Affine Alignment
 
Alignment between lin-46 (top R186.4 391aa) and lin-46 (bottom R186.4 391aa) score 37316

001 MSSSGLLKPATLDDVFQKLEDLCKLFPPQEKTVNVTSLKTGRILAEDIITEYDIPAQRTS 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MSSSGLLKPATLDDVFQKLEDLCKLFPPQEKTVNVTSLKTGRILAEDIITEYDIPAQRTS 060

061 IVDGFAIIVNQLGTKREIVGLSTAVTPYNAELISNECVRITIGGVVPDGADTVVPIENVA 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 IVDGFAIIVNQLGTKREIVGLSTAVTPYNAELISNECVRITIGGVVPDGADTVVPIENVA 120

121 LLKEEKCIEVLRKPKEGDNIREVGSEAKTGEILLKDGHHLDTMSITLLHALGISQVEIYK 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 LLKEEKCIEVLRKPKEGDNIREVGSEAKTGEILLKDGHHLDTMSITLLHALGISQVEIYK 180

181 KPRVCVLSIGSDLNSNKMYGSFNRSQLLELFQSQGFTAIDAGSSTEHITEVEEKIRTAAS 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 KPRVCVLSIGSDLNSNKMYGSFNRSQLLELFQSQGFTAIDAGSSTEHITEVEEKIRTAAS 240

241 FACVLVTVGGAQVIREVAKTLKFKFEIQDVDSTPGNFTVSTGKIDETPVVLSIFPEYHVS 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 FACVLVTVGGAQVIREVAKTLKFKFEIQDVDSTPGNFTVSTGKIDETPVVLSIFPEYHVS 300

301 SWIGANLFVSPILRAMEGQNSETSHRFKAELTQPISKTSETRFLRARSEVSKGNLISTPL 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 SWIGANLFVSPILRAMEGQNSETSHRFKAELTQPISKTSETRFLRARSEVSKGNLISTPL 360

361 GCEDIFGANSILEVKSNTCFSAGDVVDLRFA 391
    |||||||||||||||||||||||||||||||
361 GCEDIFGANSILEVKSNTCFSAGDVVDLRFA 391