UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C09G1.4C09G1.40chrX 15,992,503contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
2C50F4.2C50F4.2n/achrV 9,533,151C50F4.2 encodes a putative 6-phosphofructokinase, paralogous to Y71H10A.1; C50F4.2 is required for fertility, full body size, and normally rapid growth in mass RNAi assays; C50F4.2 transcripts are enriched during spermatogenesis.
3F55H12.2F55H12.2n/achrI 8,868,112contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Tyrosine specific protein phosphatase)
4F10G7.6F10G7.6n/achrII 4,692,543contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
5M117.4M117.4n/achrIV 11,832,142contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
6C36H8.1C36H8.1n/achrIV 12,743,886contains similarity to Pfam domains PF03134 (TB2/DP1, HVA22 family) , PF00635 (MSP (Major sperm protein) domain) contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000535 (Major sperm protein), IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
7C55C3.3C55C3.3n/achrIV 5,686,761contains similarity to Trypanosoma cruzi Trans-sialidase, putative.; TR:Q4E0H9
8F59A7.9F59A7.9n/achrV 2,005,893contains similarity to Pfam domain PF00291 Pyridoxal-phosphate dependent enzyme contains similarity to Interpro domains IPR005856 (Cysteine synthase K/M), IPR001216 (Cysteine synthase/cystathionine beta-synthase P-phosphate-binding site), IPR005859 (Cysteine synthase A), IPR001926 (Pyridoxal phosphate-dependent enzyme, beta subunit), IPR016040 (NAD(P)-binding)
9Y106G6D.4Y106G6D.4n/achrI 10,115,663contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
10K07A1.4K07A1.4n/achrI 9,589,308contains similarity to Mycobacterium tuberculosis TcrZ protein (Fragment).; TR:Q50810
11F07F6.2F07F6.2n/achrII 5,430,880contains similarity to Homo sapiens 13 kDa protein; ENSEMBL:ENSP00000380244
12C28A5.6C28A5.6n/achrIII 4,426,610contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
13F14H12.3F14H12.3n/achrX 4,344,919contains similarity to Pfam domain PF00090 Thrombospondin type 1 domain contains similarity to Interpro domains IPR008085 (Thrombospondin, subtype 1), IPR000884 (Thrombospondin, type I)
14Y37D8A.8Y37D8A.8n/achrIII 12,867,161contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
15C31B8.8C31B8.8n/achrV 2,907,725contains similarity to Pfam domains PF01471 (Putative peptidoglycan binding domain) , PF00413 (Matrixin) , PF00045 (Hemopexin) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000585 (Hemopexin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR001818 (Peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin), IPR002477 (Peptidoglycan binding-like), IPR016293 (Peptidase M10A, matrix metallopeotidase)
16F47B7.4F47B7.4n/achrX 3,765,997contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
17C07G1.6C07G1.6n/achrIV 8,209,489
18H08M01.1H08M01.1n/achrIV 13,835,341contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR003071 (Orphan nuclear receptor, HMR type)
19F01D5.2F01D5.2n/achrII 13,998,627contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domains IPR001368 (TNFR/CD27/30/40/95 cysteine-rich region), IPR000480 (Glutelin), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
20K09F6.3K09F6.3n/achrII 2,258,704contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
21fbxb-36F07E5.6n/achrII 2,061,815C. elegans FBXB-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
22F22D6.9F22D6.9n/achrI 7,100,795contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
23C37A2.3C37A2.3n/achrI 6,785,976contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
24R01E6.5R01E6.5n/achrX 13,537,467contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
25C38C6.5C38C6.5n/achrII 14,631,497contains similarity to Interpro domain IPR001574 (Ribosome-inactivating protein)
26C53B4.2C53B4.2n/achrIV 8,966,964contains similarity to Plasmodium vivax Sperm-specific protein Don juan, putative.; TR:A5K197
27F53G12.8F53G12.8n/achrI 114,244contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
28ZK892.5ZK892.5n/achrII 10,008,728contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
29glo-4F07C3.4n/achrV 9,238,868glo-4 encodes a guanine nucleotide exchange factor (GEF) that is similar to Drosophila Claret and human RP3; throughout development, glo-4 activity is required for biogenesis of the lysosome-related gut granules; based upon phenotypic similarity, glo-4 is likely to encode a GEF for the GLO-1 Rab-like GTPase; in regulating gut granule formation, glo-4 acts downstream of apb-3, which encodes the AP-3 complex beta subunit.
30F07E5.4F07E5.4n/achrII 2,050,852
31B0280.11B0280.11n/achrIII 7,137,323contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
32F58F12.3F58F12.3n/achrII 6,390,234
33K11C4.2K11C4.2n/achrV 6,895,906contains similarity to Pfam domain PF03006 Haemolysin-III related contains similarity to Interpro domain IPR004254 (Hly-III related proteins)
34C06A1.3C06A1.3n/achrII 10,573,080contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
35acl-13F08G5.2n/achrIV 12,411,312C. elegans ACL-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01553 Acyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002123 (Phospholipid/glycerol acyltransferase)
36spe-15F47G6.4n/achrI 1,456,004spe-15 encodes an unconventional myosin, and is homologous to both Drosophila and mouse myosin VI; spe-15 was identified in screens for mutants that have defective spermatogenesis; spe-15 is required during the terminal stages of spermatogenesis for the asymmetric partitioning of organelles like the mitochondria and for the proper partitioning of specialized structures called the fibrous-body membranous organelles into the spermatid; mutant spe-15 spermatids contain actin filaments in contrast to wild-type which lack them; spe-15 is also required for the proper morphology and activation of the spermatid; the human gene MYOSIN VI (MYO6; OMIM:600970), when mutated leads to disease that affects hearing.
37C48E7.8C48E7.8n/achrI 6,267,364contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
38spe-9C17D12.6n/achrI 11,584,385spe-9 encodes an EGF repeat-containing protein with a short intracellular domain; SPE-9 is required autonomously in sperm for fertilization, and by homology, likely mediates an adhesive or signaling event necessary for proper oocyte fertilization; spe-9 mRNA is detected solely in animals that are engaged in spermatogenesis; in spermatids, SPE-9 is found at or near the cell surface; following sperm activation, SPE-9 is found primarily on the pseudopod.
39Y7A5A.8Y7A5A.8n/achrX 15,823,201contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IL30
40C33C12.4C33C12.4n/achrII 2,165,992
41B0207.7B0207.7n/achrI 5,946,551contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
42C34D4.3C34D4.3n/achrIV 7,153,905contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
43F42E8.1F42E8.1n/achrV 13,063,254contains similarity to Campylobacter jejuni DNA polymerase III alpha subunit (EC 2.7.7.7).; SW:DP3A_CAMJE
44tag-141C30H6.2n/achrIV 17,365,684tag-141/C30H6.2 encodes a putative zinc transporter orthologous to human SLC39A4 (OMIM:607059, mutated in acrodermatitis enteropathica).
45K11C4.1K11C4.1n/achrV 6,897,709contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
46ZC262.5ZC262.5n/achrIII 8,342,336contains similarity to Pfam domain PF04627 Mitochondrial ATP synthase epsilon chain contains similarity to Interpro domain IPR006721 (ATPase, F1 complex, epsilon subunit, mitochondrial)
47Y39A1A.14Y39A1A.14n/achrIII 10,649,949contains similarity to Pfam domain PF03587 Nep1 ribosome biogenesis protein contains similarity to Interpro domain IPR005304 (Suppressor Mra1)
48rnh-1.1ZK1290.6n/achrII 7,526,915C. elegans RNH-1.1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00075 RNase H contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold), IPR002156 (Ribonuclease H)
49Y106G6E.1Y106G6E.1n/achrI 10,199,352contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
50Y48A6B.8Y48A6B.8n/achrIII 11,028,225contains similarity to Interpro domains IPR003547 (Serine/threonine protein kinase, yersinia), IPR013022 (Xylose isomerase-like, TIM barrel)