UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1M163.2M163.20chrX 14,497,680contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
2C49A1.10C49A1.10n/achrI 14,243,227contains similarity to Mus musculus Proteinase activated receptor 3 precursor (PAR-3) (Thrombin receptor-slike 2) (Coagulation factor II receptor-like 2).; SW:PAR3_MOUSE
3T07D3.6T07D3.6n/achrII 881,565contains similarity to Pfam domain PF06828 Fukutin-related contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
4srg-61C24B9.11n/achrV 2,739,518C. elegans SRG-61 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
5srh-116Y61B8A.1n/achrV 17,253,997C. elegans SRH-116 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6T16A9.4T16A9.4n/achrV 14,218,017T16A9.4 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; while T16A9.4 has no clear orthologs in other organisms, it falls into a group of proteins that includes the classical neprilysins found in mammals (e.g., PEX [OMIM:307800] and the enkephalin cleaving enzymes).
7Y48B6A.1Y48B6A.1n/achrII 14,152,681Y48B6A.1 encodes an ortholog of human BOP1 (OMIM:610596, overexpressed in colon cancer) and S. cerevisiae ERB1; Y48B6A.1 may suppress tumorous growth in the germline; like PRO-1, -2, and -3, Y48B6A.1 is probably required for ribosome biogenesis, suggesting a link between biogenesis in the distal sheath and control of cell division in the germline; however, BOP1 is also a phosphoprotein in mitotic spindles and required for normal chromosomal segregation, raising the possibility that Y48B6A.1 is multifunctional.
8str-209F26G5.5n/achrV 4,949,965C. elegans STR-209 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9F17A9.5F17A9.5n/achrV 6,112,116contains similarity to Pfam domain PF00724 NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family contains similarity to Interpro domains IPR013785 (Aldolase-type TIM barrel), IPR001155 (NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase, N-terminal)
10C34C6.2C34C6.2n/achrII 8,681,696contains similarity to Homo sapiens KIAA1219; ENSEMBL:ENSP00000302059
11C40A11.8C40A11.8n/achrII 2,150,922
12C03A7.2C03A7.2n/achrV 5,182,798
13C24A3.4C24A3.4n/achrX 8,993,472contains similarity to Pfam domain PF02515 CoA-transferase family III contains similarity to Interpro domains IPR016160 (Aldehyde dehydrogenase, conserved site), IPR003673 (CoA-transferase family III)
14Y38H6C.4Y38H6C.4n/achrV 20,500,386contains similarity to Mus musculus Similar to hypothetical protein FLJ21522 (Epidermal growth factorsreceptor pathway substrate 8 related protein 3).; TR:Q91WL0
15clec-160F09G8.8n/achrIII 8,274,384C. elegans CLEC-160 protein; contains similarity to Pfam domains PF00092 (von Willebrand factor type A domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
16C55A1.1C55A1.1n/achrV 15,622,421contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17T20F7.3T20F7.3n/achrX 16,860,808contains similarity to Pfam domain PF03770 Inositol polyphosphate kinase contains similarity to Interpro domain IPR005522 (Inositol polyphosphate kinase)
18F23B2.8F23B2.8n/achrIV 9,152,242contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
19nhr-250ZK488.1n/achrV 613,820C. elegans NHR-250 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
20fbxa-130F42A6.8n/achrIV 3,340,450C. elegans FBXA-130 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
21srg-25T09D3.5n/achrV 5,343,042C. elegans SRG-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
22taf-1W04A8.7n/achrI 13,874,444The taf-1 gene encodes an ortholog of human TATA-binding protein associated factor TAF1L (TAFII250) that possesses histone acetyl transferase (HAT) activity and is a component of the TFIID general transcription factor that recognizes the transcription start site; TAF-1 is required for proper embryonic and larval development.
23W07E11.1W07E11.1n/achrX 10,093,967contains similarity to Pfam domains PF04898 (Glutamate synthase central domain) , PF01645 (Conserved region in glutamate synthase) , PF01266 (FAD dependent oxidoreductase) , PF00310 (Glutamine amidotransferases class-II) , PF07992 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase) , PF00070 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase) , PF01493 (GXGXG motif) contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR000583 (Glutamine amidotransferase, class-II), IPR013785 (Aldolase-type TIM barrel), IPR006076 (FAD dependent oxidoreductase), IPR006005 (Glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit 1), IPR000759 (Adrenodoxin reductase), IPR006982 (Glutamate synthase, central-N), IPR002932 (Glutamate synthase, central-C), IPR000103 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II), IPR002489 (Glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal), IPR012285 (Fumarate reductase, C-terminal), IPR001327 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, NAD-binding region), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR012220 (Glutamate synthase, eukaryotic), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
24F29B9.11F29B9.11n/achrIV 4,659,939
25clec-218W02D7.2n/achrV 8,309,344C. elegans CLEC-218 protein; contains similarity to Pfam domains PF00092 (von Willebrand factor type A domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
26lips-10F14E5.5n/achrII 8,440,581C. elegans LIPS-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
27C42C1.7C42C1.7n/achrIV 12,297,231contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
28nhr-215T07C5.4n/achrX 12,699,419C. elegans NHR-215 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
29dsl-2W09G12.1n/achrIV 1,203,808dsl-2 encodes a putative transmembrane protein whose extracellular domain has single DSL and EGF domains in series, somewhat like Delta/LAG-2; DSL-2 belongs to a nematode-specific family of Delta/LAG-2-like proteins that includes DSL-1, -2, -3, -5, -6, and -7.
30K03H6.1K03H6.1n/achrIV 1,525,035contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
31K12H6.12K12H6.12n/achrII 2,810,497contains similarity to Interpro domain IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like)
32spp-19K04A8.9n/achrV 6,559,648C. elegans SPP-19 protein; contains similarity to Interpro domains IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
33K03H9.3K03H9.3n/achrII 6,423,912
34gcy-1AH6.1n/achrII 9,514,635gcy-1 is predicted to encode a guanylate cyclase; however, transcriptional fusions of the putative upstream regulatory region with a GFP reporter did not confirm its expression.
35W03B1.5W03B1.5n/achrIV 4,350,140contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
36clec-176E03H12.3n/achrIV 4,984,700C. elegans CLEC-176 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
37pdhk-2ZK370.5n/achrIII 8,739,634C. elegans PDHK-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase contains similarity to Interpro domains IPR005467 (Signal transduction histidine kinase, core), IPR004358 (Signal transduction histidine kinase-related protein, C-terminal), IPR003594 (ATP-binding region, ATPase-like)
38asf-1F10G7.3n/achrII 4,702,628C. elegans ASF-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF04729 Anti-silencing protein, ASF1-like contains similarity to Interpro domains IPR006818 (Anti-silencing protein, ASF1-like), IPR017282 (Histone deposition protein Asf1)
39H11E01.2H11E01.2n/achrX 1,623,360contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
40Y26D4A.3Y26D4A.3n/achrI 13,072,492contains similarity to Pfam domain PF00059 (Lectin C-type domain short and long forms)
41F13E6.4F13E6.4n/achrX 10,693,437contains similarity to Pfam domain PF00397 WW domain contains similarity to Interpro domains IPR002349 (WW), IPR001202 (WW/Rsp5/WWP)
42F28B1.3F28B1.3n/achrV 17,053,645contains similarity to Interpro domain IPR009021 ()
43Y75B8A.28Y75B8A.28n/achrIII 12,320,885contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Required for START A of cell cycle, and glucose and nitrogen repression of sporulation; SGD:YJL005W
44T09B9.3T09B9.3n/achrX 9,760,250contains similarity to Pfam domain PF03009 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family contains similarity to Interpro domain IPR004129 (Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)
45C45G9.1C45G9.1n/achrIII 5,075,294contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
46srsx-24C03G6.16n/achrV 7,378,672C. elegans SRSX-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47Y44E3A.4Y44E3A.4n/achrI 3,325,798contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) (2), PF00018 (SH3 domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR001452 (Src homology-3), IPR000108 (Neutrophil cytosol factor 2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR011511 (Variant SH3), IPR003071 (Orphan nuclear receptor, HMR type)
48F13A2.1F13A2.1n/achrV 4,381,556
49F40G12.9F40G12.9n/achrV 14,282,717contains similarity to Pfam domain PF04942 (CC domain)
50E01G6.2E01G6.2n/achrX 12,257,730contains similarity to Streptomyces coelicolor;Streptomyces lividans Putative secreted protein (Putative TWIN ARGININ translocationsreceptor).; TR:Q9RJ68