UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ubxn-4ZK353.80chrIII 8,404,541C. elegans UBXN-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00789 UBX domain contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR001012 (UBX)
2T21B4.3T21B4.3n/achrII 12,495,897contains similarity to Pfam domain PF01681 C6 domain contains similarity to Interpro domain IPR002601 (Protein of unknown function C6)
3K10C2.6K10C2.6n/achrX 6,451,568
4C40A11.3C40A11.3n/achrII 2,142,086contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
5ddl-1F59E12.10n/achrII 5,647,512ddl-1 encodes a coiled-coil protein orthologous to vertebrate CCD53; loss of ddl-1 activity via RNAi results in a daf-16-dependent increase in lifespan.
6C09B8.4C09B8.4n/achrX 6,019,168contains similarity to Pfam domain PF05705 Eukaryotic protein of unknown function (DUF829) contains similarity to Interpro domain IPR008547 (Protein of unknown function DUF829, eukaryotic)
7irk-2M02A10.2n/achrX 706,700irk-2 encodes an inwardly rectifying potassium channel based on sequence homology to the the human potassium channel genes KCNJ1/KCNJ2.
8fbxa-199T06E6.3n/achrV 15,398,082srx-40 encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
9T06D8.2T06D8.2n/achrII 11,229,674contains similarity to Pfam domain PF02151 UvrB/uvrC motif contains similarity to Interpro domains IPR009055 (UvrB, C-terminal UvrC-binding), IPR001943 (UvrB/UvrC protein)
10taf-12Y56A3A.4n/achrIII 11,865,724taf-12 encodes a homolog of transcription initiation factor TFIID 20/15 kDa subunits (TAFII-20/TAFII-15) with a glutamine/asparagine-rich N-terminal domain and a a TFIID-like C-terminal domain.
11str-160ZK697.10n/achrV 1,735,727C. elegans STR-160 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
12H04M03.1H04M03.1n/achrIV 5,897,858contains similarity to Pfam domain PF00821 Phosphoenolpyruvate carboxykinase contains similarity to Interpro domains IPR013035 (Phosphoenolpyruvate carboxykinase, C-terminal), IPR008210 (Phosphoenolpyruvate carboxykinase, N-terminal), IPR008209 (Phosphoenolpyruvate carboxykinase, GTP-utilising)
13Y48B6A.10Y48B6A.10n/achrII 14,215,677contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
14tsp-3Y39E4B.4n/achrIII 13,213,403C. elegans TSP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domain IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen)
15lgc-18T01H10.7n/achrX 12,126,727C. elegans LGC-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
16str-56T06C12.3n/achrV 15,873,145C. elegans STR-56 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003569 (Cytochrome c-type biogenesis protein CcbS)
17F41G3.2F41G3.2n/achrII 6,759,863
18mrt-2Y41C4A.14n/achrIII 11,748,489mrt-2 encodes a highly conserved DNA-damage checkpoint protein homologous to the RAD1 protein found in S. pombe, Drosophila, and mammals; MRT-2 interacts with HUS-1 and HPR-9, also conserved DNA-damage checkpoint proteins, and is required in the germline for maintaining chromosomal integrity; mrt-2 mutations result in a failure to induce apoptosis in response to DNA damage, progressive telomere loss, chromosome fusion, and aneuploidy, all leading eventually to germline immortality.
19mtx-1F39B2.11n/achrI 14,755,776C. elegans MTX-1 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017410 (Metaxin), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
20srx-42C06B3.11n/achrV 13,921,696C. elegans SRX-42 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
21F58A4.6F58A4.6n/achrIII 9,614,710contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein FLJ36688; ENSEMBL:ENSP00000256538
22R06C7.6R06C7.6n/achrI 7,246,472contains similarity to Mus musculus Uncharacterized protein C8orf32 homolog.; SW:Q80WB5
23F08G12.2F08G12.2n/achrX 11,298,812contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR001632 (G-protein, beta subunit), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
24fbxb-100Y63D3A.2n/achrI 14,093,529This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
25C27F2.7C27F2.7n/achrIII 4,982,522This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
26F42C5.6F42C5.6n/achrIV 7,308,755
27T25D1.3T25D1.3n/achrX 16,506,246This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
28F23B2.8F23B2.8n/achrIV 9,152,242contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
29T26G10.1T26G10.1n/achrIII 9,405,416contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) , PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR000629 (RNA helicase, ATP-dependent, DEAD-box, conserved site), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014014 (RNA helicase, DEAD-box type, Q motif), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
30F17E5.2F17E5.2n/achrX 12,396,800contains similarity to Pfam domains PF00153 (Mitochondrial carrier protein) (3), PF00036 (EF hand) (3)contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003842 (Vacuolating cytotoxin), IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR002167 (Graves disease carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
31bra-1F54B11.6n/achrX 13,598,994The bra-1 gene encodes a homolog of the human BMP receptor-associated molecule (BRAM1) that negatively regulates the DAF-1/DAF-7/DAF-14 TGF-beta signalling pathway.
32T14B4.9T14B4.9n/achrII 6,731,934contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
33F29D11.2F29D11.2n/achrI 7,637,136contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
34Y18D10A.1Y18D10A.1n/achrI 12,797,263contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000116 (High mobility group proteins HMG-I and HMG-Y), IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding)
35F10E7.6F10E7.6n/achrII 7,113,277
36C08B6.7C08B6.7n/achrV 10,132,247contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
37H14E04.1H14E04.1n/achrIII 2,404,160contains similarity to Pfam domains PF02353 (Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase) , PF08242 (Methyltransferase domain) , PF08241 (Methyltransferase domain) , PF01209 (ubiE/COQ5 methyltransferase family) contains similarity to Interpro domains IPR004033 (UbiE/COQ5 methyltransferase), IPR003333 (Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase), IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR013216 (Methyltransferase type 11)
38F09A5.2F09A5.2n/achrX 13,137,360contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
39C34C6.2C34C6.2n/achrII 8,681,696contains similarity to Homo sapiens KIAA1219; ENSEMBL:ENSP00000302059
40cyp-34A2T10H4.11n/achrV 15,290,031C. elegans CYP-34A2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
41ZC506.1ZC506.1n/achrX 9,961,782contains similarity to Pfam domains PF02225 (PA domain) , PF01532 (Glycosyl hydrolase family 47) contains similarity to Interpro domains IPR001382 (Glycoside hydrolase, family 47), IPR003137 (Protease-associated PA)
42T23E1.2T23E1.2n/achrIV 3,144,252
43srh-37R11G11.9n/achrV 511,858C. elegans SRH-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
44T14B4.2T14B4.2n/achrII 6,736,402contains similarity to Pfam domain PF01084 Ribosomal protein S18 contains similarity to Interpro domain IPR001648 (Ribosomal protein S18)
45C11D9.1C11D9.1n/achrI 4,424,085contains similarity to Pfam domain PF00621 RhoGEF domain contains similarity to Interpro domains IPR000219 (Dbl homology (DH) domain), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
46sdz-13F13E9.6n/achrIV 10,878,328C. elegans SDZ-13 protein ;
47F23A7.4F23A7.4n/achrX 16,212,627contains similarity to Mus musculus MKIAA0554 protein (Fragment).; TR:Q80TY0
48F54H12.2F54H12.2n/achrIII 7,965,139contains similarity to Interpro domain IPR000358 (Ribonucleotide reductase)
49ZK863.1ZK863.1n/achrV 12,169,192contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
50srj-32F07G11.5n/achrV 7,296,979C. elegans SRJ-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)