UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srw-139C44C3.76e-180chrV 2,984,742C. elegans SRW-139 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
2mcd-1Y51H1A.6n/achrII 13,891,577mcd-1 encodes a highly acidic C2H2-type zinc-finger protein that, in conjunction with LIN-35/Rb, DPL-1/DP, EFL-1/E2F, LIN-37/Mip40, and LIN-52, promotes the developmentally programmed progression of cells through full apoptosis; MCD-1 can promote ectopic apoptosis in cells normally fated to live, and is thus active in such cells; MCD-1 is not required for CED-3-independent cell death, does not regulate CED-9, and probably does not transcriptionally regulate egl-1; MCD-1 and its partners do not act together with CED-1 or CED-8, and their function in cell death is distinct from the LET-60/RAS or SynMuv pathways; however, MCD-1 is redundantly required with some class B/C synMuv proteins for viability (LIN-9, LIN-35/Rb, or LIN-37/Mip40) and normally rapid growth (DPL-1/DP, LIN-13, LIN-53, LIN-54, or MYS-1); in mcd-1(n4005) animals, cells that would normally undergo apoptosis can instead pass through an episode of pre-apoptotic condensation, after which they sometimes revert to normal shape, survive, and differentiate; MCD-1 contains an N-terminal low-complexity region and a single central zinc-finger, but no other recognizable protein domains; MCD-1 is paralogous to Y48E1B.7, but has no obvious non-nematode orthologs.
3str-71T23F1.4n/achrV 15,458,547C. elegans STR-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4F56H6.11F56H6.11n/achrI 12,309,058contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
5ZC190.9ZC190.9n/achrV 8,692,862
6Y116A8C.15Y116A8C.15n/achrIV 16,996,337contains similarity to Homo sapiens similar to KIAA1357 protein; ENSEMBL:ENSP00000258005
7Y75B8A.32Y75B8A.32n/achrIII 12,356,632contains similarity to Danio rerio PERQ amino acid-rich with GYF domain-containing protein 2s(Trinucleotide repeat-containing gene 15 protein).; SW:Q4KME6
8srd-56E04F6.14n/achrII 7,202,553C. elegans SRD-56 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9C09G9.3C09G9.3n/achrIV 8,871,534contains similarity to Pfam domain PF01681 C6 domain contains similarity to Interpro domain IPR002601 (Protein of unknown function C6)
10Y79H2A.4Y79H2A.4n/achrIII 12,041,576contains similarity to Interpro domains IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
11C30E1.8C30E1.8n/achrX 16,917,982contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
12ZK185.1ZK185.1n/achrIV 4,550,393contains similarity to Interpro domain IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like)
13F33C8.2F33C8.2n/achrX 14,722,337contains similarity to Interpro domain IPR003382 (Flavoprotein)
14srx-119F49C5.1n/achrII 12,528,893C. elegans SRX-119 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
15F59H6.6F59H6.6n/achrII 2,011,980contains similarity to Interpro domain IPR009057 (Homeodomain-like)
16sru-19T04A11.8n/achrIV 12,499,445C. elegans SRU-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
17F48C1.3F48C1.3n/achrI 5,314,472
18W09B6.5W09B6.5n/achrII 1,140,824
19W02B8.1W02B8.1n/achrII 13,900,226
20D1086.1D1086.1n/achrV 14,099,606contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
21K08D10.11K08D10.11n/achrIV 4,185,528
22F58E6.6F58E6.6n/achrV 9,752,440contains similarity to Monosiga brevicollis MBCTL1 (Fragment).; TR:Q7YZI0
23C18G1.7C18G1.7n/achrV 4,746,815contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
24F48G7.9F48G7.9n/achrV 628,338contains similarity to Pfam domain PF00130 Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain) contains similarity to Interpro domains IPR015727 (Protein kinase C mu-related), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
25sre-33W05H5.6n/achrII 12,453,974C. elegans SRE-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
26D1007.9D1007.9n/achrI 4,591,009
27B0302.4B0302.4n/achrX 17,176,549
28Y45F10D.10Y45F10D.10n/achrIV 13,786,277contains similarity to Pseudotylosurus angusticeps Recombination-activating protein 2 (Fragment).; TR:Q9DD51
29smf-2K11G12.3n/achrX 6,717,366C. elegans SMF-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01566 Natural resistance-associated macrophage protein contains similarity to Interpro domain IPR001046 (Natural resistance-associated macrophage protein)
30Y116A8C.11Y116A8C.11n/achrIV 16,989,256contains similarity to Streptococcus pyogenes serotype M5 M protein, serotype 5 precursor.; SW:P02977
31sru-4C33A12.10n/achrIV 9,498,965C. elegans SRU-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
32trxr-2ZK637.10n/achrIII 8,915,015C. elegans TRXR-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF02852 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain) , PF07992 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase) , PF00070 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase) contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR000447 (FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase), IPR000103 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II), IPR012999 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I, active site), IPR004099 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation), IPR006338 (Thioredoxin and glutathione reductase selenoprotein), IPR016156 (FAD/NAD-linked reductase, dimerisation), IPR001327 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, NAD-binding region), IPR000815 (Mercuric reductase), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
33Y45G12C.10Y45G12C.10n/achrV 2,535,583contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34lrp-2T21E3.3n/achrI 3,939,445C. elegans LRP-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (6), PF07974 (EGF-like domain) , PF00057 (Low-density lipoprotein receptor domain class A) (14), PF00058 (Low-density lipoprotein receptor repeat class B) (7)contains similarity to Interpro domains IPR000033 (), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
35T27F6.7T27F6.7n/achrI 12,496,077contains similarity to Timmia bavarica NADH dehydrogenase subunit 4 (Fragment).; TR:Q94YV9
36C05D9.4C05D9.4n/achrX 1,108,239
37srv-8F53F1.7n/achrV 13,419,959C. elegans SRV-8 protein; contains similarity to Interpro domains IPR002456 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B1), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B)
38srsx-1F40D4.5n/achrV 17,177,360C. elegans SRSX-1 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
39bath-23Y49F6C.5n/achrII 3,371,722C. elegans BATH-23 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
40str-23C55A1.5n/achrV 15,645,650C. elegans STR-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41C35D6.3C35D6.3n/achrIV 16,347,259contains similarity to Interpro domain IPR003100 (Argonaute and Dicer protein, PAZ)
42clec-120F29A7.7n/achrII 2,756,519C. elegans CLEC-120 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold)
43srd-41F17A2.6n/achrX 12,327,467C. elegans SRD-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site)
44EGAP2.2EGAP2.2n/achrII 5,230,269
45srv-36F57G8.8n/achrV 16,324,110C. elegans SRV-36 protein ;
46Y49F6C.8Y49F6C.8n/achrII 3,369,682
47T23D5.3T23D5.3n/achrV 15,733,239contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR005098 (Protein of unknown function DUF281)
48C14E2.2C14E2.2n/achrX 1,808,144contains similarity to Pfam domain PF00155 Aminotransferase class I and II contains similarity to Interpro domains IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR004839 (Aminotransferase, class I and II), IPR000796 (Aspartate/other aminotransferase), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
49srbc-25F40D4.6n/achrV 17,174,753C. elegans SRBC-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
50C03B1.9C03B1.9n/achrX 6,346,694