FAR-5 and distantly homologous to FAR proteins of parasitic nematodes; FAR-4 binds lipids in vitro; far-4 is transcribed at highest levels in the fourth larval stage, and is dispensable for viability and gross morphology in mass RNAi assays.
15F46A9.2F46A9.2n/achrI 9,459,902contains similarity to Saccharomyces cerevisiae part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA); similar to microtubule binding proteins and to X90565_5.cds; SGD:YLR197W
16H14N18.2H14N18.2n/achrV 8,933,428
17B0222.2B0222.2n/achrV 9,136,662contains similarity to Pfam domain PF01384 Phosphate transporter family contains similarity to Interpro domain IPR001204 (Phosphate transporter)
18cnc-7F53H2.2n/achrV 20,389,778C. elegans CNC-7 protein ;
19F44B9.9F44B9.9n/achrIII 8,030,412contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
20C28H8.8C28H8.8n/achrIII 5,887,890contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
21ZC196.3ZC196.3n/achrV 8,737,532contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domain IPR007883 (Protein of unknown function DUF713)
22F20D6.10F20D6.10n/achrV 8,193,961contains similarity to Homo sapiens Protein FAM133A; ENSEMBL:ENSP00000318974
23Y51A2B.4Y51A2B.4n/achrV 18,387,652contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domains IPR002921 (Lipase, class 3), IPR008262 (Lipase, active site)
24sma-1R31.1n/achrV 11,908,070sma-1 encodes a beta-H spectrin; during embryonic morphogenesis, SMA-1 activity is required for a normal rate of elongation and thus, for a wild-type body length upon hatching; in addition, SMA-1 is required for proper morphogenesis of the pharynx and the excretory cell; sma-1 mRNA transcripts are first detected in hypodermal cells at the beginning of embryonic morphogenesis with later expression visible in the developing pharynx, intestine, and excretory cell.
25lgc-15T01H10.3n/achrX 12,115,046C. elegans LGC-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
26F46F5.1F46F5.1n/achrII 790,983
27Y6E2A.7Y6E2A.7n/achrV 15,720,542contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein FLJ31980; ENSEMBL:ENSP00000285871
28srd-23Y40H7A.5n/achrIV 15,181,398C. elegans SRD-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29scrt-1C55C2.1n/achrI 2,569,754C. elegans SCRT-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
30T27A1.1T27A1.1n/achrII 504,620
31ins-39F21E9.4n/achrX 1,344,119ins-39 encodes an insulin-like peptide.
32F26E4.2F26E4.2n/achrI 9,759,327contains similarity to Pasteurella haemolytica HSDR.; TR:P95512
33K09D9.11K09D9.11n/achrV 3,999,279contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
34T01C3.5T01C3.5n/achrV 14,997,353contains similarity to Oryza sativa Similar to gene for Pib.; TR:Q9LWW7
35T23F2.3T23F2.3n/achrX 5,512,125contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
36K03F8.1K03F8.1n/achrIII 6,511,465contains similarity to Interpro domains IPR015706 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase), related), IPR003286 (Nematode reverse transcriptase-like)
37F57A8.4F57A8.4n/achrV 10,067,924contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
38srz-19F56D6.4n/achrIV 3,920,703C. elegans SRZ-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
39C49D10.7C49D10.7n/achrII 3,856,247contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
40F31D5.4F31D5.4n/achrII 4,179,466contains similarity to Pfam domain PF01825 Latrophilin/CL-1-like GPS domain contains similarity to Interpro domain IPR000203 (GPS)
41djr-1.2C49G7.11n/achrV 4,054,635C. elegans DJR-1.2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01965 DJ-1/PfpI family contains similarity to Interpro domains IPR006287 (DJ-1), IPR002818 (ThiJ/PfpI)
42F42C5.3F42C5.3n/achrIV 7,286,758contains similarity to Homo sapiens Intersectin 1 short form transcript variant 8; ENSEMBL:ENSP00000370685
43srg-34Y51A2D.12n/achrV 18,563,515C. elegans SRG-34 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
44ZK218.11ZK218.11n/achrV 17,107,962contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
45T20D4.6T20D4.6n/achrV 3,411,676contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
46C17E4.1C17E4.1n/achrI 9,409,217contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
47F46B3.9F46B3.9n/achrV 20,621,052contains similarity to Interpro domain IPR003645 (Follistatin-like, N-terminal)
48nhr-260C38C3.9n/achrV 1,510,828C. elegans NHR-260 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
49spp-9T25C12.2n/achrX 11,487,901C. elegans SPP-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF03489 Saposin-like type B, region 2 contains similarity to Interpro domains IPR008138 (Saposin-like type B, 2), IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
50F46F5.16F46F5.16n/achrII 787,659