UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srh-182ZK228.50chrV 18,472,715C. elegans SRH-182 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3F25E2.3F25E2.3n/achrX 812,150contains similarity to Pfam domain PF02551 Acyl-CoA thioesterase contains similarity to Interpro domain IPR003703 (Acyl-CoA thioesterase)
4kin-30M01B2.1n/achrV 15,246,214kin-30 encodes a predicted tyrosine kinase; kin-30 is expressed during larval stages, but has not been detected in adults; the expression of kin-30 was experimentally verified by RT-PCR.
5tag-81T14G12.2n/achrX 3,730,613C. elegans TAG-81 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000727 (Target SNARE coiled-coil region)
6srj-57T03D3.14n/achrV 2,854,982C. elegans SRJ-57 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7Y70D2A.1Y70D2A.1n/achrX 14,922,327contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
8cyp-34A6B0213.11n/achrV 3,959,699C. elegans CYP-34A6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
9C44H9.4C44H9.4n/achrV 12,837,723contains similarity to Interpro domain IPR000839 (Porin, Oms28 type)
10F02D10.2F02D10.2n/achrX 13,463,605contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I256
11C31G12.3C31G12.3n/achrV 18,185,300contains similarity to Rhodopirellula baltica Probable polysaccharide export protein.; TR:Q7UYB3
12srj-49T03D3.12n/achrV 2,847,294C. elegans SRJ-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13egl-38C04G2.7n/achrIV 10,108,695The egl-38 gene encodes a Pax5 homolog.
14daf-11B0240.3n/achrV 11,721,848The daf-11 gene encodes a guanylate cyclase that affects dauer formation, chemotaxis, and axon formation; it is genetically upstream of daf-12 with respect to dauer larvae formation and is expressed in a subset of amphid neurons.
15C14A6.8C14A6.8n/achrV 18,170,317contains similarity to Gallus gallus Cellular tumor antigen p53 (Tumor suppressor p53).; SW:P53_CHICK
16C54E10.2C54E10.2n/achrV 18,829,031contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR001125 (Recoverin), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
17srt-9C50H11.5n/achrV 3,078,685C. elegans SRT-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
18fbxb-40M01D1.9n/achrII 1,049,413This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
19F35C8.8F35C8.8n/achrX 5,373,263
20srw-17T10H4.6n/achrV 15,276,192C. elegans SRW-17 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000190 (AT1 angiotensin II receptor), IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002259 (Delayed-early response protein/equilibrative nucleoside transporter)
21C31H5.1C31H5.1n/achrI 9,028,536contains similarity to Pfam domain PF06342 Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1057) contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR010463 (Protein of unknown function DUF1057, lipase putative)
22srbc-6C36C5.3n/achrV 3,170,772C. elegans SRBC-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
23srb-15C48B6.5n/achrI 6,899,186C. elegans SRB-15 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
24glb-8C26C6.7n/achrI 7,510,602glb-8 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays; glb-8 expression is induced by anoxia in a HIF-1 dependent manner, although it is also paradoxically upregulated in a hif-1 mutant background; glb-8 expression is downregulated in a daf-2(e1370) mutant background under normoxic conditions; glb-8 expression is lower in L3 larvae than in young adults or dauers.
25let-23ZK1067.1n/achrII 9,202,659let-23 encodes an EGF-receptor-family transmembrane tyrosine kinase that affects viability, inductive signaling during development of the vulva, male spicule formation, posterior development of the epidermis, ovulation and behavioral quiescience during lethargus; it is genetically upstream of the let-60/RAS pathway with respect to viability and vulval development, is upstream of phosopholipase C gamma with respect to fertility and quiesence, and is expressed in vulval precursor cells and the ALA neuron.
26puf-9W06B11.2n/achrX 5,843,741The puf-9 gene encodes a predicted RNA binding protein orthologous to Drosophila PUMILIO and human PUMILIO 2 (OMIM:607205); PUF-9 is required for normal locomotion and fluid balance, and is expressed primarily in somatic tissues; PUF-9 contains a glutamine/asparagine-rich domain.
27F47H4.2F47H4.2n/achrV 17,356,736This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
28str-102R08H2.13n/achrV 15,385,819C. elegans STR-102 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29srab-1C04F5.4n/achrV 5,101,092C. elegans SRAB-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02175 C.elegans integral membrane protein Srb contains similarity to Interpro domain IPR002184 (Serpentine beta receptor)
30srt-18R03H4.4n/achrV 9,015,000C. elegans SRT-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
31ZK892.6ZK892.6n/achrII 9,979,541contains similarity to Vibrio parahaemolyticus Hypothetical protein.; TR:Q87PB2
32abf-3F54B8.5n/achrV 15,817,602abf-3 encodes a homolog of the antibacterial factor ASABF from Ascaris suum; ABF-3 may play a role in innate immunity, though at present the only evidence for its having an antimicrobial humoral function is its sequence similarity.
33C39B10.5C39B10.5n/achrX 10,447,468contains similarity to Saccharomyces cerevisiae bZIP protein; transcription factor; SGD:YIR018W
34sri-24C41G6.11n/achrV 15,212,913C. elegans SRI-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35F15E11.4F15E11.4n/achrV 2,340,462contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
36F59A7.8F59A7.8n/achrV 2,010,108contains similarity to Pfam domains PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) , PF00176 (SNF2 family N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR000330 (SNF2-related), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
37F38A1.11F38A1.11n/achrIV 1,248,205contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
38M01B2.6M01B2.6n/achrV 15,242,739contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
39F09B12.5F09B12.5n/achrX 15,086,421contains similarity to Pfam domain PF00057 Low-density lipoprotein receptor domain class A contains similarity to Interpro domain IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich)
40F35E8.9F35E8.9n/achrV 15,916,920contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
41T27E7.6T27E7.6n/achrIV 14,541,148contains similarity to Interpro domains IPR000533 (Tropomyosin), IPR002291 (Phosphorylase kinase, gamma catalytic subunit)
42C44C10.7C44C10.7n/achrX 11,687,559contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
43srx-54Y102A5C.22n/achrV 16,975,937C. elegans SRX-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
44sos-1T28F12.3n/achrV 4,533,472The sos-1 gene, also known as let-341, encodes an ortholog of Son of sevenless, a guanine nucleotide exchange factor that affects viability, sex myoblast migration, vulval induction, and oogenesis; it acts genetically downstream of let-23 and upstream of let-60 with respect to vulval development.
45mif-1Y56A3A.3n/achrIII 11,848,712C. elegans MIF-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01187 Macrophage migration inhibitory factor (MIF) contains similarity to Interpro domains IPR014347 (Tautomerase), IPR001398 (Macrophage migration inhibitory factor)
46fbxa-57C29F9.10n/achrIII 106,751C. elegans FBXA-57 protein; contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001986 (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase, core), IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
47srxa-4F18E3.1n/achrV 7,421,068C. elegans SRXA-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domain IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
48C30E1.6C30E1.6n/achrX 16,916,238
49R106.2R106.2n/achrX 17,484,993contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
50srx-34T01C4.4n/achrV 7,119,646C. elegans SRX-34 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)