UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1C49G7.5C49G7.54e-147chrV 4,042,984
2F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
3Y43F8C.5Y43F8C.5n/achrV 19,631,978contains similarity to Dictyostelium discoideum Myb-like protein (Fragment).; SW:MYBH_DICDI
4mab-9T27A1.6n/achrII 518,813mab-9 encodes a member of the T-box family of transcriptional regulators containing a 200-amino acid T-box DNA-binding domain most similar to mouse Brachyury; mab-9 is involved in hindgut and male tail development, specifically affecting the fate of two posterior blast cells in the hindgut, B and F; in the male this results in a grossly abnormal tail lacking spicules, and renders them incapable of mating; in the hermaphrodite this results in hindgut defects; mab-9 may also be part of a network of T-box genes that includes tbx-8, tbx-9 and vab-7 and is important for the correct patterning of posterior cells in the developing embryo; mab-9 affects movement to some extent though the basis for this defect is unknown; MAB-9 localizes to the nucleus of B and F and their descendents during development.
5E02C12.10E02C12.10n/achrV 9,376,724contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
6F20B6.6F20B6.6n/achrX 4,201,908contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
7C10G11.1C10G11.1n/achrI 6,307,930
8scl-3F49E11.11n/achrIV 13,060,112C. elegans SCL-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
9K09D9.1K09D9.16e-33chrV 4,025,632
10M04G7.1M04G7.1n/achrIV 456,400contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domains IPR000877 (Proteinase inhibitor I12, Bowman-Birk), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
11sul-2D1014.1n/achrV 8,158,775sul-2 is orthologous to the human gene ARYLSULFATASE A (ARSA; OMIM:250100), which when mutated leads to metachromatic leukodystrophy.
12F53E10.4F53E10.4n/achrV 2,593,813
13C15C7.4C15C7.4n/achrX 3,146,822
14F20D6.10F20D6.10n/achrV 8,193,961contains similarity to Homo sapiens Protein FAM133A; ENSEMBL:ENSP00000318974
15pqn-60R11G11.7n/achrV 504,306pqn-60 encodes a 154-residue, glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion'-like) protein, predicted to have coiled-coil structure, with many paralogs in nematodes but no obvious non-nematode orthologs; PQN-60 inhibits CEP-1- and HUS-1-dependent germline apoptosis, as do BMK-1, RAD-50, and RAD-51.
16F08G2.5F08G2.5n/achrII 13,833,272contains similarity to Homo sapiens Similar to Dentin sialophosphoprotein preproprotein; ENSEMBL:ENSP00000282478
17C49G7.10C49G7.107e-58chrV 4,041,191contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
18F38B2.2F38B2.2n/achrX 11,278,957contains similarity to Pneumocystis carinii DNA-directed RNA polymerase III (EC 2.7.7.6) (Fragment).; TR:Q06358
19T16G1.7T16G1.7n/achrV 12,933,975T16G1.7 is orthologous to the human gene ALIAS DLC1~CANDIDATE TUMOR SUPPRESSOR GENE (DLEC1; OMIM:604050), which when mutated leads to disease.
20tbb-6T04H1.9n/achrV 12,262,563C. elegans TBB-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF00091 (Tubulin/FtsZ family, GTPase domain) , PF03953 (Tubulin/FtsZ family, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR002454 (Gamma tubulin), IPR002452 (Alpha tubulin), IPR002453 (Beta tubulin), IPR000217 (Tubulin), IPR003008 (Tubulin/FtsZ, GTPase), IPR004057 (Epsilon tubulin), IPR002967 (Delta tubulin), IPR008280 (Tubulin/FtsZ, C-terminal)
21F43G9.5F43G9.5n/achrI 8,615,863F43G9.5 encodes a NUDIX hydrolase that that inhibits DHC-1 in vivo, and is a (perhaps evolutionarily conserved) target of transcriptional activation by DAF-16; F43G9.5(RNAi) suppresses the lethality of conditional dhc-1 mutations, as well as the spindle length and cytokinesis defects of dhc-1(or195), indicating that F43G9.5 negatively regulates dynein; while loss of F43G9.5 function has no obvious effect on lifespan, dauer formation, or fat storage, F43G9.5 is required for embryonic development, fertility, and general health in mass RNAi assays.
22dct-19C32H11.13n/achrIV 12,943,591C. elegans DCT-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
23tsp-1C02F5.8n/achrIII 8,238,638C. elegans TSP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin), IPR013305 (ABC transporter, ABCB2), IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel)
24flp-13F33D4.3n/achrIV 7,697,747C. elegans FLP-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01581 FMRFamide related peptide family
25R11D1.3R11D1.3n/achrV 12,711,700contains similarity to Proteus mirabilis Hypothetical protein (Fragment).; TR:O86985
26E02C12.11E02C12.11n/achrV 9,379,644contains similarity to Pfam domain PF07914 Protein of unknown function (DUF1679) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species)
27C01B4.8C01B4.8n/achrV 2,491,606contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
28ttr-28R90.3n/achrV 12,904,670C. elegans TTR-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
29C01G10.6C01G10.6n/achrV 15,087,952contains similarity to Staphylococcus aureus Staphylococcal secretory antigen ssaA2 precursor.; SW:Q6GED5
30ttr-26Y51A2D.11n/achrV 18,559,496C. elegans TTR-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domains IPR001534 (Transthyretin-like), IPR008964 (Invasin/intimin cell-adhesion)
31R06F6.7R06F6.7n/achrII 10,811,543contains similarity to Saccharomyces cerevisiae FLO5- and FLO8-determined flocculation are considerably less sensitive to mannose than FLO1-determined flocculation.; SGD:YHR211W
32C01G10.5C01G10.5n/achrV 15,089,276contains similarity to Homo sapiens Glycine/tyrosine-rich protein; ENSEMBL:ENSP00000335001
33ins-30ZC334.2n/achrI 14,035,617ins-30 encodes an insulin-like peptide.
34M7.12M7.12n/achrIV 11,097,281contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
35ida-1B0244.2n/achrIII 5,760,627ida-1 encodes a protein tyrosine phosphatase-like receptor, orthologous to the mammalian type I diabetes autoantigens IA-2 and phogrin that are expressed in dense core vesicles of neuroendocrine tissue and involved in regulated protein secretion; in C. elegans, IDA-1 appears to be required for regulating presynaptic neurotransmission and in particular, for the neuropeptidergic control of egg-laying; ida-1 interacts genetically with unc-31 and unc-64, which encode proteins required for dense core vesicle fusion and exocytosis; ida-1 expression is detected in a subset of neurons in the anterior nerve ring, the ventral nerve cord, the tail, and the vulva, including the VC vulval motoneurons and the HSN egg-laying neurons; ida-1 is also detected in the vulval uv1 cells, non-neuronal cells that contain neurosecretory-like vesicles.
36C54C6.5C54C6.5n/achrIII 3,549,652contains similarity to Mycoplasma pulmonis Hypothetical protein MYPU_4440.; TR:Q98QC2
37B0238.12B0238.12n/achrV 5,268,306B0238.12 encodes a putative secreted TIL-domain protease inhibitor paralogous to SWM-1, ISL-1, and the products of 11 other C. elegans genes; B0238.12 and its relatives are collectively similar to other TIL-domain protease inhibitors from nematodes, insects, and vertebrates; B0238.12 has no obvious function in mass RNAi assays.
38pax-3F27E5.2n/achrII 10,149,568pax-3 encodes a divergent paired-like homeodomain protein that does not belong to the Q50, K50, or S50 classes; PAX-3 is required for locomotion and vulval development; pax-3(RNAi) animals have consistent Pvl and Unc phenotypes (as well as less consistent Bmd, Rup, and Stp phenotypes).
39scl-25T19C9.5n/achrV 17,227,538C. elegans SCL-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
40sol-1C15A11.3n/achrI 7,392,485C. elegans SOL-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00431 CUB domain contains similarity to Interpro domain IPR000859 (CUB)
41fbxa-44F09C6.2n/achrV 16,889,957This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
42F35H10.3F35H10.3n/achrIV 8,326,450
43F41C6.6F41C6.6n/achrX 6,881,383
44F44G4.6F44G4.6n/achrII 9,001,316contains similarity to Interpro domain IPR001209 (Ribosomal protein S14)
45C55A6.6C55A6.6n/achrV 11,514,222contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
46C47D2.1C47D2.1n/achrX 8,215,243
47F41G3.10F41G3.10n/achrII 6,749,016contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
48dod-6T20G5.7n/achrIII 10,197,925C. elegans DOD-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
49zig-4C09C7.1n/achrX 7,925,923zig-4 encodes a predicted secreted protein that is a member of the immunoglobulin superfamily of proteins; ZIG-4 activity is required for maintenance of ventral nerve cord organization: the AVKL/R and PVQL/R axons of the left and right ventral nerve cords do not maintain their proper spatial positions and drift into the opposite cord; a zig-4::gfp reporter fusion is expressed in the PVT, ASK, BAG, and M2 neurons, with expression also seen during the L1 stage in pharyngeal mesoderm and ectoderm.
50K08D9.4K08D9.4n/achrV 3,199,601contains similarity to Pfam domain PF06342 Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1057) contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR010463 (Protein of unknown function DUF1057, lipase putative), IPR003089 (Alpha/beta hydrolase)