UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T05F1.5T05F1.50chrI 9,634,552contains similarity to Cyanidium caldarium Phycobilisome linker polypeptide (Anchor polypeptide) (PBS-anchorsprotein).; SW:APCE_CYACA
2T16A9.5T16A9.5n/achrV 14,214,256contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
3F36D3.4F36D3.4n/achrV 16,517,063contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR005819 (Histone H5)
4F36H12.3F36H12.3n/achrIV 5,273,494contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR005819 (Histone H5), IPR000533 (Tropomyosin)
5Y38H8A.3Y38H8A.3n/achrIV 13,473,210contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
6sfxn-1.2F37H8.4n/achrII 11,186,977C. elegans SFXN-1.2 protein; contains similarity to Pfam domain PF03820 Tricarboxylate carrier contains similarity to Interpro domain IPR004686 (Tricarboxylate/iron carrier)
7ZK507.1ZK507.1n/achrIII 9,100,387contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
8F32H2.7F32H2.7n/achrI 8,996,424contains similarity to Staphylococcus staphylolyticus Lysostaphin precursor (EC 3.4.24.75) (Glycyl-glycine endopeptidase).; SW:LSTP_STAST
9C24D10.2C24D10.2n/achrIV 5,163,991contains similarity to Interpro domain IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
10C25D7.1C25D7.1n/achrV 15,036,540contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
11C01G10.14C01G10.14n/achrV 15,105,627contains similarity to Pfam domain PF03147 Ferredoxin-fold anticodon binding domain contains similarity to Interpro domain IPR005121 (Phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit, ferrodoxin-fold anticodon-binding)
12Y37D8A.5Y37D8A.5n/achrIII 12,854,726contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
13ZK512.8ZK512.8n/achrIII 9,146,610contains similarity to Saccharomyces cerevisiae CDC5 is dispensable for premeiotic DNA synthesis and recombination, but required for tripartite synaptonemal complexes, haploidization, and spores; SGD:YMR001C
14C10G11.8C10G11.8n/achrI 6,272,876contains similarity to Pfam domain PF00004 ATPase family associated with various cellular activities (AAA) contains similarity to Interpro domains IPR003959 (AAA ATPase, core), IPR001270 (Chaperonin clpA/B), IPR003960 (AAA ATPase, conserved site), IPR005937 (26S proteasome subunit P45), IPR001957 (Bacterial chromosomal replication initiator protein, DnaA), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
15W06D4.2W06D4.2n/achrI 9,057,051contains similarity to Pyrobaculum aerophilum PaREP2b.; TR:Q8ZWN7
16R13H9.6R13H9.6n/achrIV 5,067,998contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
17K09E4.1K09E4.1n/achrII 14,138,852contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
18F36A2.11F36A2.11n/achrI 8,822,940contains similarity to Pyrococcus furiosus Hypothetical protein PF2017.; TR:Q8TZH6
19C15H7.3C15H7.3n/achrIII 9,651,090contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
20C55C3.4C55C3.4n/achrIV 5,677,163contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
21F36D1.4F36D1.4n/achrI 11,272,019contains similarity to Homo sapiens Splice isoform C-alpha of O95644 Nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic 1; SW:O95644
22F58E6.5F58E6.5n/achrV 9,753,985contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
23F38H4.4F38H4.4n/achrIV 11,849,205contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
24T23F6.3T23F6.3n/achrIV 12,723,822contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
25gsp-3W09C3.6n/achrI 4,710,013C. elegans GSP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
26C03C11.1C03C11.1n/achrI 10,015,075contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR002952 (Eggshell protein)
27R05D3.5R05D3.5n/achrIII 8,349,282
28F20D6.6F20D6.6n/achrV 8,160,713contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
29F53B6.4F53B6.4n/achrI 8,948,016contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
30F56F3.4F56F3.4n/achrIII 4,469,813contains similarity to Pfam domains PF00240 (Ubiquitin family) , PF01428 (AN1-like Zinc finger) contains similarity to Interpro domains IPR000058 (Zinc finger, AN1-type), IPR000626 (Ubiquitin)
31K06A5.3K06A5.3n/achrI 6,467,184contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
32Y106G6A.4Y106G6A.4n/achrI 9,931,412contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 3 of Q99963 SH3-containing GRB2-like protein 3; ENSEMBL:ENSP00000321799
33Y57A10B.7Y57A10B.7n/achrII 12,393,162contains similarity to Rattus norvegicus Merlin (Schwannomin) (Neurofibromin 2) (Fragment).; SW:MERL_RAT
34pph-2C29E6.3n/achrIV 11,876,957C. elegans PPH-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
35K05F1.9K05F1.9n/achrII 5,800,592contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
36Y44A6D.5Y44A6D.5n/achrV 20,797,500contains similarity to Pfam domain PF01063 Aminotransferase class IV contains similarity to Interpro domains IPR001544 (Aminotransferase, class IV), IPR005786 (Branched-chain amino acid aminotransferase II)
37M05B5.1M05B5.1n/achrI 7,178,689contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
38T23B3.5T23B3.5n/achrI 6,705,973contains similarity to Interpro domains IPR003993 (Treacher Collins syndrome, treacle), IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
39ZC262.1ZC262.1n/achrIII 8,341,087
40K05F1.3K05F1.3n/achrII 5,795,290contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
41ZK637.12ZK637.12n/achrIII 8,924,673contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, highly expressed in the mutants lacking the telomerase component TLC1; potentially phosphorylated by Cdc28p; SGD:YDR545W
42Y57G11A.2Y57G11A.2n/achrIV 14,518,253contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
43rmd-3B0491.3n/achrII 11,338,942C. elegans RMD-3 protein ; contains similarity to Dictyostelium discoideum Putative uncharacterized protein.; TR:Q54XR4
44F07A5.2F07A5.2n/achrI 7,353,071contains similarity to Homo sapiens Isoform 2 of Serine/arginine repetitive matrix protein 2; ENSEMBL:ENSP00000371738
45C04G2.5C04G2.52e-21chrIV 10,094,710contains similarity to Arabidopsis thaliana Putative auxin-induced protein.; TR:Q9SKP3
46F36H12.9F36H12.9n/achrIV 5,257,678contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
47ssp-31ZK1225.6n/achrI 13,219,303C. elegans SSP-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
48F58A6.5F58A6.5n/achrII 5,147,698contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domain IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
49C54G4.3C54G4.3n/achrI 8,005,688contains similarity to Homo sapiens Myosin heavy chain, skeletal muscle, fetal; ENSEMBL:ENSP00000255381
50ZK637.15ZK637.15n/achrIII 8,920,543contains similarity to Ureaplasma parvum Hypothetical membrane lipoprotein.; TR:Q9PQR8