UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srw-16T10H4.50chrV 15,274,096C. elegans SRW-16 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR008365 (Prostanoid receptor)
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3C18E3.5C18E3.5n/achrI 4,198,275contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR001632 (G-protein, beta subunit), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
4K11G9.3K11G9.3n/achrV 6,670,893contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
5F43D2.3F43D2.3n/achrV 14,632,476contains similarity to Homo sapiens Orphan nuclear receptor NR1D1; ENSEMBL:ENSP00000246672
6M04D8.4M04D8.4n/achrIII 10,030,454contains similarity to Clostridium perfringens Hypothetical protein CPE0262.; TR:Q8XNS0
7xpa-1K07G5.2n/achrI 7,160,236xpa-1 encodes an ortholog of human XPA, the xeroderma pigmentosum complementation group A protein (OMIM:278700, mutations are associated with sensitivity to ultraviolet light and carcinomata at an early age); by homology, XPA-1 is predicted to function as a DNA-binding protein that is required for nucleotide excision repair of damaged DNA; in C. elegans, loss of xpa-1 activity via mutation or RNA-mediated interference (RNAi) results in increased sensitivity to UV irradiation at all stages of development; xpa-1 mRNA is detected in eggs and mixed stage populations.
8nhr-231Y17D7B.1n/achrV 18,792,886C. elegans NHR-231 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
9ZK593.8ZK593.8n/achrIV 10,938,663contains similarity to Pfam domains PF07719 (Tetratricopeptide repeat) , PF02661 (Fic protein family) contains similarity to Interpro domains IPR003812 (Filamentation induced by cAMP protein Fic), IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR013105 (Tetratricopeptide TPR2), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
10C18D4.3C18D4.3n/achrV 17,532,536contains similarity to Acetobacter diazotrophicus FixX.; TR:Q9FA07
11T01H10.8T01H10.8n/achrX 12,134,602T01H10.8 encodes a BEACH domain-containing protein that is orthologous to the mammalian lysosomal trafficking regulator LYST which when mutated leads to Chediak-Higashi syndrome (CHS, OMIM:606897).
12D1046.4D1046.4n/achrIV 8,935,680contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
13M18.6M18.6n/achrIV 12,122,042contains similarity to Interpro domain IPR003111 (Peptidase S16, lon N-terminal)
14ZK945.4ZK945.4n/achrII 10,104,330contains similarity to Pfam domains PF00621 (RhoGEF domain) , PF00169 (PH domain) contains similarity to Interpro domains IPR000219 (Dbl homology (DH) domain), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR015721 (Rho GTP exchange factor)
15nhr-102T06C12.6n/achrV 15,875,252nhr-102 encodes a nuclear receptor that is most highly conserved amongst nematode species.
16F28A10.7F28A10.7n/achrII 845,493contains similarity to Interpro domain IPR013090 (Phospholipase A2, active site)
17srh-104F21H7.7n/achrV 16,243,471C. elegans SRH-104 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18C45G9.2C45G9.2n/achrIII 5,069,704contains similarity to Pfam domain PF01207 Dihydrouridine synthase (Dus) contains similarity to Interpro domains IPR013785 (Aldolase-type TIM barrel), IPR003733 (Thiamine monophosphate synthase), IPR001269 (Dihydrouridine synthase, DuS)
19rab-10T23H2.5n/achrI 6,457,920rab-10 encodes a Rab-like GTPase that is a member of the Ras superfamily of small GTPases; rab-10 activity is required, upstream of rme-1, for basolateral endocytic recycling in the intestine, but not in oocytes or coelomocytes; a RAB-10::GFP fusion protein is widely expressed and in the intestine, localizes to endosomes and the Golgi.
20T28F2.1T28F2.1n/achrI 3,640,560contains similarity to Pfam domain PF01531 Glycosyl transferase family 11 contains similarity to Interpro domain IPR002516 (Glycosyl transferase, family 11)
21srh-244C03G6.9n/achrV 7,344,629C. elegans SRH-244 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22str-228C07G3.5n/achrV 3,511,106C. elegans STR-228 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23F14H3.4F14H3.4n/achrV 16,054,667contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
24M01E5.1M01E5.1n/achrI 13,275,251contains similarity to Ichthyophthirius multifiliis Immobilization antigen isoform.; TR:Q9BMH3
25C53C7.3C53C7.3n/achrX 13,049,643contains similarity to Triticum aestivum Alpha/beta-gliadin A-V precursor (Prolamin).; SW:GDA5_WHEAT
26clec-188M199.3n/achrIV 15,117,866C. elegans CLEC-188 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
27gly-17T15D6.3n/achrI 12,377,779gly-17 encodes a protein similar to 2/I N-acetylglucosaminyltransferase.
28srd-19F53F1.11n/achrV 13,428,164C. elegans SRD-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
29K07C5.2K07C5.2n/achrV 10,340,201contains similarity to Pfam domain PF00248 Aldo/keto reductase family contains similarity to Interpro domain IPR001395 (Aldo/keto reductase)
30E01G6.3E01G6.3n/achrX 12,243,099contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domains IPR002018 (Carboxylesterase, type B), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
31srw-77W06G6.80.0000005chrV 16,642,725C. elegans SRW-77 protein ;
32C04C3.7C04C3.7n/achrIV 3,433,232contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33K09D9.12K09D9.12n/achrV 4,003,740
34C25A1.12C25A1.12n/achrI 10,192,090contains similarity to Pfam domain PF00561 alpha/beta hydrolase fold contains similarity to Interpro domains IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR003089 (Alpha/beta hydrolase), IPR002410 (Peptidase S33, prolyl aminopeptidase)
35F27E5.5F27E5.5n/achrII 10,129,961contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
36R11G11.14R11G11.14n/achrV 522,961contains similarity to Pfam domains PF04083 (ab-hydrolase associated lipase region) , PF00561 (alpha/beta hydrolase fold) contains similarity to Interpro domains IPR006693 (AB-hydrolase associated lipase region), IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR008262 (Lipase, active site)
37str-108F10A3.13n/achrV 16,166,795C. elegans STR-108 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38fbxb-13C08F1.3n/achrII 1,789,688This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
39srx-88F43A11.1n/achrV 11,584,291C. elegans SRX-88 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
40str-165F55B12.6n/achrV 13,832,194C. elegans STR-165 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001358 (Neuropeptide Y2 receptor)
41F36F12.4F36F12.4n/achrV 2,089,002contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
42F54B11.7F54B11.7n/achrX 13,600,836contains similarity to Neurospora crassa GTP cyclohydrolase I (EC 3.5.4.16) (GTP-CH-I).; SW:GCH1_NEUCR
43lin-24B0001.1n/achrIV 12,132,269lin-24 was identified in screens for mutations that result in altered vulval cell lineages; lin-24 is defined by two alleles, the first of which, a partially dominant mutation, generally results in vulvaless animals, while the second, a non-null amber mutation that is also partially dominant, results in wild-type animals when homozygous, but vulvaless animals when heterozygous with a wild-type allele; morphological examination of lin-24 animals indicates that some of the Pn.p cells that normally make up the vulva undergo inappropriate cell death that is dependent upon the ced-2, ced-5, and ced-10 engulfment genes, but not on the ced-3 and ced-4 killing genes; the precise molecular identity of lin-24 has not yet been reported.
44VF39H2L.1VF39H2L.1n/achrI 8,645,323contains similarity to Pfam domain PF05739 SNARE domain contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR000727 (Target SNARE coiled-coil region)
45M04B2.2M04B2.2n/achrIV 11,529,284contains similarity to Pfam domains PF01170 (Putative RNA methylase family UPF0020) , PF02926 (THUMP domain) contains similarity to Interpro domains IPR004114 (THUMP), IPR001091 (Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-N4-specific)), IPR000241 (Putative RNA methylase)
46str-170T08B6.7n/achrIV 4,878,848C. elegans STR-170 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47ugt-32F47C10.6n/achrV 3,842,918C. elegans UGT-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
48Y59C2A.2Y59C2A.2n/achrII 2,201,637contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
49T27A3.6T27A3.6n/achrI 6,106,790T27A3.6 is orthologous to the human gene MOLYBDENUM COFACTOR BIOSYSTHESIS PROTEIN E (MOCS2; OMIM:603708), which when mutated leads to disease.
50M01G12.6M01G12.6n/achrI 12,120,129contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)