UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1his-13ZK131.71.0000000000000001e-71chrII 13,820,324his-13 encodes an H3 histone; his-13 is contained within the histone gene cluster HIS3.
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3his-9ZK131.31.0000000000000001e-71chrII 13,823,762his-9 encodes an H3 histone; by homology, HIS-9 is predicted to function as a nucleosome component required for packaging of DNA into chromatin; his-9 is a replication-dependent histone locus that resides in the HIS3 cluster on chromosome II.
4W04E12.7W04E12.7n/achrV 19,731,742contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
5F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
6F41C3.2F41C3.2n/achrII 4,750,882contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
7R12E2.14R12E2.14n/achrI 4,150,308contains similarity to Interpro domain IPR004051 (Potassium channel, voltage dependent, Kv1.4)
8nhr-130T01G6.8n/achrV 482,090C. elegans NHR-130 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
9C24B5.4C24B5.4n/achrV 9,196,537contains similarity to Pfam domain PF08925 Domain of Unknown Function (DUF1907) contains similarity to Interpro domain IPR015021 (Region of unknown function DUF1907)
10T22C1.11T22C1.11n/achrI 7,967,828contains similarity to Oryctolagus cuniculus Trichohyalin.; SW:P37709
11his-10ZK131.4n/achrII 13,823,128his-10 encodes an H4 histone.
12W09H1.5W09H1.5n/achrII 13,186,582contains similarity to Pfam domains PF00107 (Zinc-binding dehydrogenase) , PF08240 (Alcohol dehydrogenase GroES-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR013149 (Alcohol dehydrogenase, zinc-binding), IPR011032 (GroES-like), IPR013154 (Alcohol dehydrogenase GroES-like), IPR002085 (Alcohol dehydrogenase superfamily, zinc-containing), IPR016040 (NAD(P)-binding)
13F09C12.6F09C12.6n/achrII 5,117,137contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
14F49D11.6F49D11.6n/achrI 10,907,943contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
15C35D10.5C35D10.5n/achrIII 4,862,879contains similarity to Pfam domain PF03981 Ubiquinol-cytochrome C chaperone contains similarity to Interpro domain IPR007129 (Ubiquinol-cytochrome C chaperone)
16dos-2K10G6.2n/achrII 3,977,041C. elegans DOS-2 protein ;
17C09B7.2C09B7.2n/achrX 2,669,882
18T22B7.3T22B7.3n/achrX 5,648,750contains similarity to Pfam domain PF02274 Amidinotransferase contains similarity to Interpro domain IPR003198 (Amidinotransferase)
19fbxb-51K05F6.3n/achrII 1,552,094C. elegans FBXB-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
20his-26ZK131.1n/achrII 13,825,596his-26 encodes an H4 histone.
21hnd-1C44C10.8n/achrX 11,685,111hnd-1 encodes a Hand bHLH transcription factor required for normal viability, gonadogenesis, and posterior body morphology; HND-1 is required for the formation of both somatic gonadal precursors and primordial germ cells, but not for later gonadogenesis; HND-1 is expressed embryogenesis in embryonic mesodermal precursor cells generating (mostly) body wall muscle, in somatic gonad precursor cells, and in some unidentified head cells; the primary defect in hnd-1 mutants may be, nonautonomously, in mesodermal precursor cells; somatic gonad precursor cells are normally generated in hnd-1 mutants, but not maintained.
22clec-167F38A1.4n/achrIV 1,254,535C. elegans CLEC-167 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
23K10B4.3K10B4.3n/achrII 117,838contains similarity to Pfam domain PF00169 PH domain contains similarity to Interpro domains IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR016024 (Armadillo-type fold)
24R74.2R74.2n/achrIII 4,188,552contains similarity to Interpro domains IPR008376 (Synembryn), IPR002952 (Eggshell protein)
25K08B5.1K08B5.1n/achrX 16,560,293
26F59F5.7F59F5.7n/achrX 10,563,070contains similarity to Interpro domain IPR006609 (Region of unknown function DM13, Skeletor)
27his-56F54E12.3n/achrIV 11,338,648his-56 encodes an H4 histone.
28sdha-2C34B2.7n/achrI 10,684,469C. elegans SDHA-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF02910 (Fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein C-terminal domain) , PF00890 (FAD binding domain) , PF01266 (FAD dependent oxidoreductase) contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR006076 (FAD dependent oxidoreductase), IPR015939 (Fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like, C-terminal), IPR003952 (Fumarate reductase/succinate dehydrogenase, FAD-binding site), IPR011281 (Succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit), IPR004112 (Fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, C-terminal), IPR003953 (Fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal), IPR014006 (Succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
29T05B11.1T05B11.1n/achrV 7,750,009This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
30sri-1F36G9.8n/achrV 15,966,916C. elegans SRI-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002208 (SecY protein)
31mab-7ZC13.4n/achrX 895,155mab-7 encodes a protein with a hydrophobic type II transmembrane region at the N-terminus, an EGF-like motif, a ShKT motif and a long C-terminus; mab-7 is involved in morphogenesis of the male tail, specifically affecting the structural cells, neuronal processes and the hypodermal sheath of the sensory rays, as such, it affects mating in males; a mab-7 promoter-gfp construct is expressed in hypodermis, body seam, ray structural cells, and several neurons in the head and tail region.
32clx-1C50F7.2n/achrIV 7,735,511clx-1 encodes a protein that contains 23 copies of a 15 amino acid repeat, possibly derived from a collagen triplet; there is no transcript evidence for this locus.
33T22C8.6T22C8.6n/achrII 8,628,922contains similarity to Xenopus laevis Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2 homolog 1 (hnRNP A2(A)).; SW:RO21_XENLA
34C38D9.2C38D9.2n/achrV 17,568,988contains similarity to Interpro domain IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
35C33G3.6C33G3.6n/achrX 14,082,413contains similarity to Paramecium tetraurelia Chromosome undetermined scaffold_2, whole genome shotgun sequence.; TR:A0CJH0
36K10H10.4K10H10.4n/achrII 14,500,979contains similarity to Saccharomyces cerevisiae topoisomerase I; SGD:YOL006C
37his-57F54E12.5n/achrIV 11,340,574his-57 encodes an H2A histone.
38his-14ZK131.8n/achrII 13,819,690his-14 encodes an H4 histone.
39F33H2.8F33H2.8n/achrI 15,032,079contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IBJ6
40ptd-2F07C3.1n/achrV 9,252,223C. elegans PTD-2 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000731 (Sterol-sensing 5TM box), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit)
41sri-48ZC239.9n/achrII 3,200,257C. elegans SRI-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42kin-29F58H12.1n/achrX 2,848,198kin-29 encodes a serine/threonine kinase with significant homology in the kinase domain to the AMP-activated protein kinase (AMPK) and SNF1 kinases; the AMP-kinase cascade is activated by cellular stresses that deplete ATP; AMP-kinase is believed to protect the mammalian cell by 'switching off' ATP-consuming pathways like fatty acid synthesis, by phosphorylating key regulatory enzymes, and switching on alternative pathways for ATP generation; kin-29 is involved in regulating the expression of chemosensory receptors and entry into the daur pathway; kin-29 also affects body size via interaction with the Sma/Mab pathway and lifespan, with mutants exhibiting a smaller body size and increased life span; a functional KIN-29-GFP fusion protein is expressed in sensory neurons and many other cell types, and localizes to the cytoplasm; under conditions of cellular stress like heat shock and starvation, KIN-29-GFP translocates to the nucleus.
43F15E11.4F15E11.4n/achrV 2,340,462contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
44F39D8.3F39D8.3n/achrX 15,423,577contains similarity to Homo sapiens Sperm-specific thioredoxin; ENSEMBL:ENSP00000304908
45T19B10.5T19B10.5n/achrV 11,235,863T19B10.5 encodes a protein with partial similarity to human PERIAXIN (PRX; OMIM:605725), which when mutated leads to Dejerine-Sottas neuropathy.
46C25F6.1C25F6.1n/achrX 5,487,263
47hmit-1.2Y51A2D.5n/achrV 18,526,923hmit-1.2 encodes one of three C. elegans proton (H+)-dependent myo-inositol transporters; loss of hmit-1.2 activity via large-scale RNAi result in no obvious abnormalities but by homology, HMIT-1.2 is predicted to function as a plasma membrane protein required for the regulated uptake of myo-inositol and thus potentially for regulation of cell signaling and intracellular osmolarity.
48F59F4.1F59F4.1n/achrX 15,836,220contains similarity to Pfam domains PF01756 (Acyl-CoA oxidase) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) contains similarity to Interpro domains IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR012258 (Acyl-CoA oxidase), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR002655 (Acyl-CoA oxidase, C-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal)
49D1022.4D1022.4n/achrII 7,456,724contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
50B0205.10B0205.10n/achrI 10,709,574contains similarity to Interpro domains IPR000893 (Luteovirus ORF6 protein), IPR000694 (Proline-rich region)