UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T20D4.7T20D4.75e-80chrV 3,409,192contains similarity to Pfam domains PF08534 (Redoxin) , PF00578 (AhpC/TSA family) contains similarity to Interpro domains IPR011594 (Thioredoxin-like), IPR013740 (Redoxin), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR000866 (Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen), IPR006662 (Thioredoxin-related)
2ZK669.3ZK669.3n/achrII 7,941,811contains similarity to Pfam domain PF03227 Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) contains similarity to Interpro domain IPR004911 (Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase GILT)
3nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
4C04G6.5C04G6.5n/achrII 5,085,937contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
5F43G6.8F43G6.8n/achrII 11,813,118contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
6F56B6.6F56B6.6n/achrX 3,532,316contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
7Y57G11C.18Y57G11C.18n/achrIV 14,841,760contains similarity to Interpro domain IPR000767 (Disease resistance protein)
8C24F3.2C24F3.2n/achrIV 10,223,062contains similarity to Pfam domain PF00782 Dual specificity phosphatase, catalytic domain contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016278 (Tyrosine protein phosphatase, dual specificity, 12), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR000340 (Protein-tyrosine phosphatase, dual specificity)
9srz-54Y102A5C.25n/achrV 16,981,243C. elegans SRZ-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
10R03H4.5R03H4.5n/achrV 9,020,799contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
11ttr-15T07C4.5n/achrIII 10,338,481C. elegans TTR-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
12H12D21.3H12D21.3n/achrV 14,886,000contains similarity to Plasmodium cynomolgi Circumsporozoite protein precursor (CS).; SW:P08675
13K07C11.3K07C11.3n/achrV 8,207,597contains similarity to Interpro domains IPR008993 (TIMP-like, OB-fold), IPR001820 (Proteinase inhibitor I35, tissue inhibitor of metalloproteinase), IPR001134 (Netrin, C-terminal)
14srp-2C05E4.1n/achrV 763,702srp-2 encodes an ovalbumin-like serpin (ov-serpin) member of the serine protease inhibitor superfamily that is orthologous to human NEUROSERPIN (OMIM:602445, mutated in familial encephalopathy with neuroserpin inclusion bodies); SRP-2 is predicted to function as a suicide substrate that inhibits the proteolytic activity of serine proteases, and in vitro, recombinant SRP-2 is able to inhibit granzyme B activity; however, as loss of srp-2 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, the precise role of SRP-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; srp-2 expression is detected in hypodermal cells, particularly in the lateral seam cells.
15cyp-32A1C26F1.2n/achrV 7,783,180C. elegans CYP-32A1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR000897 (Signal recognition particle, SRP54 subunit, GTPase), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
16D2007.1D2007.1n/achrIII 8,155,633
17sru-39F46B6.11n/achrV 9,804,013C. elegans SRU-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
18ttr-37F21E9.3n/achrX 1,336,135C. elegans TTR-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
19Y51A2A.4Y51A2A.4n/achrV 18,291,106contains similarity to Haemophilus influenzae High-affinity zinc uptake system protein znuA precursor.; SW:ZNUA_HAEIN
20F17E9.2F17E9.2n/achrIV 8,356,187
21Y43F8B.9Y43F8B.9n/achrV 19,479,769
22R03H10.1R03H10.1n/achrII 4,181,882This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
23glc-1F11A5.10n/achrV 16,220,736glc-1 encodes the alpha subunit of a glutamate-gated chloride channel and forms a functional channel in Xenopus oocytes; mutations genetically interact with avr-14 and avr-15 mutations such that triple mutants exhibit high level resistance to ivermectin.
24Y40H7A.11Y40H7A.11n/achrIV 15,219,977contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
25F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
26C47D12.5C47D12.5n/achrII 11,685,843
27Y70G10A.3Y70G10A.3n/achrIII 10,241,665contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF03137 (Organic Anion Transporter Polypeptide (OATP) family) , PF07648 (Kazal-type serine protease inhibitor domain) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR004156 (Organic anion transporter polypeptide OATP), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter), IPR011497 (Protease inhibitor, Kazal-type)
28math-13C16C4.3n/achrII 1,876,599C. elegans MATH-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
29C42C1.2C42C1.2n/achrIV 12,266,886contains similarity to Pfam domain PF00481 Protein phosphatase 2C contains similarity to Interpro domains IPR001932 (Protein phosphatase 2C-related), IPR000222 (), IPR014045 (Protein phosphatase 2C, N-terminal), IPR015655 (Protein phosphatase 2C)
30B0252.1B0252.1n/achrII 6,921,631contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
31ttr-30T08A9.2n/achrX 7,331,455C. elegans TTR-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
32C50B6.1C50B6.1n/achrV 13,308,835contains similarity to Synechocystis sp Hypothetical protein slr1813.; TR:P73698
33F07G11.4F07G11.4n/achrV 7,293,758contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
34clec-249Y51A2A.7n/achrV 18,304,784C. elegans CLEC-249 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
35col-8F11H8.3n/achrIII 7,020,027col-8 encodes a collagen, individually dispensable for viability and gross morphology, which is specifically expressed in dauers and adults but not in eggs or L4 larvae, like col-7, col-18, and col-19; the amino- and carboxyl-terminal cysteine-rich regions of COL-8 are most closely related to those of COL-19, COL-35, and COL-39.
36E04F6.12E04F6.12n/achrII 7,217,217
37T23F4.3T23F4.3n/achrII 1,170,980contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
38F35C5.12F35C5.12n/achrII 12,912,321contains similarity to Interpro domain IPR003614 (Knottin)
39Y37D8A.21Y37D8A.21n/achrIII 12,929,839contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
40C01G6.4C01G6.4n/achrII 9,272,092contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
41grl-3K03B8.7n/achrV 11,411,850grl-3 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central low-complexity region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; GRL-3 is expressed in intestine, larval renal gland cells, and larval neurons; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
42ttr-19C12D8.4n/achrV 10,227,127C. elegans TTR-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
43R07B7.7R07B7.7n/achrV 12,072,671
44T28A11.3T28A11.3n/achrV 3,275,745contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
45M176.8M176.8n/achrII 9,437,409contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
46C50B8.1C50B8.1n/achrV 13,566,397contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
47W02G9.5W02G9.5n/achrV 2,659,404contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domain IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
48cyp-13A4T10B9.1n/achrII 9,796,716C. elegans CYP-13A4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
49nnt-1C15H9.1n/achrX 6,124,888nnt-1 encodes a proton-pumping nicotinamide nucleotide transhydrogenase predicted to be mitochondrial.
50ins-21M04D8.1n/achrIII 10,023,858ins-21 encodes an insulin-like peptide.