UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1btb-4F59H6.129e-86chrII 2,032,856C. elegans BTB-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
2ZC15.5ZC15.5n/achrV 20,294,125contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
3ZK1053.6ZK1053.6n/achrI 13,239,621ZK1053.6 encodes an ortholog of human SLC41A1 (OMIM:610801) and bacterial MgtE; like its orthologs, ZK1053.6 is predicted to transport Mg(2+) into cells; ZK1053.6 is paralogous to K07H8.2 and ZK185.2, and has no obvious function in mass RNAi assays.
4C30H6.8C30H6.8n/achrIV 17,382,648contains similarity to Pfam domain PF00085 Thioredoxin contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
5T26C11.3T26C11.3n/achrX 1,838,587
6F53G2.2F53G2.2n/achrII 2,483,921
7ZK682.7ZK682.7n/achrV 9,291,373
8rab-8D1037.4n/achrI 3,683,497rab-8 encodes a rab related protein of the Ras GTPase superfamily that affects ovarian morphology and function, thereby affecting fertility; acts downstream of let-60 with respect to vulval development based on genetic analysis.
9F11A10.4F11A10.4n/achrIV 12,101,240contains similarity to Pfam domain PF02985 HEAT repeat contains similarity to Interpro domains IPR013324 (RNA polymerase sigma factor, regions 3 and 4), IPR016024 (Armadillo-type fold)
10C43D7.7C43D7.7n/achrV 19,319,210contains similarity to Dictyostelium discoideum Filament-interacting protein.; TR:Q967Y0
11Y38H6A.2Y38H6A.2n/achrV 20,325,833contains similarity to Chlamydia pneumoniae Hypothetical protein CPn0168.; TR:Q9Z916
12srp-8F20D6.3n/achrV 8,184,913srp-8 encodes a predicted serpin (serine protease inhibitor)
13str-166T08B6.6n/achrIV 4,885,569C. elegans STR-166 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14nspb-2F38A5.12n/achrIV 6,591,852C. elegans NSPB-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF07312 Protein of unknown function (DUF1459) contains similarity to Interpro domain IPR009924 (Protein of unknown function DUF1459)
15C03H5.5C03H5.5n/achrII 383,812contains similarity to Xenopus laevis Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E-interactingsprotein (Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit 6-sinteracting protein).; SW:Q8AVJ0
16H14A12.5H14A12.5n/achrIII 7,467,767
17Y26G10.1Y26G10.1n/achrV 17,694,131contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF07974 (EGF-like domain) (3)contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR001774 (Delta/Serrate/lag-2 (DSL) protein), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR015919 (Cadherin-like), IPR011050 (Pectin lyase fold/virulence factor), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR006626 (Parallel beta-helix repeat), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR002126 (Cadherin), IPR013111 (EGF, extracellular)
18srh-145F26D2.4n/achrV 16,411,251C. elegans SRH-145 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
19R07B1.8R07B1.8n/achrX 9,871,676
20cyn-16Y17G7B.9n/achrII 12,032,664cyn-16 encodes a highly diverged member of the cyclophilin family; CYN-16 exhibits low levels of peptidyl-prolyl cis/trans isomerase activity in vitro that is insensitive to the presence of cyclosporin A; a cyn-16::gfp fusion protein is expressed in the intestine during larval and adult stages of development, with particularly strong expression seen in the anterior and posterior ends; in dauer larvae, the cyn-16::gfp reporter is expressed in cell bodies and processes of ventral cord neurons and is no longer visible in the intestine.
21math-23C46F9.2n/achrII 1,903,365The C46F9.2 gene encodes a protein closely similar to C46F9.3, which has a meprin-associated Traf homology (MATH) domain and may be involved in apoptosis.
22R09D1.10R09D1.10n/achrII 9,465,285contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
23R53.4R53.4n/achrII 9,967,683contains similarity to Homo sapiens 10 kDa protein; ENSEMBL:ENSP00000377740
24K02F6.4K02F6.4n/achrII 2,541,208contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
25R11D1.2R11D1.2n/achrV 12,709,668contains similarity to Pfam domain PF00646 F-box domain contains similarity to Interpro domain IPR001810 (Cyclin-like F-box)
26C08F1.8C08F1.8n/achrII 1,806,228
27Y76A2B.5Y76A2B.5n/achrIII 13,547,827contains similarity to Danio rerio Zgc:91819 protein.; TR:Q6GMH4
28sri-42T10D4.9n/achrII 3,141,931C. elegans SRI-42 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29grsp-3C34D4.11n/achrIV 7,131,263C. elegans GRSP-3 protein; contains similarity to Interpro domains IPR005405 (Potassium channel, voltage dependent, Kv3.4), IPR002952 (Eggshell protein), IPR003991 (Pertactin virulence factor, C-terminal), IPR000817 (Prion protein), IPR001951 (Histone H4)
30nlp-16T13A10.5n/achrIV 6,257,461nlp-16 encodes a predicted neuropeptide that does not belong to a multigene family in C. elegans and is not clearly related to well-characterized neuropeptides; the peptide encoded by nlp-16 has been isolated from Ascaris suum.
31che-11C27A7.4n/achrV 12,147,469che-11 encodes a large, unfamiliar protein with orthologs in vertebrates and arthropods (e.g., KIAA0590 and CG11838-PA) and in Chlamydomonas (IFT140), as well as distant similarity to OSM-1 and ZK520.1; che-11 is required for normal synthesis of sensory cilia (via intraflagellar transport) in sensory neurons, osmotic avoidance, and dauer formation.
32M02A10.1M02A10.1n/achrX 707,178
33ZK563.2ZK563.2n/achrX 3,371,077contains similarity to Pfam domain PF02690 Na+/Pi-cotransporter contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR003841 (Na+/Pi-cotransporter)
34nhr-173C56E10.1n/achrX 6,657,606C. elegans NHR-173 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
35Y54E2A.8Y54E2A.8n/achrII 14,780,444contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
36lin-31K10G6.1n/achrII 3,984,762lin-31 encodes a winged helix (WH)-like transcription factor that is a member of the HNF3/Forkhead family of DNA-binding proteins; LIN-31 acts as a tissue-specific effector of MAP kinase-mediated signaling in the vulva; when MAP kinase is inactive, LIN-31 forms a complex with LIN-1/Ets that inhibits vulval cell fates; upon MAP kinase activation (vulval induction), LIN-31 becomes phosphorylated, dissociates from LIN-1, and goes on to promote primary and secondary vulval cell fates; LIN-31 is expressed in the vulval precursor cells.
37R08E3.2R08E3.2n/achrX 4,823,223contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
38F25H9.3F25H9.3n/achrV 13,456,608contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
39sri-57F22E5.16n/achrII 2,671,336C. elegans SRI-57 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40B0379.1B0379.1n/achrI 10,076,345contains similarity to Plasmodium falciparum ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, putative.; TR:Q8IL98
41str-248C55A1.3n/achrV 15,628,858C. elegans STR-248 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42F23H11.6F23H11.6n/achrIII 914,468
43nhr-208R07B7.15n/achrV 12,095,111C. elegans NHR-208 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
44Y75B8A.11Y75B8A.11n/achrIII 12,188,150contains similarity to Lymnaea stagnalis Neuropeptide Y precursor.; TR:Q9U0S9
45ZK228.1ZK228.1n/achrV 18,445,683contains similarity to Mus musculus SOX-13 protein.; SW:SX13_MOUSE
46C17A2.5C17A2.5n/achrII 3,834,625contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
47clec-44R07C3.12n/achrII 921,144C. elegans CLEC-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
48C04F12.1C04F12.1n/achrI 9,676,100contains similarity to Pfam domain PF02171 Piwi domain contains similarity to Interpro domains IPR003165 (Stem cell self-renewal protein Piwi), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
49B0432.4B0432.4n/achrII 287,664contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
50str-77W06D12.4n/achrV 17,720,087C. elegans STR-77 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)