UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Y75B8A.11Y75B8A.111e-109chrIII 12,188,150contains similarity to Lymnaea stagnalis Neuropeptide Y precursor.; TR:Q9U0S9
2fkh-5F26A1.2n/achrIII 4,845,567fkh-5 encodes a member of the forkhead domain transcription factor family.
3T15D6.9T15D6.9n/achrI 12,392,786contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
4ugt-54T25B9.7n/achrIV 10,763,022C. elegans UGT-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domains IPR002416 (Bacterial general secretion pathway protein H), IPR001546 (Pheromone A receptor), IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
5nhr-150C06B8.1n/achrV 15,480,433C. elegans NHR-150 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
6srbc-54F54B8.11n/achrV 15,833,053C. elegans SRBC-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
7W03G9.7W03G9.7n/achrI 4,988,180contains similarity to Methanocaldococcus jannaschii Chromosome partition protein smc homolog.; SW:Q59037
8glt-4T22E5.2n/achrX 6,405,125glt-4 encodes an ortholog of glutamate/aspartate and neutral amino acid transporters.
9lin-31K10G6.1n/achrII 3,984,762lin-31 encodes a winged helix (WH)-like transcription factor that is a member of the HNF3/Forkhead family of DNA-binding proteins; LIN-31 acts as a tissue-specific effector of MAP kinase-mediated signaling in the vulva; when MAP kinase is inactive, LIN-31 forms a complex with LIN-1/Ets that inhibits vulval cell fates; upon MAP kinase activation (vulval induction), LIN-31 becomes phosphorylated, dissociates from LIN-1, and goes on to promote primary and secondary vulval cell fates; LIN-31 is expressed in the vulval precursor cells.
10nhr-136C13C4.3n/achrV 12,108,116C. elegans NHR-136 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
11ckr-1T23B3.4n/achrI 6,688,888T23B3.4 encodes a seven transmembrane receptor that is most closely related to the mammalian cholecystokinin receptors; loss of T23B3.4 activity via RNAi, either singly or in combination with another cholecystokinin receptor-encoding gene, Y39A3B.5, has no effect on fat metabolism, however large-scale RNAi screens have reported that T23B3.4(RNAi) results in embryonic lethality and reduced brood sizes; a T23B3.4::GFP reporter is expressed in a subset of nerve ring neurons.
12T20D4.6T20D4.6n/achrV 3,411,676contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
13C05C12.6C05C12.6n/achrIV 11,232,367contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
14rrf-2M01G12.12n/achrI 12,102,320rrf-2 encodes an RNA-directed RNA polymerase (RdRP) homolog of unknown function; RRF-2 is not obviously required for either somatic or germline RNAi, or for transitive RNAi.
15Y51H1A.7Y51H1A.7n/achrII 13,897,024contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000783 (RNA polymerase, subunit H/Rpb5 C-terminal)
16C03E10.1C03E10.1n/achrV 11,291,855contains similarity to Anopheles quadrimaculatus NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 (EC 1.6.5.3).; SW:NU4M_ANOQU
17srbc-24C45H4.10n/achrV 2,152,386C. elegans SRBC-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
18sri-20AC3.1n/achrV 10,369,184C. elegans SRI-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19C08F1.8C08F1.8n/achrII 1,806,228
20srab-25ZK697.7n/achrV 1,740,043C. elegans SRAB-25 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF03125 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
21Y62H9A.3Y62H9A.3n/achrX 11,879,462contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000480 (Glutelin)
22clec-214C50E3.1n/achrV 7,611,567C. elegans CLEC-214 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like)
23srx-122F35F10.8n/achrV 3,296,984C. elegans SRX-122 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
24clec-34T25E12.8n/achrV 16,736,555C. elegans CLEC-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
25K10B4.4K10B4.4n/achrII 124,170contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR005390 (Neuromedin U receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
26srd-48F17A2.9n/achrX 12,336,853C. elegans SRD-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27F55D1.2F55D1.2n/achrX 5,488,910
28ZK682.7ZK682.7n/achrV 9,291,373
29C50B8.3C50B8.3n/achrV 13,567,762contains similarity to Pfam domain PF08547 Complex I intermediate-associated protein 30 (CIA30) contains similarity to Interpro domain IPR013857 (NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30)
30ace-2Y44E3A.2n/achrI 3,304,491An acetylcholineesterase involved in the termination of cholinergic nerve transmission; it is predominantly expressed in motoneurons.
31sra-28F18C5.6n/achrII 6,572,192C. elegans SRA-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
32str-12B0391.4n/achrV 15,611,921C. elegans STR-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33srz-96Y68A4A.6n/achrV 17,200,545C. elegans SRZ-96 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000418 (Ets)
34ZC482.7ZC482.7n/achrIII 12,752,251contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
35sre-5B0212.2n/achrIV 3,566,503C. elegans SRE-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
36pbs-6C02F5.9n/achrIII 8,243,577The pbs-6 gene encodes a homolog of mammalian PSMB1.
37C01G5.7C01G5.7n/achrIV 6,518,588
38C47F8.5C47F8.5n/achrI 12,322,989contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
39hlh-10ZK682.4n/achrV 9,281,043C. elegans HLH-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
40F11D11.4F11D11.4n/achrV 18,762,417contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
41sre-45F54F11.3n/achrII 13,520,326C. elegans SRE-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
42F47B8.1F47B8.1n/achrV 14,314,024
43nhr-156C17E7.1n/achrV 3,906,529C. elegans NHR-156 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type)
44K09E2.2K09E2.2n/achrX 8,677,297
45nkat-1F28H6.3n/achrX 14,139,007nkat-1 encodes kynurenine aminotransferase III, an ortholog of mammalian KAT3; nkat-1(RNAi) animals have no obvious phenotype.
46F54G2.2F54G2.2n/achrX 2,636,226contains similarity to Pfam domain PF00098 Zinc knuckle contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001969 (Peptidase aspartic, active site), IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
47acy-1F17C8.1n/achrIII 4,726,505The acy-1 gene encodes a protein with 40% identity to mammalian adenylyl cyclases, most closely related to the divergent mouse isoform type IX, that affects viability, muscle contraction, locomotion, and molting; it acts genetically downstream of gsa-1 and is expressed in excitable cells.
48C46H11.3C46H11.3n/achrI 5,041,773contains similarity to Pfam domain PF04699 ARP2/3 complex 16 kDa subunit (p16-Arc) contains similarity to Interpro domains IPR006789 (ARP2/3 complex 16 kDa subunit (p16-Arc)), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site)
49E02H4.5E02H4.5n/achrX 14,254,507contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IBC6
50T16G1.5T16G1.5n/achrV 12,938,559contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)