UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K05F6.10K05F6.100chrII 1,575,342contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domain IPR002083 (MATH)
2F55H2.5F55H2.5n/achrIII 9,512,031contains similarity to Pfam domain PF03188 Cytochrome b561 contains similarity to Interpro domains IPR004877 (Cytochrome b561), IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR), IPR006593 (Cytochrome b561 / ferric reductase transmembrane)
3tsp-4F53B2.2n/achrIV 12,519,672C. elegans TSP-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin)
4C27H5.6C27H5.6n/achrII 7,186,228
5K04F1.12K04F1.12n/achrV 1,656,168contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
6K06H6.6K06H6.6n/achrV 584,556contains similarity to Pfam domain PF01531 Glycosyl transferase family 11 contains similarity to Interpro domain IPR002516 (Glycosyl transferase, family 11)
7fbxa-161C08E3.4n/achrII 1,607,102C. elegans FBXA-161 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
8C50F4.9C50F4.9n/achrV 9,523,727contains similarity to Streptococcus agalactiae Hypothetical protein.; TR:Q8E2N5
9F14D2.7F14D2.7n/achrII 3,337,168contains similarity to Interpro domain IPR006642 (Zinc finger, Rad18-type putative)
10C40C9.4C40C9.4n/achrX 13,651,413contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein with a putative role in sister chromatid segregation, potentially phosphorylated by Cdc28p; green fluorescent protein (GFP)-fusion protein localizes to the nuclear periphery; SGD:YML034W
11F25E5.9F25E5.9n/achrV 7,437,693
12srbc-77T05G11.2n/achrV 15,930,607C. elegans SRBC-77 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
13Y38H6C.19Y38H6C.19n/achrV 20,548,064contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
14flp-14Y37D8A.15n/achrIII 12,912,600flp-14 encodes four copies of a single FMRFamide-related short peptide neurotransmitter; FLP-14 can increase pharyngeal action potential frequency, although its exact role in C. elegans neurotransmission is not yet clear.
15ttr-19C12D8.4n/achrV 10,227,127C. elegans TTR-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
16C13A2.7C13A2.7n/achrV 7,266,655
17C09G9.5C09G9.5n/achrIV 8,887,547contains similarity to Interpro domain IPR008992 ()
18F47B8.3F47B8.3n/achrV 14,322,155contains similarity to Pfam domain PF00462 Glutaredoxin contains similarity to Interpro domains IPR002109 (Glutaredoxin), IPR012336 (Thioredoxin-like fold)
19sod-4F55H2.1n/achrIII 9,499,079C. elegans SOD-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00080 Copper/zinc superoxide dismutase (SODC) contains similarity to Interpro domain IPR001424 (Superoxide dismutase, copper/zinc binding)
20sulp-5K12G11.2n/achrV 11,881,591sulp-5 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-5 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a SULP-5::GFP fusion is expressed in punctate structures irregularly distributed along the apical membrane of excretory cell canals and is also expressed weakly in adult seam cells.
21T12A2.5T12A2.5n/achrIII 6,236,471
22H12D21.4H12D21.4n/achrV 14,892,420contains similarity to Pfam domain PF00581 Rhodanese-like domain contains similarity to Interpro domains IPR001763 (Rhodanese-like), IPR001307 (Thiosulphate sulphurtransferase, conserved site)
23M03A1.3M03A1.3n/achrII 4,558,668M03A1.3 encodes a protein with ~10 predicted transmembrane sequences; it has an internal repeat (in residues 74-351 and 377-668), with some similarity in these repeated domains to worm C05D12.1 and C13B4.1, and to mammalian stromal cell derived factor receptor 2.
24W03D2.7W03D2.7n/achrIV 4,062,904
25R03H10.1R03H10.1n/achrII 4,181,882This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
26sre-20ZC455.7n/achrV 12,783,819C. elegans SRE-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
27F56H6.7F56H6.7n/achrI 12,299,265contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domains IPR005049 (Protein of unknown function DUF288), IPR001692 (Histidinol dehydrogenase)
28R03H4.5R03H4.5n/achrV 9,020,799contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
29K09D9.9K09D9.9n/achrV 3,993,382
30T27F2.4T27F2.4n/achrV 11,650,405contains similarity to Interpro domain IPR004827 (Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor)
31twk-7F22B7.7n/achrIII 8,638,816C. elegans TWK-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
32F12A10.2F12A10.2n/achrII 5,495,367
33clec-5C35D10.14n/achrIII 4,882,708C. elegans CLEC-5 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR013838 (Beta tubulin, autoregulation binding site), IPR001304 (C-type lectin)
34nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
35F19F10.3F19F10.3n/achrV 7,552,413
36C12D5.3C12D5.3n/achrV 7,676,566contains similarity to Interpro domain IPR002194 (Chaperonin TCP-1, conserved site)
37T23G7.3T23G7.3n/achrII 9,166,799contains similarity to Pfam domain PF01585 G-patch domain contains similarity to Interpro domain IPR000467 (D111/G-patch)
38C05E11.6C05E11.6n/achrX 4,562,490contains similarity to Interpro domain IPR001166 (Crustacean neurohormone)
39C23G10.10C23G10.10n/achrIII 6,213,461
40twk-23F19D8.1n/achrX 13,819,543twk-23 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; the precise role of TWK-23 in C. elegans development and/or behavior is not yet known, however TWK-23 may function redundantly with other TWK channels; TWK-23 is expressed in neurons, muscle, the posterior intestine, and diffusely in many other tissues.
41glb-15F35B12.8n/achrV 11,617,517glb-15 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
42zig-3C14F5.2n/achrX 7,931,218zig-3 encodes a predicted secreted protein that is a member of the immunoglobulin superfamily of proteins; a zig-3::gfp reporter fusion is expressed in the PVT, AIM, and ASI neurons, as well as in the vulva and weakly in the body wall muscle.
43C07E3.5C07E3.5n/achrII 10,364,567contains similarity to Pfam domain PF04942 CC domain contains similarity to Interpro domain IPR007026 (Domian of unknown function, DUF-CC)
44ZC239.17ZC239.17n/achrII 3,225,710contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
45pde-1T04D3.3n/achrI 13,314,797C. elegans PDE-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF08499 (3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase N-terminal) , PF00233 (3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase) contains similarity to Interpro domains IPR002073 (3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase), IPR013706 (3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase N-terminal), IPR003607 (Metal-dependent phosphohydrolase, HD region)
46C54D2.2C54D2.2n/achrX 7,839,011
47R07A4.4R07A4.4n/achrX 10,753,200contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
48C14A6.2C14A6.2n/achrV 18,151,568contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
49tsp-5Y45F10B.1n/achrIV 13,591,144C. elegans TSP-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin)
50F17E9.2F17E9.2n/achrIV 8,356,187