UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1rgs-9ZC53.79e-138chrX 1,916,166C. elegans RGS-9 protein; contains similarity to Interpro domains IPR015905 (Isoleucyl-tRNA synthetase, class Ia, N-terminal), IPR016137 (Regulator of G protein signalling superfamily), IPR000342 (Regulator of G protein signalling)
2C31G12.1C31G12.1n/achrV 18,180,590contains similarity to Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus K1 glycoprotein (Fragment).; TR:Q9WHA1
3H04M03.3H04M03.3n/achrIV 5,892,434contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
4F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
5F54D10.7F54D10.7n/achrII 3,820,711contains similarity to Pfam domain PF00240 Ubiquitin family contains similarity to Interpro domain IPR000626 (Ubiquitin)
6F48C1.5F48C1.5n/achrI 5,317,876
7rgs-8.1F52D2.21.0000000000000001e-66chrX 1,953,014C. elegans RGS-8.1 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016137 (Regulator of G protein signalling superfamily), IPR000342 (Regulator of G protein signalling)
8E02H4.6E02H4.6n/achrX 14,251,350contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
9fbxa-170C36C9.3n/achrX 1,677,298This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
10F43G6.10F43G6.10n/achrII 11,809,738contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
11K03H1.7K03H1.7n/achrIII 9,947,654contains similarity to Saccharomyces cerevisiae major low affinity 55 kDa Centromere/microtubule binding protein; SGD:YLR175W
12B0416.4B0416.4n/achrX 9,279,335contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR000533 (Tropomyosin), IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR000956 (Stathmin), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
13cdc-25.3ZK637.11n/achrIII 8,917,082cdc-25.3 encodes a tyrosine phosphatase that is a member of the cell division cycle 25 (CDC25) family of cell cycle regulators that includes Schizosaccharomyces pombe CDC25 and Drosophila string; cdc-25.3 is one of four cdc-25 genes in C. elegans and while it is known to be expressed in hermaphrodites, the precise function of cdc-25.3 is not yet clear; cdc-25.3 may function redundantly with cdc-25.2 during embryonic development and redundantly with cdc-25.1, cdc-25.2, and emb-29 during meiosis.
14F31B9.3F31B9.3n/achrX 15,924,034contains similarity to Homo sapiens Similar to polymerase (RNA) III; ENSEMBL:ENSP00000334758
15F14D7.2F14D7.2n/achrV 14,292,817contains similarity to Homo sapiens Similar to Dentin sialophosphoprotein preproprotein; ENSEMBL:ENSP00000282478
16R04D3.4R04D3.4n/achrX 13,288,277contains similarity to Rattus norvegicus Copper-transporting ATPase 1 (EC 3.6.3.4) (Copper pump 1) (Menkessdisease-associated protein homolog).; SW:AT7A_RAT
17bra-2F23H11.1n/achrIII 911,744The bra-2 gene encodes a homolog of the human BMP receptor-associated molecule (BRAM1), paralogous to bra-1, that may act upon the SMA-6 TGF-beta signalling pathway
18C16A3.2C16A3.2n/achrIII 6,390,183contains similarity to Pfam domain PF00782 Dual specificity phosphatase, catalytic domain contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR000340 (Protein-tyrosine phosphatase, dual specificity)
19ZK643.2ZK643.2n/achrIII 8,957,012contains similarity to Pfam domain PF00383 Cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region contains similarity to Interpro domains IPR016192 (APOBEC/CMP deaminase, zinc-binding), IPR002125 (CMP/dCMP deaminase, zinc-binding), IPR016473 (dCMP deaminase), IPR016193 (Cytidine deaminase-like), IPR015517 (Cytidine deaminase)
20R04D3.2R04D3.2n/achrX 13,285,808contains similarity to Plasmodium falciparum Putative uncharacterized protein PFD0207c.; TR:Q8I1Y6
21F53F8.3F53F8.3n/achrV 20,684,555contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
22C17E7.4C17E7.4n/achrV 3,893,699
23C04B4.2C04B4.2n/achrX 12,284,223contains similarity to Interpro domain IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
24T19H5.4T19H5.4n/achrII 9,487,245contains similarity to Gallus gallus Homeobox prospero-like protein PROX1 (PROX 1).; SW:PRX1_CHICK
25F27C8.6F27C8.6n/achrIV 9,587,998F27C8.6 encodes a putative arylacetamide deacetylase and microsomal lipase; F27C8.6 is required for sperm to normally migrate towards a PUFA-based signal exuded by oocytes; F27C8.6(RNAi) hermaphrodites are infertile, both through aberrant loss of their own sperm and through failure of males to effectively inseminate them.
26F14D2.11F14D2.11n/achrII 3,341,568contains similarity to Pfam domain PF00240 Ubiquitin family contains similarity to Interpro domain IPR000626 (Ubiquitin)
27F08F3.6F08F3.6n/achrV 5,419,025This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
28W06D11.5W06D11.5n/achrX 12,300,631contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA1801; ENSEMBL:ENSP00000256007
29F31F6.3F31F6.3n/achrX 14,872,269F31F6.3 encodes a novel protein that is conserved in C. elegans; three other genes related to F31F6.3 are present in tandem on the X chromosome.
30K08E4.2K08E4.2n/achrIV 12,056,130contains similarity to Pfam domain PF08718 Glycolipid transfer protein (GLTP) contains similarity to Interpro domain IPR014830 (Glycolipid transfer protein, GLTP)
31nspc-9F42F12.1n/achrX 12,343,078C. elegans NSPC-9 protein ;
32F57A10.4F57A10.4n/achrV 15,769,845contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Alkaliphily related protein.; TR:Q8EQ12
33F54F7.6F54F7.6n/achrX 11,866,107contains similarity to Homo sapiens Golgi autoantigen, golgin subfamily B member 1; ENSEMBL:ENSP00000315938
34F19H6.4F19H6.4n/achrX 12,366,324contains similarity to Pfam domain PF02544 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR013838 (Beta tubulin, autoregulation binding site), IPR001104 (3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase, C-terminal), IPR016636 (3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase)
35F02E8.4F02E8.4n/achrX 4,455,689
36T12G3.6T12G3.6n/achrIV 12,030,485contains similarity to Helicobacter pylori Hypothetical protein HP1128.; TR:O25753
37nhr-263F10G2.9n/achrV 7,341,043C. elegans NHR-263 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
38D1086.6D1086.6n/achrV 14,080,757contains similarity to Xenopus laevis Integumentary mucin C.1 (FIM-C.1) (Fragment).; SW:Q05049
39R53.6R53.6n/achrII 9,969,060contains similarity to Pfam domain PF03651 Partner of SLD five, PSF1 contains similarity to Interpro domain IPR005339 (GINS complex, Psf1 component)
40meg-1K02B9.1n/achrX 13,928,257meg-1 encodes a novel protein that localizes exclusively to P granules; originally identified by microarray analyses of germline-enriched transcripts, loss of meg-1 activity via mutation and RNAi indicates that MEG-1 is required for germline development and normal levels of fertility; specifically, MEG-1 is required maternally for normal germ cell proliferation and/or survival and for fully normal P granule segregation to the germ cell lineage; in regulating germline development, meg-1 likely functions redundantly with meg-2 and mes-1; meg-1 expression in the proximal germline is positively regulated by MPK-1, the C. elegans MAP kinase ortholog; meg-1 mRNA is expressed in the proximal germline; MEG-1 localizes to P granules from the 4-to-8-cell through 100-cell stage of embryogenesis; MEG-1 localization to P granules partially requires MES-1 and, in turn, MES-1 localization to P granules is partly dependent on MEG-1.
41C13A2.9C13A2.9n/achrV 7,263,287contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
42F40F11.3F40F11.3n/achrIV 11,592,569contains similarity to Saccharomyces cerevisiae involved intracellular protein transport, coiled-coil protein necessary for protein transport from ER to Golgi; SGD:YDL058W
43meg-2K02B9.2n/achrX 13,924,518meg-2 encodes a novel protein that localizes exclusively to P granules; originally identified by microarray analyses of germline-enriched transcripts, loss of meg-2 activity by itself results in no obvious abnormalities, but loss of meg-2 activity in meg-1 mutant animals indicates that meg-1 and meg-2 likely have redundant functions in germline development; meg-2 may also function redundantly with mes-1; meg-2 expression in the proximal germline is positively regulated by MPK-1, the C. elegans MAP kinase ortholog; a GFP::MEG-2 fusion protein localizes exclusively to P granules in the embryonic germ cell lineage.
44mxl-1T19B10.11n/achrV 11,245,345mxl-1 encodes a basic helix-loop-helix protein similar to the vertebrate MAX transcriptional regulators; in vitro, MXL-1 can heterodimerize, and bind an E-box DNA sequence, with MDL-1, a C. elegans MAD-like bHLH protein; mxl-1::gfp reporter fusions are expressed in the posterior intestine and in head and tail neurons.
45F01F1.11F01F1.11n/achrIII 5,870,989
46ZK380.2ZK380.2n/achrX 1,633,167contains similarity to Interpro domain IPR011072 (HR1 rho-binding repeat)
47F32D1.6F32D1.6n/achrV 4,374,245
48C02B10.2C02B10.2n/achrIV 5,090,651contains similarity to Homo sapiens SNARE-associated protein Snapin; ENSEMBL:ENSP00000357674
49C50E3.13C50E3.13n/achrV 7,623,254
50F10E9.5F10E9.5n/achrIII 8,307,934contains similarity to Homo sapiens 29 kDa protein; ENSEMBL:ENSP00000381398