UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y26G10.1Y26G10.18.000000000000001e-163chrV 17,694,131contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF07974 (EGF-like domain) (3)contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR001774 (Delta/Serrate/lag-2 (DSL) protein), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR015919 (Cadherin-like), IPR011050 (Pectin lyase fold/virulence factor), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR006626 (Parallel beta-helix repeat), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR002126 (Cadherin), IPR013111 (EGF, extracellular)
2srw-43F14F8.5n/achrV 16,686,204C. elegans SRW-43 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
3str-151T03E6.1n/achrV 16,577,135C. elegans STR-151 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4F56C4.1F56C4.1n/achrIV 10,638,106contains similarity to Brachydanio rerio D121 protein (Fragment).; TR:Q90ZG9
5ZC15.5ZC15.5n/achrV 20,294,125contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
6ZK896.4ZK896.4n/achrIV 12,881,875contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
7F15E6.9F15E6.9n/achrIV 4,296,304
8C36C5.15C36C5.15n/achrV 3,168,358contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
9F23H11.6F23H11.6n/achrIII 914,468
10C54G4.4C54G4.4n/achrI 7,999,947contains similarity to Pfam domain PF00084 Sushi domain (SCR repeat) contains similarity to Interpro domains IPR002396 (Selectin (CD62E/L/P antigen)), IPR006585 (Fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016060 (Complement control module), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
11C39H7.4C39H7.4n/achrIV 5,613,304
12clec-27Y102A5B.1n/achrV 16,855,370C. elegans CLEC-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
13snt-2F42G9.7n/achrIII 789,889C. elegans SNT-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR001565 (Synaptotagmin), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
14cgt-2F20B4.6n/achrX 17,698,401C. elegans CGT-2 protein ; contains similarity to Drosophila pseudoobscura GA19592-PA (Fragment).; TR:Q28XN6
15nhr-156C17E7.1n/achrV 3,906,529C. elegans NHR-156 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type)
16tag-117C01B7.4n/achrV 8,794,107C. elegans TAG-117 protein; contains similarity to Pfam domains PF00018 (SH3 domain) , PF00625 (Guanylate kinase) , PF07653 (Variant SH3 domain) , PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) contains similarity to Interpro domains IPR011511 (Variant SH3), IPR008144 (Guanylate kinase), IPR008145 (Guanylate kinase/L-type calcium channel region), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF), IPR001452 (Src homology-3)
17R11D1.2R11D1.2n/achrV 12,709,668contains similarity to Pfam domain PF00646 F-box domain contains similarity to Interpro domain IPR001810 (Cyclin-like F-box)
18nspb-2F38A5.12n/achrIV 6,591,852C. elegans NSPB-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF07312 Protein of unknown function (DUF1459) contains similarity to Interpro domain IPR009924 (Protein of unknown function DUF1459)
19srh-145F26D2.4n/achrV 16,411,251C. elegans SRH-145 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
20str-248C55A1.3n/achrV 15,628,858C. elegans STR-248 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21F23A7.3F23A7.3n/achrX 16,221,101contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Endocytosis protein end4 (SLA2 protein homolog).; SW:Q9P6L5
22sre-5B0212.2n/achrIV 3,566,503C. elegans SRE-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
23ncx-5Y32F6B.2n/achrV 10,488,232ncx-5 encodes a putative 4Na[+]/1Ca[2+],1K[+] exchanger, orthologous to human SLC24A1-5 and paralogous to NCX-4; NCX-5 is predicted to export free cytoplasmic Ca[2+] with low affinity but high capacity, being complemented by low-capacity/high-affinity Ca[2+] ATPase pumps such as MCA-1/-3; NCX-5 has tandem Calx-alpha domains predicted to carry out ion transport; NCX-5 has no obvious function in mass RNAi assays.
24T05G5.5T05G5.5n/achrIII 9,750,414contains similarity to Pfam domain PF01121 Dephospho-CoA kinase contains similarity to Interpro domains IPR000764 (Uridine kinase), IPR001977 (Dephospho-CoA kinase)
25srd-28M01B2.2n/achrV 15,251,113C. elegans SRD-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
26srd-5T19E7.5n/achrIV 5,673,565C. elegans SRD-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR004268 (Virulence factor MVIN-like)
27ZK563.2ZK563.2n/achrX 3,371,077contains similarity to Pfam domain PF02690 Na+/Pi-cotransporter contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR003841 (Na+/Pi-cotransporter)
28his-25ZK131.2n/achrII 13,824,963his-25 encodes an H3 histone.
29K02F6.4K02F6.4n/achrII 2,541,208contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
30T01G6.1T01G6.1n/achrV 498,392contains similarity to Pfam domains PF01370 (NAD dependent epimerase/dehydratase family) , PF00106 (short chain dehydrogenase) contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR001509 (NAD-dependent epimerase/dehydratase), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
31Y62H9A.9Y62H9A.9n/achrX 11,896,785contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I659
32twk-33W06D12.5n/achrV 17,712,140C. elegans TWK-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
33lin-31K10G6.1n/achrII 3,984,762lin-31 encodes a winged helix (WH)-like transcription factor that is a member of the HNF3/Forkhead family of DNA-binding proteins; LIN-31 acts as a tissue-specific effector of MAP kinase-mediated signaling in the vulva; when MAP kinase is inactive, LIN-31 forms a complex with LIN-1/Ets that inhibits vulval cell fates; upon MAP kinase activation (vulval induction), LIN-31 becomes phosphorylated, dissociates from LIN-1, and goes on to promote primary and secondary vulval cell fates; LIN-31 is expressed in the vulval precursor cells.
34C10A4.5C10A4.5n/achrX 7,394,900
35pha-2M6.3n/achrX 635,373pha-2 encodes a homeodomain protein that is orthologous to vertebrate Hex proteins required for the development of B lymphocytes and organs derived from foregut endoderm; in C. elegans, pha-2 is essential for proper development and morphogenesis of the pm5 pharyngeal muscles cells during late stages of embryogenesis; in regulating pm5 fate specification, PHA-2 appears to act downstream of the organ identity factor PHA-4, and upstream of ceh-22, whose expression it may negatively regulate in pm5; a rescuing PHA-2::GFP reporter is expressed in pharyngeal cells, intestinal-rectal cells, and postembryonic head neurons.
36F59B10.6F59B10.6n/achrII 10,523,795contains similarity to Prochlorococcus marinus Possible paralytic/GBP/PSP peptide precursor.; TR:Q7TUU1
37F14E5.1F14E5.1n/achrII 8,418,639contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005829 (Sugar transporter, conserved site), IPR005828 (General substrate transporter), IPR003663 (Sugar transporter), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
38W04A4.4W04A4.4n/achrI 13,676,809contains similarity to Pfam domain PF00648 Calpain family cysteine protease contains similarity to Interpro domain IPR001300 (Peptidase C2, calpain)
39str-92F59A1.3n/achrV 17,675,766C. elegans STR-92 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40R07B1.8R07B1.8n/achrX 9,871,676
41F25H2.2F25H2.2n/achrI 10,544,713contains similarity to Pfam domains PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) , PF00787 (PX domain) contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR001683 (Phox-like), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
42M162.6M162.6n/achrV 19,782,521contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
43Y38H6A.2Y38H6A.2n/achrV 20,325,833contains similarity to Chlamydia pneumoniae Hypothetical protein CPn0168.; TR:Q9Z916
44fbxa-214Y38A10A.4n/achrV 6,068,922This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
45nhr-197K06B4.7n/achrV 15,688,881C. elegans NHR-197 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
46T15B7.10T15B7.10n/achrV 6,811,130contains similarity to Ostreococcus tauri Predicted CDS, putative cytoplasmic protein family member, with ascoiled coil-4 domain, of ancient origin (ISS).; TR:Q010X5
47K02E10.5K02E10.5n/achrX 2,477,930
48srt-65C03A7.10n/achrV 5,171,907C. elegans SRT-65 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
49T26C11.3T26C11.3n/achrX 1,838,587
50F35F10.13F35F10.13n/achrV 3,318,633contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)