UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1W06G6.1W06G6.10chrV 16,625,961contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3K06A1.3K06A1.3n/achrII 6,442,625contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
4F19B2.7F19B2.7n/achrV 20,150,407contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
5T28B4.2T28B4.2n/achrX 6,582,753
6F41C6.7F41C6.7n/achrX 6,883,839contains similarity to Pfam domain PF01545 Cation efflux family contains similarity to Interpro domain IPR002524 (Cation efflux protein)
7sre-42Y57A10B.4n/achrII 12,385,670C. elegans SRE-42 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR001356 (Homeobox)
8nhr-272T07C5.2n/achrX 12,704,012C. elegans NHR-272 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
9srd-31F07C4.8n/achrV 7,634,059C. elegans SRD-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10tag-336Y69H2.12n/achrV 18,653,219C. elegans TAG-336 protein; contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (7), PF00858 (Amiloride-sensitive sodium channel) , PF07974 (EGF-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
11tag-312C33D12.6n/achrX 3,057,313C. elegans TAG-312 protein; contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF00036 (EF hand) (2), PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR002041 (Ran GTPase), IPR011992 (EF-Hand type), IPR006687 (GTP-binding protein SAR1), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR013753 (Ras), IPR006689 (ARF/SAR superfamily), IPR001854 (Ribosomal protein L29)
12dhc-1T21E12.4n/achrI 4,394,384dhc-1 encodes a cytoplasmic dynein heavy chain homolog required in one-cell embryos for pronuclear migration, centrosome separation, centrosome proximity to the male pronucleus, and mitotic spindle orientation, suggesting that DHC-1 helps position the microtubule organizing center; DHC-1 genetically interacts with SPD-5, a coiled-coil centrosomal protein.
13nas-32T02B11.7n/achrV 897,042C. elegans NAS-32 protein; contains similarity to Pfam domains PF01549 (ShK domain-like) , PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
14srd-63F13A7.2n/achrV 16,393,128C. elegans SRD-63 protein ;
15F45H7.1F45H7.1n/achrIII 3,346,522contains similarity to Mus musculus Sphingosine kinase 2 (EC 2.7.1.-) (SK 2) (SPK 2).; SW:SPH2_MOUSE
16srx-35T01C4.5n/achrV 7,121,587C. elegans SRX-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
17T07H6.5T07H6.5n/achrX 6,288,966contains similarity to Pfam domain PF00084 Sushi domain (SCR repeat) contains similarity to Interpro domains IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR016060 (Complement control module)
18gpa-15M04C7.1n/achrI 8,533,150gpa-15 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ADL, ASH, ASK, PHA, PHB, the distal tip cell, the anchor cell, and many male-specific neurons.
19ZK228.3ZK228.3n/achrV 18,459,731contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
20str-96T10H4.2n/achrV 15,293,203C. elegans STR-96 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21Y57A10C.9Y57A10C.9n/achrII 12,434,642contains similarity to Nitrosomonas europaea Possible ABC transport permease.; TR:Q82XY6
22R53.5R53.5n/achrII 9,969,980contains similarity to Interpro domain IPR012336 (Thioredoxin-like fold)
23C29F4.3C29F4.3n/achrIV 11,222,963contains similarity to Spodoptera litura nucleopolyhedrovirus Hypothetical protein.; TR:Q91BF2
24F40G12.2F40G12.2n/achrV 14,260,215contains similarity to Interpro domain IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site)
25Y6B3B.3Y6B3B.3n/achrI 13,716,143contains similarity to Interpro domain IPR010133 ()
26fbxa-102K03D7.7n/achrV 17,492,710This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
27M01G12.14M01G12.14n/achrI 12,107,675contains similarity to Rhizobium meliloti Putative transposase of insertion sequence ISRM19 protein (Putativestransposase for insertion sequence ISRM19).; TR:Q925Y0
28ZK867.2ZK867.2n/achrX 7,208,303
29Y62H9A.1Y62H9A.1n/achrX 11,876,371contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30srbc-56F54B8.12n/achrV 15,831,110C. elegans SRBC-56 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
31R07H5.10R07H5.10n/achrIV 11,214,469contains similarity to Pfam domain PF07716 Basic region leucine zipper contains similarity to Interpro domains IPR011700 (Basic leucine zipper), IPR004827 (Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor)
32srj-39F38H12.1n/achrV 4,105,406C. elegans SRJ-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33clec-241F49H6.2n/achrV 17,012,698C. elegans CLEC-241 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
34ZC132.5ZC132.5n/achrV 4,306,648contains similarity to Pfam domain PF05380 Pao retrotransposon peptidase contains similarity to Interpro domains IPR008042 (Retrotransposon, Pao), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
35K07H8.8K07H8.8n/achrIV 8,267,574contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
36BE10.3BE10.3n/achrIII 12,810,237contains similarity to Pfam domain PF06542 Protein of unknown function (DUF1114) contains similarity to Interpro domain IPR009497 (Protein of unknown function DUF1114)
37F35D11.1F35D11.1n/achrII 4,627,370
38ZK1010.6ZK1010.6n/achrIII 12,989,808contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domain IPR002593 (Protein of unknown function DX)
39F55G11.1F55G11.1n/achrIV 12,945,773contains similarity to Magnetospirillum magnetotacticum MagA protein.; TR:Q8GRF6
40srh-212T22F3.6n/achrV 3,596,155C. elegans SRH-212 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001463 (Sodium:alanine symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41F13A7.7F13A7.7n/achrV 16,382,944contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Nucleolar protein that binds nuclear localization sequences, required for pre-rRNA processing and ribosome biogenesis; SGD:YGR159C
42T08B6.1T08B6.1n/achrIV 4,887,059
43ZC101.1ZC101.1n/achrII 14,679,682The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
44F02C9.2F02C9.2n/achrV 3,135,542contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domains IPR005049 (Protein of unknown function DUF288), IPR002972 (Prostaglandin D synthase)
45clec-156F26A1.11n/achrIII 4,842,010C. elegans CLEC-156 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
46srh-277K05D4.6n/achrV 16,186,134C. elegans SRH-277 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001280 (Photosystem I psaA and psaB)
47ZK892.4ZK892.4n/achrII 10,007,287ZK892.4 is orthologous to the human gene ALPHA-METHYLACYL-CoA RACEMASE (AMACR; OMIM:604489), which when mutated leads to AMACR deficiency.
48srh-186F36G9.2n/achrV 15,956,387C. elegans SRH-186 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49tpi-1Y17G7B.7n/achrII 12,038,108tpi-1 encodes a putative triosephosphate isomerase orthologous to human TPI1 (OMIM:190450, mutated in TPI deficiency) and Drosophila WASTED AWAY; despite the severity of TPI mutant phenotypes in humans and Drosophila, TPI-1 has no obvious function in mass RNAi assays.
50Y44F5A.1Y44F5A.1n/achrIII 4,246,236contains similarity to Interpro domains IPR017422 (WD repeat protein 55), IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)