UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T24D5.1T24D5.16.000000000000001e-165chrX 12,575,561contains similarity to Melanoplus sanguinipes entomopoxvirus ORF MSV156 hypothetical protein.; TR:Q9YVT6
2C17B7.9C17B7.9n/achrV 3,331,512contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
3srt-25C16D9.7n/achrV 8,257,371C. elegans SRT-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
4str-31C54F6.10n/achrV 7,507,570C. elegans STR-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000539 (Frizzled protein)
5clec-45F07C4.2n/achrV 7,638,344C. elegans CLEC-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
6F08F3.1F08F3.1n/achrV 5,447,387
7C31A11.1C31A11.1n/achrV 16,294,149contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
8clec-58ZK666.3n/achrII 10,475,101C. elegans CLEC-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
9K06A9.2K06A9.2n/achrX 1,538,348This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
10K09C6.1K09C6.1n/achrV 860,591contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
11K04F1.6K04F1.6n/achrV 1,671,713contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
12F49D11.2F49D11.2n/achrI 10,922,443contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
13srg-14F26B1.6n/achrI 6,313,673C. elegans SRG-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
14kin-23W04G5.6n/achrI 11,641,436kin-23 encodes a predicted protein tyrosine kinase; like KIN-30, KIN-23 contains an unusual K to R substitution in kinase subdomain VII; kin-23 mRNA is expressed strongly during the L1/L2 larval stages, weakly in L3 and L4 stages, and at undetectable levels in adults.
15T22H2.2T22H2.2n/achrI 11,705,155contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
16aqp-6C32C4.2n/achrV 10,651,251apq-6 encodes an aquaporin whose expression in Xenopus oocytes increases water permeability five- to seven-fold; aqp-6 has no function in mass RNAi assays, perhaps reflecting genetic redundancy with its paralogs AQP-4 and AQP-5; AQP-6 is expressed in the cilia and cell bodies of IL1 sensory neurons; AQP-6 is orthologous to human AQP8 (OMIM:603750).
17F42A6.2F42A6.2n/achrIV 3,341,612
18str-150T03E6.4n/achrV 16,584,195C. elegans STR-150 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19M03D4.6M03D4.6n/achrIV 6,144,282contains similarity to Pfam domain PF02171 Piwi domain contains similarity to Interpro domains IPR003165 (Stem cell self-renewal protein Piwi), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
20srh-142T08G3.3n/achrV 16,460,149C. elegans SRH-142 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21npr-9ZK455.3n/achrX 11,330,259C. elegans NPR-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR001556 (Bombesin receptor), IPR009144 (Thyrotropin-releasing hormone receptor), IPR000586 (Somatostatin receptor), IPR000405 (Galanin receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
22nhr-216T09D3.4n/achrV 5,356,451C. elegans NHR-216 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
23clec-114C49A1.9n/achrI 14,233,796C. elegans CLEC-114 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold)
24srd-36R04D3.6n/achrX 13,294,014C. elegans SRD-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26C56G7.3C56G7.3n/achrIII 3,391,206contains similarity to Pfam domain PF04727 ELMO/CED-12 family contains similarity to Interpro domain IPR006816 (Engulfment and cell motility, ELM)
27K04F1.11K04F1.11n/achrV 1,660,979contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
28F31A9.1F31A9.1n/achrX 1,797,616
29srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30C18D1.2C18D1.2n/achrII 10,057,912contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
31Y17D7B.2Y17D7B.2n/achrV 18,788,749contains similarity to Xenopus laevis Phosphoinositide-3-kinase.; TR:Q8UUU2
32grl-8ZC487.5n/achrV 6,732,495grl-8 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
33T25E4.2T25E4.2n/achrII 5,581,240
34C17B7.3C17B7.3n/achrV 3,343,332contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
35clec-46F07C4.9n/achrV 7,637,516C. elegans CLEC-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
36F36H5.8F36H5.8n/achrII 1,749,990This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
37str-250C06B3.10n/achrV 13,919,315C. elegans STR-250 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38C30B5.5C30B5.5n/achrII 6,204,855contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR013806 (Kringle-like fold), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
39ZK896.1ZK896.1n/achrIV 12,874,056contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
40sro-1D1022.6n/achrII 7,461,799C. elegans SRO-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
41srb-17F01D4.7n/achrIV 10,455,510C. elegans SRB-17 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF03125 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
42F35D2.4F35D2.4n/achrII 7,581,981contains similarity to Interpro domain IPR009030 (Growth factor, receptor)
43F15G9.2F15G9.2n/achrX 9,713,365contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IAW6
44C03H5.7C03H5.7n/achrII 381,414contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR001958 (Tetracycline resistance protein, TetA)
45F44A2.7F44A2.7n/achrV 9,322,227
46F15G9.3F15G9.3n/achrX 9,710,815contains similarity to Plasmodium falciparum Prolyl-t-RNA synthase, putative (EC 6.1.1.15).; TR:Q8I2Q5
47aat-7F54D12.3n/achrII 1,389,233aat-7 encodes a predicted amino acid transporter catalytic subunit; unlike catalytic subunits in other organisms, however, AAT-7 does not contain the highly conserved cysteine residue known to facilitate covalent interaction with a glycoprotein subunit, suggesting that AAT-7 does not require this residue for heterodimer formation or alternatively, does not require the glycoprotein subunit for function.
48F28A10.8F28A10.8n/achrII 838,145contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
49K03A11.4K03A11.4n/achrX 13,080,030contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domains IPR004245 (Protein of unknown function DUF229), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
50T06C12.12T06C12.12n/achrV 15,892,264contains similarity to Pyrococcus horikoshii Hypothetical protein PH0933.; TR:O58684