UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1str-45T09F5.30chrV 15,159,744C. elegans STR-45 protein ; contains similarity to Homo sapiens 42 kDa protein; VG:OTTHUMP00000169906
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3F26A10.1F26A10.1n/achrX 7,627,709
4ztf-11F52F12.6n/achrI 9,907,414C. elegans ZTF-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF01530 Zinc finger, C2HC type contains similarity to Interpro domain IPR002515 (Zinc finger, C2HC-type)
5srx-43T10C6.3n/achrV 16,018,889C. elegans SRX-43 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
6nlp-10F37A8.4n/achrIII 3,934,743nlp-10 encodes four predicted neuropeptide-like proteins; nlp-10 is part of a GGxY neuropeptide family that has members in several other nematode species; nlp-10 is expressed in a variety of neurons, including ASK, ADL, CAN, two lateral neurons, two anterior pharyngeal neurons, one tail neuron, and one male tail neuron; as loss of nlp-10 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of nlp-10-encoded peptides in development and/or behavior is not yet known.
7C32D5.1C32D5.1n/achrII 6,344,783
8F47E1.2F47E1.2n/achrX 9,059,694contains similarity to Pfam domain PF03137 Organic Anion Transporter Polypeptide (OATP) family contains similarity to Interpro domains IPR004156 (Organic anion transporter polypeptide OATP), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
9T27E7.6T27E7.6n/achrIV 14,541,148contains similarity to Interpro domains IPR000533 (Tropomyosin), IPR002291 (Phosphorylase kinase, gamma catalytic subunit)
10C50A2.3C50A2.3n/achrIV 1,148,209
11M03A1.3M03A1.3n/achrII 4,558,668M03A1.3 encodes a protein with ~10 predicted transmembrane sequences; it has an internal repeat (in residues 74-351 and 377-668), with some similarity in these repeated domains to worm C05D12.1 and C13B4.1, and to mammalian stromal cell derived factor receptor 2.
12pax-3F27E5.2n/achrII 10,149,568pax-3 encodes a divergent paired-like homeodomain protein that does not belong to the Q50, K50, or S50 classes; PAX-3 is required for locomotion and vulval development; pax-3(RNAi) animals have consistent Pvl and Unc phenotypes (as well as less consistent Bmd, Rup, and Stp phenotypes).
13C30B5.7C30B5.7n/achrII 6,225,999contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR003944 (Protease-activated receptor 4)
14Y11D7A.10Y11D7A.10n/achrIV 9,259,330contains similarity to Coniophora arida ATP synthase subunit 6 (EC 3.6.3.14) (ATP synthase A chain)s(Fragment).; TR:Q9XLN6
15srr-7T01G5.4n/achrV 15,129,054C. elegans SRR-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF03268 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF267 contains similarity to Interpro domain IPR004950 (Protein of unknown function DUF267, Caenorhabditis species)
16B0554.1B0554.1n/achrV 438,570
17F21D12.5F21D12.5n/achrII 7,329,535contains similarity to Pfam domain PF00292 'Paired box' domain contains similarity to Interpro domains IPR001523 (Paired box protein, N-terminal), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR009057 (Homeodomain-like)
18rcn-1F54E7.7n/achrIII 5,683,173rcn-1 encodes a calcipressin, which binds and inhibits calcineurin; RCN-1's orthologs include yeast Rcn1p and human DSCR1 (OMIM:602917; overexpressed in Down syndrome and Alzheimer disease); rcn-1 is expressed in hypodermal seam cells, various neurons, vulval epithelial and muscle cells, marginal pharyngeal cells, and in the male tail; rcn-1 transcription is regulated by TAX-6, and RCN-1 binds TAX-6 protein if free Ca[2+] is present; RCN-1 overexpression, like calcineurin deficiency, causes defects in body size, cuticle thickness, fertility, growth rate, and serotonin-resistance in egg-laying.
19F27C1.10F27C1.10n/achrI 5,435,347
20nhr-42C33G8.6n/achrV 6,999,694C. elegans NHR-42 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
21bbs-5R01H10.6n/achrIII 10,260,159C. elegans BBS-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF07289 Protein of unknown function (DUF1448) contains similarity to Interpro domains IPR006606 (Protein of unknown function DUF1448), IPR008162 (Inorganic pyrophosphatase), IPR014003 (Protein of unknown function DM16)
22R102.3R102.3n/achrIV 10,691,049contains similarity to Broad bean wilt virus 2 210kDa protein.; TR:Q9E933
23F53B7.2F53B7.2n/achrV 10,993,353F53B7.2 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that F53B7.2 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
24K09H11.6K09H11.6n/achrV 5,735,411
25cyp-13A3T10B9.5n/achrII 9,791,013C. elegans CYP-13A3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
26R07A4.4R07A4.4n/achrX 10,753,200contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
27C39B10.3C39B10.3n/achrX 10,443,924contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein involved in mating-type locus silencing, interacts with Sir2p; probably functions to recruit or stabilize Sir proteins; SGD:YDR363W
28twk-9ZK1251.8n/achrIV 9,695,064C. elegans TWK-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2)
29nhr-191F55D12.3n/achrI 7,896,919C. elegans NHR-191 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
30B0563.7B0563.7n/achrX 9,153,274contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR001125 (Recoverin), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin)), IPR000261 (EPS15 homology (EH))
31T16A9.3T16A9.3n/achrV 14,208,326contains similarity to Pfam domain PF06887 Protein of unknown function (DUF1265) contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR009676 (Protein of unknown function DUF1265)
32T22B2.1T22B2.1n/achrX 3,927,779contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
33clec-101F15D3.2n/achrI 11,562,502C. elegans CLEC-101 protein; contains similarity to Pfam domains PF00092 (von Willebrand factor type A domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
34duo-2F29C4.5n/achrIV 113,683C. elegans DUO-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00443 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase) , PF02338 (OTU-like cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR003323 (Ovarian tumour, otubain), IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
35C07A4.2C07A4.2n/achrX 10,173,174contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
36F21C10.4F21C10.4n/achrV 9,127,111contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
37ZK822.2ZK822.2n/achrIV 11,922,736contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
38F59D6.7F59D6.7n/achrV 3,038,633contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR008080 (Parvalbumin), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin))
39F20D6.2F20D6.2n/achrV 8,186,659contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
40R04E5.9R04E5.9n/achrX 8,808,513contains similarity to Homo sapiens Triadin; ENSEMBL:ENSP00000333984
41C49F8.1C49F8.1n/achrX 13,363,169contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Actin-binding protein of the cortical actin cytoskeleton, important for activation of the Arp2/3 complex that plays a key role actin in cytoskeleton organization; SGD:YCR088W
42M01B2.6M01B2.6n/achrV 15,242,739contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
43T03F1.7T03F1.7n/achrI 3,856,739contains similarity to Pfam domain PF00398 Ribosomal RNA adenine dimethylase contains similarity to Interpro domains IPR001737 (Ribosomal RNA adenine methylase transferase), IPR016861 (Mitochondrial dimethyladenosine transferase 2, mitochondrial precursor)
44aqp-5C35A5.1n/achrV 10,492,631aqp-5 encodes a putative aquaporin with no known substrate, since AQP-5 expressed in Xenopus oocytes has no effect on water, glycerol, or urea permeability; AQP-5 also has no function in mass RNAi assays, perhaps reflecting genetic redundancy with its paralogs AQP-4 and AQP-6; AQP-5 is expressed in I1 and I2 pharyngeal interneurons, and is orthologous to human AQP8 (OMIM:603750).
45eak-4F53B2.3n/achrIV 12,524,964eak-4 encodes a novel protein that contains an N-myristoylation signal; eak-4 acts in parallel to akt-1 to regulate insulin-like signaling and dauer formation; EAK-4 is expressed primarily in the neuroendocrine XXXL/R cells, where it associates with the plasma membrane.
46C37C3.10C37C3.10n/achrV 7,862,685
47Y44A6D.3Y44A6D.3n/achrV 20,786,983contains similarity to Interpro domain IPR009057 (Homeodomain-like)
48djr-1.2C49G7.11n/achrV 4,054,635C. elegans DJR-1.2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01965 DJ-1/PfpI family contains similarity to Interpro domains IPR006287 (DJ-1), IPR002818 (ThiJ/PfpI)
49F55C9.6F55C9.6n/achrV 19,295,191contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
50glt-5Y53C12A.2n/achrII 9,707,756glt-5 encodes an ortholog of glutamate/aspartate and neutral amino acid transporters.