UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1W03H9.1W03H9.10chrII 14,148,639contains similarity to Pfam domain PF06918 Protein of unknown function (DUF1280) contains similarity to Interpro domain IPR009689 (Protein of unknown function DUF1280)
2C31H1.7C31H1.7n/achrIV 5,809,426
3C41D11.3C41D11.3n/achrI 4,430,732contains similarity to Interpro domain IPR001041 (Ferredoxin)
4srh-236Y68A4A.9n/achrV 17,211,345C. elegans SRH-236 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5C25D7.9C25D7.9n/achrV 15,065,202
6srg-62C24B9.12n/achrV 2,741,420C. elegans SRG-62 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
7srw-14C41G6.8n/achrV 15,226,687C. elegans SRW-14 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000975 (Interleukin-1)
8str-77W06D12.4n/achrV 17,720,087C. elegans STR-77 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9sri-39F33H12.2n/achrII 2,588,572C. elegans SRI-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10F46A8.6F46A8.6n/achrI 11,244,411contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
11sre-32W05H5.7n/achrII 12,455,773C. elegans SRE-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000293 (Channel forming colicin, C-terminal cytotoxic)
12F20E11.7F20E11.7n/achrV 17,465,622contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domains IPR005098 (Protein of unknown function DUF281), IPR006662 (Thioredoxin-related)
13amt-3M195.3n/achrII 8,366,108amt-3 encodes one of four C. elegans homologs of AMT1 (AT11_ARATH), a high-affinity ammonium transporter from Arabidopsis thaliana; AMT-3 is closely similar to its paralog AMT-2, with somewhat more distant paralogy to AMT-1 and AMT-4.
14F29A7.4F29A7.4n/achrII 2,750,080contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein C2orf32; ENSEMBL:ENSP00000263655
15str-181R11D1.6n/achrV 12,717,648C. elegans STR-181 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16F55C5.1F55C5.1n/achrV 12,263,644contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
17str-190C18B10.7n/achrV 7,477,853C. elegans STR-190 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18ric-19C32E8.7n/achrI 3,779,897The ric-19 gene encodes an evolutionarily conserved cytosolic protein involved in neuroendocrine secretion via association with secretory vesicles.
19F36H12.17F36H12.17n/achrIV 5,277,187
20srh-214T20B3.4n/achrV 16,828,966C. elegans SRH-214 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21C08B6.10C08B6.10n/achrV 10,126,265contains similarity to Interpro domains IPR006030 (Molluscan rhodopsin C-terminal tail), IPR000694 (Proline-rich region)
22ceh-27F46F3.1n/achrV 11,663,161ceh-27 encodes a homeodomain protein of the NK-2 class that contains Drosophila scarecrow and human NKX-2 (OMIM:606727); CEH-27 activity is essential for embryogenesis and appears to be required for maintaining hypodermal integrity during movement as embryos lacking CEH-27 burst at a breach in the ventral hypodermis upon commencement of muscle contractions; CEH-27 expression is first detected in the ~100-cell embryo in what appear to be MS-derived cells while in later embryos expression is seen in a number of cells in the anterior head region.
23str-14T08G3.2n/achrV 16,454,252C. elegans STR-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24K10B4.4K10B4.4n/achrII 124,170contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR005390 (Neuromedin U receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
25bath-33C08E3.3n/achrII 1,605,408C. elegans BATH-33 protein; contains similarity to Pfam domains PF00917 (MATH domain) , PF00651 (BTB/POZ domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
26F56H6.12F56H6.12n/achrI 12,313,605contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
27C23H4.4C23H4.4n/achrX 12,231,444contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR000062 (Thymidylate kinase), IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
28C31E10.5C31E10.5n/achrX 13,993,587contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q92614 Myosin XVIIIA; ENSEMBL:ENSP00000332202
29R02E4.1R02E4.1n/achrX 4,103,960
30C31B8.9C31B8.9n/achrV 2,912,083contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
31sra-28F18C5.6n/achrII 6,572,192C. elegans SRA-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
32T07D3.2T07D3.2n/achrII 902,779contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
33srt-36F47D2.5n/achrV 4,267,330C. elegans SRT-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
34srab-7C36C5.11n/achrV 3,154,327C. elegans SRAB-7 protein ;
35R07C3.8R07C3.8n/achrII 914,449
36C14C6.6C14C6.6n/achrV 546,947contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
37gnrr-7F13D2.3n/achrX 11,186,568C. elegans GNRR-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
38E02H4.2E02H4.2n/achrX 14,279,950contains similarity to Homo sapiens Type-1 protein phosphatase skeletal muscle glycogen targeting subunit; ENSEMBL:ENSP00000284601
39Y37D8A.3Y37D8A.3n/achrIII 12,833,196contains similarity to Methanosarcina mazei Conserved protein.; TR:Q8Q0P1
40K07G5.3K07G5.3n/achrI 7,163,733contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
41R12C12.4R12C12.4n/achrII 6,039,457
42Y75B8A.28Y75B8A.28n/achrIII 12,320,885contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Required for START A of cell cycle, and glucose and nitrogen repression of sporulation; SGD:YJL005W
43nhr-173C56E10.1n/achrX 6,657,606C. elegans NHR-173 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
44nhr-118F13A2.8n/achrV 4,408,904C. elegans NHR-118 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR000003 ()
45srbc-8C18B10.5n/achrV 7,484,197C. elegans SRBC-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
46K04F1.13K04F1.13n/achrV 1,652,895contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
47sre-41Y57A10B.5n/achrII 12,388,981C. elegans SRE-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
48C45E5.2C45E5.2n/achrIV 5,742,716contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
49F53A9.5F53A9.5n/achrX 8,699,785contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
50E02H4.5E02H4.5n/achrX 14,254,507contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IBC6