UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T11F1.8T11F1.80chrII 2,952,479contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
2srd-5T19E7.5n/achrIV 5,673,565C. elegans SRD-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR004268 (Virulence factor MVIN-like)
3F49C5.4F49C5.4n/achrII 12,539,002contains similarity to Pfam domain PF00069 (Eukaryotic protein kinase domain)
4cyp-33C2C45H4.17n/achrV 2,185,028C. elegans CYP-33C2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
5F52E10.2F52E10.2n/achrX 16,282,921contains similarity to Borrelia burgdorferi EppA.; TR:Q840B4
6F52D2.5F52D2.5n/achrX 1,974,154
7F18H3.1F18H3.1n/achrX 13,520,521contains similarity to Pfam domain PF00622 SPRY domain contains similarity to Interpro domains IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY)
8nhr-190F48G7.11n/achrV 641,845C. elegans NHR-190 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
9B0286.1B0286.1n/achrII 4,382,555contains similarity to Homo sapiens Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8; ENSEMBL:ENSP00000302239
10C04F5.2C04F5.2n/achrV 5,094,981
11K04H8.2K04H8.2n/achrI 14,254,220contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
12F22E5.12F22E5.12n/achrII 2,646,586contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
13C32B5.7C32B5.7n/achrII 962,400contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
14nhr-280C29F9.13n/achrIII 130,464C. elegans NHR-280 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
15H25K10.4H25K10.4n/achrIV 16,226,802contains similarity to Pseudomonas putida Hypothetical protein.; TR:Q8VMP3
16srh-295ZK1037.8n/achrV 15,331,670C. elegans SRH-295 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17F38B6.7F38B6.7n/achrX 6,697,033contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
18T25B6.1T25B6.1n/achrX 9,040,675
19srbc-82C31A11.4n/achrV 16,301,000C. elegans SRBC-82 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
20F21E9.6F21E9.6n/achrX 1,356,015
21F52F10.4F52F10.4n/achrV 1,544,140contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
22T06E8.2T06E8.2n/achrV 10,036,032
23twk-33W06D12.5n/achrV 17,712,140C. elegans TWK-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
24R06B9.2R06B9.2n/achrII 13,767,269contains similarity to Pfam domain PF00339 Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
25col-162Y2H9A.3n/achrV 13,442,665C. elegans COL-162 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR003979 (Tropoelastin), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
26str-238R09E12.4n/achrV 768,810C. elegans STR-238 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27str-14T08G3.2n/achrV 16,454,252C. elegans STR-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28T14G11.1T14G11.1n/achrX 2,690,488
29T07D3.5T07D3.5n/achrII 886,263contains similarity to Pfam domain PF06828 Fukutin-related contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR009644 (Fukutin-related)
30F56C4.1F56C4.1n/achrIV 10,638,106contains similarity to Brachydanio rerio D121 protein (Fragment).; TR:Q90ZG9
31Y49E10.25Y49E10.25n/achrIII 12,490,261contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
32K02A2.5K02A2.5n/achrII 7,411,491
33T20B12.5T20B12.5n/achrIII 7,366,839
34nhr-118F13A2.8n/achrV 4,408,904C. elegans NHR-118 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR000003 ()
35srj-38T02B11.5n/achrV 883,302C. elegans SRJ-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36srbc-8C18B10.5n/achrV 7,484,197C. elegans SRBC-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
37F29A7.8F29A7.8n/achrII 2,757,825contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
38nhr-276Y71A12C.1n/achrI 14,042,539C. elegans NHR-276 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
39Y62H9A.9Y62H9A.9n/achrX 11,896,785contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I659
40nhr-187F47C10.4n/achrV 3,861,996C. elegans NHR-187 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
41F48C1.3F48C1.3n/achrI 5,314,472
42K02F3.7K02F3.7n/achrIII 836,776
43lgc-1T05B4.1n/achrV 4,136,911C. elegans LGC-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
44ZK563.2ZK563.2n/achrX 3,371,077contains similarity to Pfam domain PF02690 Na+/Pi-cotransporter contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR003841 (Na+/Pi-cotransporter)
45srt-37F47D2.8n/achrV 4,280,809C. elegans SRT-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
46nhr-70Y51A2D.17n/achrV 18,618,286C. elegans NHR-70 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR002232 (5-Hydroxytryptamine 6 receptor)
47nhr-156C17E7.1n/achrV 3,906,529C. elegans NHR-156 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type)
48sri-39F33H12.2n/achrII 2,588,572C. elegans SRI-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49sru-40R07B5.3n/achrV 9,833,347C. elegans SRU-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
50srw-65Y38H6C.2n/achrV 20,497,408C. elegans SRW-65 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)