UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1clec-243Y68A4B.11.0000000000000001e-93chrV 17,248,138C. elegans CLEC-243 protein; contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domains IPR002921 (Lipase, class 3), IPR008262 (Lipase, active site)
2B0212.1B0212.1n/achrIV 3,575,057contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
3T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
4Y38H6C.9Y38H6C.9n/achrV 20,516,299contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
5F45F2.6F45F2.6n/achrV 8,527,305contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
6nhr-126F44C8.10n/achrV 2,230,032nhr-126 encodes a member of the nuclear hormone receptor family.
7M03C11.6M03C11.6n/achrIII 10,422,780contains similarity to Brachydanio rerio SI:bZ1G13.2 (ORF1 of novel LINE element with similarities to gagsproteins ).; TR:Q804R5
8F19B10.1F19B10.1n/achrII 3,683,855contains similarity to Gallus gallus Neurofilament medium polypeptide (NF-M) (Neurofilament triplet Msprotein) (160 kDa neurofilament protein).; SW:P16053
9fbxa-135T06E6.5n/achrV 15,402,649This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
10F47B10.4F47B10.4n/achrX 10,891,428contains similarity to Cyanophage P60 Thioredoxin C3.; TR:Q8W710
11C36C5.4C36C5.4n/achrV 3,167,003contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
12srz-48F20E11.1n/achrV 17,459,315C. elegans SRZ-48 protein ;
13F45E6.3F45E6.3n/achrX 12,488,021contains similarity to Pfam domain PF00566 TBC domain contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
14srt-30R08F11.2n/achrV 3,799,527C. elegans SRT-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
15C50H2.5C50H2.5n/achrV 9,919,252contains similarity to Interpro domains IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
16W01C9.2W01C9.2n/achrII 8,537,366contains similarity to Chlamydia pneumoniae Probable serine/threonine-protein kinase 1 (EC 2.7.1.37).; SW:PKN1_CHLPN
17F42A9.9F42A9.9n/achrIV 8,638,434
18ttx-3C40H5.5n/achrX 11,766,841ttx-3 encodes a LIM homeodomain protein required for functions of the interneuron AIY, including thermosensory behavior and olfactory learning.
19E03H4.3E03H4.3n/achrI 12,406,224contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
20K06A1.1K06A1.1n/achrII 6,455,658K06A1.1 encodes an AP-2-like transcription factor.
21dhs-27C04F6.5n/achrX 3,415,914dhs-27 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
22sre-22F36D1.2n/achrI 11,284,373C. elegans SRE-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
23M01G12.10M01G12.10n/achrI 12,119,338contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0477; ENSEMBL:ENSP00000316434
24sre-51C50E10.10n/achrII 12,312,675C. elegans SRE-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
25cyp-25A5F42A6.4n/achrIV 3,328,559C. elegans CYP-25A5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
26K10H10.9K10H10.9n/achrII 14,514,333contains similarity to Vibrio vulnificus Conserved hypothetical protein.; TR:Q8D6Y7
27T28C6.7T28C6.7n/achrIV 8,828,801contains similarity to Interpro domain IPR009055 (UvrB, C-terminal UvrC-binding)
28igcm-2SSSD1.1n/achrX 6,382,121igcm-2 encodes a protein containing immunoglobulin and fibronectin repeats; igcm-2 promoter::gfp fusions are expressed in the PVT interneuron, in some head neurons, and in the pharynx and intestine.
29F16G10.4F16G10.4n/achrII 2,369,673contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domains IPR003326 (Protein of unknown function DUF130), IPR002371 (Flagellar hook-associated protein)
30sru-40R07B5.3n/achrV 9,833,347C. elegans SRU-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
31lgc-48C50B6.11n/achrV 13,341,367C. elegans LGC-48 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
32K02A2.5K02A2.5n/achrII 7,411,491
33F10E7.2F10E7.2n/achrII 7,123,253contains similarity to Schistocerca gregaria Homeobox protein abdominal-A homolog (Fragment).; SW:P29556
34T22D1.2T22D1.2n/achrIV 6,922,337contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000480 (Glutelin), IPR013286 (Annexin, type VII)
35osm-10T20H4.1n/achrIII 7,244,451osm-10 encodes a novel protein conserved amongst several Caenorhabditis species; osm-10 activity is required for normal osmosensory signaling in the ASH sensory neuron; in regulating ASH-mediated osmosensation, osm-10 interacts genetically with eos-1 and eos-2; OSM-10 is expressed in the ASH, ASI, PHA, and PHB sensory neurons beginning just prior to hatching and continuing through larval and adult stages; OSM-10 localizes to cell bodies, sensory processes, and axons.
36T21B6.4T21B6.4n/achrX 10,934,829contains similarity to Interpro domain IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site)
37Y106G6H.4Y106G6H.4n/achrI 10,437,301contains similarity to Interpro domain IPR006578 (MADF)
38T24D5.4T24D5.4n/achrX 12,597,224contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
39srw-35T08G3.10n/achrV 16,472,391C. elegans SRW-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
40Y62H9A.14Y62H9A.14n/achrX 11,922,107contains similarity to Interpro domain IPR009010 (Aspartate decarboxylase-like fold)
41nhr-220T19H12.8n/achrV 4,883,423C. elegans NHR-220 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
42R119.2R119.2n/achrI 370,004contains similarity to Pfam domain PF00557 metallopeptidase family M24 contains similarity to Interpro domains IPR000994 (Peptidase M24, catalytic core), IPR001714 (Peptidase M24, methionine aminopeptidase)
43T08G5.8T08G5.8n/achrV 14,048,191contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
44nhr-182F41B5.9n/achrV 2,258,611C. elegans NHR-182 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
45lact-7C40H5.4n/achrX 11,762,779lact-7 encodes a beta-lactamase domain-containing protein.
46srbc-25F40D4.6n/achrV 17,174,753C. elegans SRBC-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
47ifta-1C54G7.4n/achrX 5,549,123C. elegans IFTA-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR017233 (WD repeat protein 35), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
48M05B5.6M05B5.6n/achrI 7,184,379contains similarity to Homo sapiens Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1; ENSEMBL:ENSP00000262209
49nhr-251ZK488.4n/achrV 601,466C. elegans NHR-251 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
50srx-2R03H4.2n/achrV 9,010,093C. elegans SRX-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)