UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srh-4K09D9.60chrV 4,011,203C. elegans SRH-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
2T16H12.1T16H12.1n/achrIII 10,084,745contains similarity to Human papillomavirus type 70 E7 protein.; SW:VE7_HPV70
3ZC196.8ZC196.8n/achrV 8,721,706contains similarity to Pfam domain PF04789 Protein of unknown function (DUF621) contains similarity to Interpro domain IPR006874 (Protein of unknown function DUF621)
4fut-4K12H6.3n/achrII 2,820,961fut-4 encodes a member of the glycosyltransferase 10 family.
5ZK688.3ZK688.3n/achrIII 7,894,068contains similarity to Pfam domain PF01557 Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family contains similarity to Interpro domains IPR010916 (TonB box, conserved site), IPR011234 (Fumarylacetoacetase, C-terminal-related), IPR002529 (Fumarylacetoacetase, C-terminal-like)
6C06E4.1C06E4.1n/achrIV 7,283,548
7H35N09.1H35N09.1n/achrX 8,607,362
8T10E10.3T10E10.3n/achrX 6,313,109contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
9rnt-1B0414.2n/achrI 5,782,356rnt-1 encodes a transcription factor that is the sole C. elegans member of the RUNX family of transcriptional regulators; rnt-1 activity is required for several developmental processes, including regulation of hypodermal seam cell proliferation and proper development of the male tail; RNT-1 can physically interact with SMA-4 and regulates, either directly or indirectly, expression of tlp-1 and cki-1, which encode a C2H2 zinc finger and CDK inhibitor, respectively; RNT-1::GFP reporter fusions are reportedly expressed in the nuclei of hypodermal seam cells, intestinal cells, body wall muscles, and, in males, cells derived from the V5, V6 and T lineages that give rise to the sensory rays.
10Y39A1A.10Y39A1A.10n/achrIII 10,632,788contains similarity to Arabidopsis thaliana ORF protein (Fragment).; TR:Q39170
11K11D12.9K11D12.9n/achrV 5,044,302contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
12srd-32T19H12.5n/achrV 4,867,995C. elegans SRD-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5)
13F14H3.9F14H3.9n/achrV 16,068,329contains similarity to Pfam domain PF03236 (Domain of unknown function DUF263)
14try-4F31D4.6n/achrV 20,855,551C. elegans TRY-4 protein; contains similarity to Pfam domains PF00089 (Trypsin) , PF03761 (Domain of unknown function (DUF316)) contains similarity to Interpro domains IPR001314 (Peptidase S1A, chymotrypsin), IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
15R05F9.7R05F9.7n/achrII 4,887,230contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
16tag-277ZK652.3n/achrIII 7,859,173tag-277 encodes a conserved eukaryotic protein with a ubiquitin-like fold.
17F47B7.6F47B7.6n/achrX 3,770,172
18mec-4T01C8.7n/achrX 16,805,158mec-4 encodes an amiloride-sensitive Na+ channel protein (degenerin) required to sense gentle mechanical stimuli (e.g. touch) along the body wall; MEC-4 is paralogous to, and coexpressed with, MEC-10, in all six touch cell neurons where they form a heteromeric mechanotransduction channel.
19ZK455.5ZK455.5n/achrX 11,325,637contains similarity to Pfam domain PF01066 CDP-alcohol phosphatidyltransferase contains similarity to Interpro domains IPR014472 (Choline/ethanolaminephosphotransferase), IPR000462 (CDP-alcohol phosphatidyltransferase)
20C30G4.2C30G4.2n/achrX 17,044,626contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold)
21C33F10.4C33F10.4n/achrII 4,796,475
22ZK757.1ZK757.1n/achrIII 9,869,795contains similarity to Pfam domain PF06681 Protein of unknown function (DUF1182) contains similarity to Interpro domains IPR000883 (Cytochrome c oxidase, subunit I), IPR010601 (Protein of unknown function DUF1182)
23C07E3.5C07E3.5n/achrII 10,364,567contains similarity to Pfam domain PF04942 CC domain contains similarity to Interpro domain IPR007026 (Domian of unknown function, DUF-CC)
24str-88R08H2.2n/achrV 15,383,115C. elegans STR-88 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25nhr-162C33G8.10n/achrV 6,991,040C. elegans NHR-162 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
26B0284.2B0284.2n/achrIII 4,382,911contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Progesterone-induced-blocking factor 1; ENSEMBL:ENSP00000317144
27F59B1.4F59B1.4n/achrV 3,626,020contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000194 (ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, nucleotide-binding)
28D1022.5D1022.5n/achrII 7,458,058
29srx-79C01G10.2n/achrV 15,098,590C. elegans SRX-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
30srj-1ZK829.8n/achrIV 11,964,638C. elegans SRJ-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31ast-1T08H4.3n/achrII 4,131,358ast-1 encodes a novel ETS-box transcription factor; AST-1 is required for the proper navigation of some interneuron axons to their targets, for differentiation of the ventral cord pioneer neuron AVG, and for pharyngeal morphogenesis; AST-1 is transiently expressed in many head neurons late in their differentiation and axon outgrowth, and in a few pharyngeal cells; AST-1 is at first nuclear, but then relocates to spots in cell bodies and even neuronal processes; hypomorphic ast-1 mutants have axons extending laterally, and crossing over from the right axon tract to the left axon bundle; null ast-1(hd92) mutants are inviable, failing to attach a working pharynx to their cuticle during development and then starving as L1 larvae; behaviorally, hypomorphic ast-1 animals are at least superficially normal, indicating that the ventral nerve cord can tolerate at least some miswiring; AST-1 regulates odr-2 expression, while ast-1 expression is itself regulated by lin-11.
32srbc-81Y45G12C.8n/achrV 2,523,361C. elegans SRBC-81 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
33C12D12.4C12D12.4n/achrX 3,486,561
34T22E5.3T22E5.3n/achrX 6,386,631contains similarity to Pfam domains PF01682 (DB module) , PF00041 (Fibronectin type III domain) contains similarity to Interpro domains IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR002602 (Protein of unknown function DB), IPR007110 (Immunoglobulin-like)
35B0205.5B0205.5n/achrI 10,740,393
36B0244.5B0244.5n/achrIII 5,745,987
37ZC416.2ZC416.2n/achrIV 3,634,511n/a
38Y73C8C.4Y73C8C.4n/achrV 3,101,079contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
39srg-15C34C6.1n/achrII 8,709,673C. elegans SRG-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
40sra-39T21H8.4n/achrX 13,902,169C. elegans SRA-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF03125 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
41srz-79C09G12.2n/achrIV 3,494,391C. elegans SRZ-79 protein ;
42F15H10.6F15H10.6n/achrV 10,411,166contains similarity to Mycoplasma pneumoniae Oligopeptide transport ATP-binding protein oppF.; SW:OPPF_MYCPN
43B0302.2B0302.2n/achrX 17,178,681
44K02E10.6K02E10.6n/achrX 2,481,834contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
45nhr-251ZK488.4n/achrV 601,466C. elegans NHR-251 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
46F46F5.15F46F5.15n/achrII 788,813
47Y39A1A.8Y39A1A.8n/achrIII 10,627,062contains similarity to Pfam domain PF03083 MtN3/saliva family contains similarity to Interpro domain IPR004316 (MtN3 and saliva related transmembrane protein)
48R04B5.7R04B5.7n/achrV 10,089,830contains similarity to Rattus norvegicus Protein tyrosine phosphatase TD14.; TR:O88902
49Y45F10D.10Y45F10D.10n/achrIV 13,786,277contains similarity to Pseudotylosurus angusticeps Recombination-activating protein 2 (Fragment).; TR:Q9DD51
50C54A12.3C54A12.3n/achrII 5,261,141