UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C25D7.12C25D7.129.000000000000001e-114chrV 15,032,736contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
2C53B4.2C53B4.2n/achrIV 8,966,964contains similarity to Plasmodium vivax Sperm-specific protein Don juan, putative.; TR:A5K197
3Y38H8A.4Y38H8A.4n/achrIV 13,471,382contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
4spe-9C17D12.6n/achrI 11,584,385spe-9 encodes an EGF repeat-containing protein with a short intracellular domain; SPE-9 is required autonomously in sperm for fertilization, and by homology, likely mediates an adhesive or signaling event necessary for proper oocyte fertilization; spe-9 mRNA is detected solely in animals that are engaged in spermatogenesis; in spermatids, SPE-9 is found at or near the cell surface; following sperm activation, SPE-9 is found primarily on the pseudopod.
5clec-153F10F2.8n/achrIII 4,636,376C. elegans CLEC-153 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
6K11C4.1K11C4.1n/achrV 6,897,709contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
7F26D2.10F26D2.10n/achrV 16,427,124contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
8F41G3.5F41G3.5n/achrII 6,748,034contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
9srbc-67T24A6.10n/achrV 3,539,627C. elegans SRBC-67 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
10ZK484.7ZK484.7n/achrI 6,095,825contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
11C03B8.1C03B8.1n/achrIII 7,716,961
12C03B8.3C03B8.3n/achrIII 7,712,627
13C54D10.4C54D10.4n/achrV 12,420,859contains similarity to Interpro domain IPR008952 (Tetraspanin)
14F30F8.2F30F8.2n/achrI 7,829,032contains similarity to Pfam domains PF04960 (Glutaminase) , PF00023 (Ankyrin repeat) (3)contains similarity to Interpro domains IPR015868 (Glutaminase, core), IPR002110 (Ankyrin), IPR007043 (Glutaminase), IPR012338 (Beta-lactamase-type transpeptidase fold)
15B0207.7B0207.7n/achrI 5,946,551contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
16C52E4.7C52E4.7n/achrV 11,995,047C52E4.7 encodes a member of the histidine phosphatase superfamily orthologous to Bombyx mori ecdysteroid phosphate phosphatase (EPP), human STS1 (OMIM:609201) and human UBASH3A (OMIM:605736); C52E4.7 is also paralogous to C. elegans F09C12.8, F53B6.7, F55A11.11, and T07F12.1; while no explicit prediction has been made for C52E4.7's activity, it might be catalytically inactive; as loss of C52E4.7 activity results in no obvious defects, the precise role of C52E4.7 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
17Y53C10A.10Y53C10A.10n/achrI 12,024,518contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
18C06A1.3C06A1.3n/achrII 10,573,080contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
19M117.4M117.4n/achrIV 11,832,142contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
20F55D12.6F55D12.6n/achrI 7,902,571contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR001865 (Ribosomal protein S2), IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR001778 (Pollen allergen Poa pIX/Phl pVI, C-terminal)
21C09H10.9C09H10.9n/achrII 11,105,179
22B0511.11B0511.11n/achrI 10,649,379
23F20H11.4F20H11.4n/achrIII 6,609,417contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
24Y106G6D.4Y106G6D.4n/achrI 10,115,663contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
25ZK84.2ZK84.2n/achrII 6,015,055
26F38A5.8F38A5.8n/achrIV 6,600,170
27C32E12.1C32E12.1n/achrI 5,234,144contains similarity to Interpro domain IPR005819 (Histone H5)
28F26C11.1F26C11.1n/achrII 9,894,986contains similarity to Pfam domain PF00328 Histidine acid phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000560 (Histidine acid phosphatase)
29sri-66F28B1.6n/achrV 17,060,972C. elegans SRI-66 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30ZC262.4ZC262.4n/achrIII 8,333,867
31C37A2.3C37A2.3n/achrI 6,785,976contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
32fbxa-178F17A9.1n/achrV 6,116,834F17A9.1 encodes a divergent ONECUT class CUT homeobox protein with a single N-terminal cut domain; F17A9.1 has an atypical tyrosine residue at position 48 of its homeodomain rather than a phenylalanine or tryptophan residue; the cut domain may be a compact DNA-binding domain composed of alpha helices; phylogenetically, F17A9.1 is (somewhat distantly) affiliated with C17H12.9, Drosophila ONECUT, and mammalian HNF6 proteins; F17A9.1 has no obvious function in mass RNAi assays.
33C36H8.1C36H8.1n/achrIV 12,743,886contains similarity to Pfam domains PF03134 (TB2/DP1, HVA22 family) , PF00635 (MSP (Major sperm protein) domain) contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000535 (Major sperm protein), IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
34F54C8.1F54C8.1n/achrIII 9,440,304contains similarity to Pfam domains PF00725 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02737 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR008927 (6-phosphogluconate dehydrogenase, C-terminal-like), IPR006108 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, C-terminal), IPR013328 (Dehydrogenase, multihelical), IPR006176 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD binding), IPR006180 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR006036 (Potassium uptake protein TrkA)
35srsx-37M01B2.7n/achrV 15,258,341C. elegans SRSX-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
36D2062.6D2062.6n/achrII 2,619,582contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
37F07E5.4F07E5.4n/achrII 2,050,852
38W06D4.3W06D4.3n/achrI 9,059,663contains similarity to Pfam domain PF03114 BAR domain contains similarity to Interpro domain IPR004148 (BAR)
39C55C3.3C55C3.3n/achrIV 5,686,761contains similarity to Trypanosoma cruzi Trans-sialidase, putative.; TR:Q4E0H9
40F44G4.5F44G4.5n/achrII 8,999,996contains similarity to Anabaena sp Endopeptidase Clp ATP-binding chain B.; TR:Q8YM56
41clec-142K01C8.8n/achrII 8,279,792C. elegans CLEC-142 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
42spe-15F47G6.4n/achrI 1,456,004spe-15 encodes an unconventional myosin, and is homologous to both Drosophila and mouse myosin VI; spe-15 was identified in screens for mutants that have defective spermatogenesis; spe-15 is required during the terminal stages of spermatogenesis for the asymmetric partitioning of organelles like the mitochondria and for the proper partitioning of specialized structures called the fibrous-body membranous organelles into the spermatid; mutant spe-15 spermatids contain actin filaments in contrast to wild-type which lack them; spe-15 is also required for the proper morphology and activation of the spermatid; the human gene MYOSIN VI (MYO6; OMIM:600970), when mutated leads to disease that affects hearing.
43lips-2C04B4.3n/achrX 12,286,461C. elegans LIPS-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
44B0513.6B0513.6n/achrIV 13,855,821contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
45B0218.7B0218.7n/achrIV 8,165,316
46C26B2.2C26B2.2n/achrIV 8,021,582
47ssq-3ZC477.1n/achrIV 7,112,230C. elegans SSQ-3 protein; contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR006206 (Mevalonate and galactokinase), IPR001553 (RecA bacterial DNA recombination), IPR013286 (Annexin, type VII)
48F52F12.5F52F12.5n/achrI 9,921,559contains similarity to Homo sapiens Triadin; ENSEMBL:ENSP00000329278
49Y57G7A.5Y57G7A.5n/achrII 1,274,377
50H08M01.1H08M01.1n/achrIV 13,835,341contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR003071 (Orphan nuclear receptor, HMR type)