UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1R07E5.11R07E5.112e-40chrIII 4,415,004contains similarity to Salmonella typhimurium Putative surface-exposed virulence protein bigA precursor.; SW:BIGA_SALTY
2srg-59C24B9.7n/achrV 2,724,113C. elegans SRG-59 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
3T23D5.3T23D5.3n/achrV 15,733,239contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR005098 (Protein of unknown function DUF281)
4K08D10.11K08D10.11n/achrIV 4,185,528
5Y44A6D.1Y44A6D.1n/achrV 20,782,907contains similarity to Escherichia coli TraT.; TR:Q7WUD7
6F48C1.3F48C1.3n/achrI 5,314,472
7Y48E1B.7Y48E1B.7n/achrII 13,580,236Y48E1B.7 encodes a C2H2-type zinc-finger protein required for embryonic development and fertility; Y48E1B.7 transcript levels are diminished by ERI-1, RDE-3, and RRF-2, perhaps through endogenous RNAi; Y48E1B.7 is paralogous to MCD-1, but has no obvious non-nematode orthologs; Y48E1B.7 contains a single central zinc-finger and a C-terminal low-complexity region, but no other recognizable protein domains.
8ZK185.1ZK185.1n/achrIV 4,550,393contains similarity to Interpro domain IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like)
9clec-213C50E3.3n/achrV 7,606,857C. elegans CLEC-213 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
10F21C10.1F21C10.1n/achrV 9,132,804contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
11W02A2.5W02A2.5n/achrIV 13,344,491contains similarity to Interpro domains IPR000589 (Ribosomal protein S15), IPR015683 (Glutamate receptor-related), IPR001508 (NMDA receptor)
12srv-9F53F1.8n/achrV 13,422,059C. elegans SRV-9 protein ;
13R05A10.5R05A10.5n/achrIV 14,169,839contains similarity to Interpro domain IPR000884 (Thrombospondin, type I)
14str-198ZK285.1n/achrV 16,048,450C. elegans STR-198 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15bath-23Y49F6C.5n/achrII 3,371,722C. elegans BATH-23 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
16F52D2.5F52D2.5n/achrX 1,974,154
17ZK1010.4ZK1010.4n/achrIII 12,982,581contains similarity to Pfam domain PF01682 DB module contains similarity to Interpro domain IPR002602 (Protein of unknown function DB)
18srw-73T03E6.6n/achrV 16,587,756C. elegans SRW-73 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
19srx-131F09F3.2n/achrV 13,846,060C. elegans SRX-131 protein ;
20T11F9.13T11F9.13n/achrV 11,482,664contains similarity to Thermotoga maritima ATP-dependent CLP protease, ATPase subunit.; TR:Q9WY41
21srbc-8C18B10.5n/achrV 7,484,197C. elegans SRBC-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
22nhr-118F13A2.8n/achrV 4,408,904C. elegans NHR-118 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR000003 ()
23C24A8.5C24A8.5n/achrX 4,328,634
24T05A8.3T05A8.3n/achrII 2,716,038
25Y45F10D.4Y45F10D.4n/achrIV 13,784,287Y45F10D.4 encodes a putative iron-sulfur cluster assembly enzyme that is required for embryonic and larval viability, and that is orthologous to human NIFUN and budding yeast ISU1 and ISU2; Y45F10D.4 expression levels are unusually stable, with relatively little variation between adults, dauers, and L3 larvae, or between wild-type and daf-2(e1370ts) or daf-16(m26) mutant adults; by orthology with yeast ISU1, Y45F10D.4 is predicted to bind FRH-1.
26C46F2.1C46F2.1n/achrX 8,078,758
27T21D9.2T21D9.2n/achrX 2,095,709contains similarity to Interpro domain IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
28srt-37F47D2.8n/achrV 4,280,809C. elegans SRT-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
29M02A10.1M02A10.1n/achrX 707,178
30Y116A8C.9Y116A8C.9n/achrIV 16,943,608contains similarity to Danio rerio Transmembrane protein 185-like.; SW:Q7SYC7
31Y75B8A.32Y75B8A.32n/achrIII 12,356,632contains similarity to Danio rerio PERQ amino acid-rich with GYF domain-containing protein 2s(Trinucleotide repeat-containing gene 15 protein).; SW:Q4KME6
32scl-18T12A7.3n/achrIV 11,754,015C. elegans SCL-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site)
33gcy-27C06A12.4n/achrIV 17,436,419C. elegans GCY-27 protein; contains similarity to Pfam domains PF00211 (Adenylate and Guanylate cyclase catalytic domain) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001054 (Adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
34str-61F14F8.1n/achrV 16,670,286C. elegans STR-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
36str-185R08C7.7n/achrIV 4,428,740C. elegans STR-185 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37brc-2T07E3.5n/achrIII 6,901,783brc-2 encodes a BRC domain-containing protein that is homologous to human BRCA2 which when mutated leads to early-onset breast cancer 2 or hereditary male breast cancer (OMIM:600185); in C. elegans, BRC-2 activity is essential for RAD-51-mediated repair of meiotic and radiation-induced double-strand breaks (DSBs); BRC-2 physically interacts with RAD-51 and single-stranded DNA and is required for proper localization of RAD-51 to sites of DNA damage and stabilization of RAD-51-DNA filaments; BRC-2 can also promote RAD-51-independent DSB repair via single-strand annealing (SSA) when the homologous recombination (HR) and nonhomologous end joining pathways (NHEJ) are compromised; in nonirradiated animals, BRC-2 is seen at diffuse, low levels in germline nuclei, but upon radiation treatment BRC-2 localizes to discrete foci that coincide with presumptive sites of DNA damage.
38Y39F10A.2Y39F10A.2n/achrII 780,543contains similarity to Pfam domain PF06079 Apyrase contains similarity to Interpro domain IPR009283 (Apyrase)
39srj-40F38H12.2n/achrV 4,102,865C. elegans SRJ-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40srg-30W02F12.7n/achrV 6,717,559C. elegans SRG-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
41F47B10.9F47B10.9n/achrX 10,913,178contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013089 (Kelch related)
42K04H8.2K04H8.2n/achrI 14,254,220contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
43F52F10.4F52F10.4n/achrV 1,544,140contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
44R12B2.3R12B2.3n/achrIII 5,806,220
45R155.4R155.4n/achrIII 1,978,876contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR005427 (Salmonella/Shigella invasin protein C)
46str-71T23F1.4n/achrV 15,458,547C. elegans STR-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47srw-26T05G11.3n/achrV 15,931,865C. elegans SRW-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
48srh-281F11A5.1n/achrV 16,191,496C. elegans SRH-281 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49F58A3.4F58A3.4n/achrX 11,010,149contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
50K02F3.7K02F3.7n/achrIII 836,776