UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1nhr-26T07C5.50chrX 12,696,713C. elegans NHR-26 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
2bra-2F23H11.1n/achrIII 911,744The bra-2 gene encodes a homolog of the human BMP receptor-associated molecule (BRAM1), paralogous to bra-1, that may act upon the SMA-6 TGF-beta signalling pathway
3C10G8.2C10G8.2n/achrV 5,314,980contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domain IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa)
4skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
5K10D6.3K10D6.3n/achrV 11,201,218contains similarity to Homo sapiens HMG-BOX transcription factor BBX; ENSEMBL:ENSP00000319742
6col-151AC3.6n/achrV 10,394,349C. elegans COL-151 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
7C18H2.4C18H2.4n/achrIII 7,697,463C18H2.4 is orthologous to the human gene GLOMULIN (FAP48; OMIM:601749), which when mutated leads to disease.
8R06A10.1R06A10.1n/achrI 1,087,211contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
9K06A1.3K06A1.3n/achrII 6,442,625contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
10T27A8.4T27A8.4n/achrX 16,067,184contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Involved in protein transport at multiple stages of the secretory pathway; SGD:YDR170C
11H05L14.1H05L14.1n/achrI 7,974,757contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
12T13F2.12T13F2.12n/achrIV 9,765,986contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
13C06G4.4C06G4.4n/achrIII 7,977,442
14F59A3.7F59A3.7n/achrI 5,517,931
15F22F4.4F22F4.4n/achrX 6,000,544
16F42A9.3F42A9.3n/achrIV 8,617,701
17C09D4.6C09D4.6n/achrI 5,486,821
18F59B2.5F59B2.5n/achrIII 9,001,107contains similarity to Pfam domain PF01399 PCI domain contains similarity to Interpro domains IPR013143 (PCI/PINT associated module), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR000717 (Proteasome component region PCI)
19ZK1086.3ZK1086.3n/achrX 13,791,278contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
20K02D10.2K02D10.2n/achrIII 8,770,897
21dsl-5F58B3.8n/achrIV 11,620,190dsl-5 encodes a putative secreted protein with single DSL and EGF domains in series, somewhat like Delta/LAG-2; DSL-5 belongs to a nematode-specific family of Delta/LAG-2-like proteins that includes DSL-1, -2, -3, -5, -6, and -7.
22Y37A1A.2Y37A1A.2n/achrIV 13,909,126contains similarity to Pfam domain PF05978 Eukaryotic protein of unknown function (DUF895) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
23his-67T23D8.5n/achrI 9,988,560his-67 encodes an H4 histone required for embryonic viability and growth.
24srz-45Y6G8.1n/achrV 17,593,282C. elegans SRZ-45 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
25T13C5.2T13C5.2n/achrX 6,186,424contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
26F54D1.1F54D1.1n/achrIV 11,262,424contains similarity to Interpro domain IPR004087 (K Homology)
27F56H1.5F56H1.5n/achrI 5,757,572F56H1.5 encodes a putative ATP/ADP-activated metallocarboxypeptidase that may function in vivo as an alpha-tubulin C-terminal tyrosine carboxypeptidase; F56H1.5 is orthologous to murine AGTPBP-1/Nna1/pcd (upregulated in damaged mouse spinal cord and mutated in Purkinje cell degeneration) and human AGTPBP1 (OMIM:606830); murine AGTPBP-1 is genetically required for tubulin carboxypeptidase activity in vivo, and F56H1.5's nearest paralog EEED8.6 has biochemical traits consistent with tubulin carboxypeptidase activity; F56H1.5 and its mammalian AGTPBP1 orthologs, along with other proteins, comprise a M14D3 peptidase subfamily.
28cpb-1C40H1.1n/achrIII 9,323,513cpb-1 encodes a cytoplasmic polyadenylation element binding (CPEB) protein homolog involved in two steps of spermatogenesis; two CPEB proteins have distinct functions in spermatogenesis, with FOG-1 specifying sperm cell fate, and CPB-1 conversely executing that decision, being required for progression through meiosis; cpb-1(RNAi) spermatocytes fail to undergo meiotic cell divisions; CPB-1 protein is present in the germ line just prior to overt spermatogenesis, but once sperm differentiation begins, CPB-1 disappears; CPB-1 physically interacts with EBF, which, like CPEB, regulates genes by binding the 3' UTRs of mRNAs; while CPB-1 is required for spermatogenesis, it is dispensable for oogenesis; this is in contrast to CPEBs in vertebrates (Xenopus), arthropods (Drosophila), and molluscs (Spisula), which all participate in oogenesis.
29K11H3.2K11H3.2n/achrIII 9,846,887contains similarity to Homo sapiens Uveal autoantigen; ENSEMBL:ENSP00000314556
30F46F5.10F46F5.10n/achrII 824,543contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
31F22B5.5F22B5.5n/achrII 8,453,880contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
32T24E12.10T24E12.10n/achrII 3,770,931contains similarity to Magnetococcus sp MJ0042 family finger-like protein.; TR:A0LDP7
33C02F5.2C02F5.2n/achrIII 8,249,732
34F55G11.1F55G11.1n/achrIV 12,945,773contains similarity to Magnetospirillum magnetotacticum MagA protein.; TR:Q8GRF6
35F14E5.3F14E5.3n/achrII 8,436,197contains similarity to Pfam domain PF00328 Histidine acid phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000560 (Histidine acid phosphatase)
36rnh-1.1ZK1290.6n/achrII 7,526,915C. elegans RNH-1.1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00075 RNase H contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold), IPR002156 (Ribonuclease H)
37ZK666.2ZK666.2n/achrII 10,471,714contains similarity to Homo sapiens ASH1; ENSEMBL:ENSP00000265206
38F55B11.4F55B11.4n/achrIV 14,430,213contains similarity to Interpro domain IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
39C27F2.6C27F2.6n/achrIII 4,980,070
40F46F5.1F46F5.1n/achrII 790,983
41F01F1.3F01F1.3n/achrIII 5,873,818
42T28D6.3T28D6.3n/achrIII 11,367,475contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein LCR14 precursor.; TR:P82729
43K02F6.3K02F6.3n/achrII 2,547,902contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
44R155.3R155.3n/achrIII 1,973,361contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR003016 (2-oxo acid dehydrogenase, lipoyl-binding site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
45lgc-51F12B6.3n/achrI 2,244,756C. elegans LGC-51 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002289 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, beta subunit), IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
46T03F6.4T03F6.4n/achrIII 13,387,131contains similarity to Pfam domain PF00646 F-box domain contains similarity to Interpro domain IPR001810 (Cyclin-like F-box)
47C40D2.4C40D2.4n/achrII 2,000,282contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
48C38C6.5C38C6.5n/achrII 14,631,497contains similarity to Interpro domain IPR001574 (Ribosome-inactivating protein)
49F44D12.7F44D12.7n/achrIV 10,035,774contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
50M03E7.3M03E7.3n/achrV 5,615,596