UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1nhr-198K06B4.80chrV 15,695,079C. elegans NHR-198 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3C29F9.9C29F9.9n/achrIII 98,659
4srx-13C44B12.4n/achrIV 1,116,817C. elegans SRX-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
5B0250.2B0250.2n/achrV 20,473,310contains similarity to Drosophila erecta Female-specific transformer protein.; SW:TRSF_DROER
6srh-62ZK6.9n/achrV 402,409C. elegans SRH-62 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7clec-231C29F3.4n/achrV 15,350,031C. elegans CLEC-231 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
8C10E2.4C10E2.4n/achrX 16,750,349
9srw-122H27D07.5n/achrV 2,951,456C. elegans SRW-122 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
10str-208F26G5.2n/achrV 4,957,686C. elegans STR-208 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11C17D12.3C17D12.3n/achrI 11,618,529contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
12ZK112.6ZK112.6n/achrIII 7,740,126contains similarity to Leptospira interrogans serogroup Icterohaemorrhagiae serovar copenhageni Acetyl-coenzyme A synthetase (EC 6.2.1.1) (Acetate--CoA ligase) (Acyl-sactivating enzyme).; SW:Q72LY9
13sre-13C38C6.4n/achrII 14,635,649C. elegans SRE-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
14F19G12.2F19G12.2n/achrX 1,429,318contains similarity to Pfam domain PF00268 Ribonucleotide reductase, small chain contains similarity to Interpro domains IPR012348 (Ribonucleotide reductase-related), IPR000358 (Ribonucleotide reductase), IPR009078 (Ferritin/ribonucleotide reductase-like)
15T27C5.8T27C5.8n/achrV 17,417,742contains similarity to Pfam domain PF06653 Protein of unknown function (DUF1164) contains similarity to Interpro domain IPR009545 (Protein of unknown function DUF1164)
16sas-5F35B12.5n/achrV 11,611,859sas-5 encodes a coiled-coil protein whose activity is required, paternally, maternally, and in a dose-dependent manner, for daughter centriole formation; SAS-5 localizes to both the cytoplasm and to centrioles, and photobleaching experiments reveal rapid SAS-5 cycling between these two cellular components throughout the cell cycle; SAS-5 localization to centrioles depends upon the ZYG-1 kinase and the SAS-6 coiled-coil protein, two proteins also required for centriole duplication; in turn, SAS-5 activity is required for SAS-6 centriolar localization, as SAS-6 fails to localize properly in sas-5 mutant embryos.
17Y56A3A.11Y56A3A.11n/achrIII 11,896,407contains similarity to Pfam domain PF01974 tRNA intron endonuclease, catalytic C-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR006677 (tRNA intron endonuclease, catalytic domain-like), IPR011856 (Endonuclease TnsA, N-terminal/resolvase Hjc/tRNA endonuclease, C-terminal)
18F54B11.5F54B11.5n/achrX 13,595,020contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
19mbr-1T01C1.2n/achrX 10,720,732C. elegans MBR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05225 helix-turn-helix, Psq domain contains similarity to Interpro domains IPR011526 (Helix-turn-helix, Psq-like), IPR007889 (Helix-turn-helix, Psq)
20srg-33F21F8.1n/achrV 8,292,769C. elegans SRG-33 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
21W04D2.5W04D2.5n/achrV 12,493,975contains similarity to Pfam domain PF00411 Ribosomal protein S11 contains similarity to Interpro domain IPR001971 (Ribosomal protein S11)
22Y53C12B.2Y53C12B.2n/achrII 9,740,855contains similarity to Pfam domain PF00013 KH domain contains similarity to Interpro domains IPR004087 (K Homology), IPR004088 (K Homology, type 1)
23Y57A10B.6Y57A10B.6n/achrII 12,391,276contains similarity to Pfam domain PF07149 Pes-10 contains similarity to Interpro domain IPR009819 (Pes-10)
24nhr-4F32B6.10.0000000006chrIV 9,880,614nhr-4 is predicted to encode a nuclear hormone receptor (NHR); expression may peak during the late larval stages, based on mRNA expression analysis.
25F30A10.1F30A10.1n/achrI 9,473,896contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
26rpb-12F23B2.13n/achrIV 9,146,652C. elegans RPB-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF03604 DNA directed RNA polymerase, 7 kDa subunit contains similarity to Interpro domain IPR006591 (RNA polymerase Rbp10)
27srt-3F47D2.3n/achrV 4,259,059C. elegans SRT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
28C55A1.9C55A1.9n/achrV 15,626,819contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
29srv-34F13A7.3n/achrV 16,373,569C. elegans SRV-34 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000355 (Chemokine receptor)
30clec-120F29A7.7n/achrII 2,756,519C. elegans CLEC-120 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold)
31F57B7.2F57B7.2n/achrV 11,442,786contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
32srh-127F37B4.1n/achrV 2,894,429C. elegans SRH-127 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33F30A10.9F30A10.9n/achrI 9,505,158contains similarity to Pfam domain PF04900 Fcf1 contains similarity to Interpro domains IPR006984 (Protein of unknown function DUF652), IPR006596 (Nucleotide binding protein, PINc)
34F23D12.1F23D12.1n/achrX 14,425,936contains similarity to Clostridium perfringens Hypothetical protein CPE1252.; TR:Q8XKZ0
35str-113Y39H10B.1n/achrV 3,665,916C. elegans STR-113 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36clec-178T19E7.1n/achrIV 5,654,480C. elegans CLEC-178 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
37nlr-1F20B10.1n/achrIV 12,174,554C. elegans NLR-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (2), PF02210 (Laminin G domain) (2), PF00054 (Laminin G domain) contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR001791 (Laminin G), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR012680 (Laminin G, subdomain 2), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase), IPR012679 (Laminin G, subdomain 1)
38E03H4.3E03H4.3n/achrI 12,406,224contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
39srh-47T03F7.4n/achrV 11,299,983C. elegans SRH-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit)
40F59E12.8F59E12.8n/achrII 5,635,699contains similarity to Interpro domain IPR015683 (Glutamate receptor-related)
41F55D1.1F55D1.1n/achrX 5,489,941
42T08A9.5T08A9.5n/achrX 7,312,937
43igcm-2SSSD1.1n/achrX 6,382,121igcm-2 encodes a protein containing immunoglobulin and fibronectin repeats; igcm-2 promoter::gfp fusions are expressed in the PVT interneuron, in some head neurons, and in the pharynx and intestine.
44K04A8.2K04A8.2n/achrV 6,563,097contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
45srx-73F41F3.7n/achrV 4,664,669C. elegans SRX-73 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
46C03B1.10C03B1.10n/achrX 6,357,809contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ42885 fis, clone BRHIP3007586; HI:HIT000044748
47str-118F57A8.3n/achrV 10,052,955C. elegans STR-118 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48F15A4.5F15A4.5n/achrII 12,470,242contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8ICX2
49K08B4.5K08B4.5n/achrIV 6,087,860contains similarity to Pfam domain PF00443 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR001019 (Guanine nucleotide binding protein (G-protein), alpha subunit)
50ZK678.3ZK678.3n/achrX 15,748,766contains similarity to Pfam domain PF00134 Cyclin, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR006670 (Cyclin), IPR011028 (Cyclin-like), IPR013763 (Cyclin-related), IPR006671 (Cyclin, N-terminal)