UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F54H12.4F54H12.40chrIII 7,962,097
2srg-36K04C1.6n/achrX 14,230,194C. elegans SRG-36 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000539 (Frizzled protein), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
3glb-17F49E2.4n/achrX 9,574,890glb-17 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
4fbxa-11T12B5.4n/achrIII 951,455This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
5gst-25F37F2.3n/achrI 1,452,100C. elegans GST-25 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR003082 (Glutathione S-transferase, Pi class), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
6T10B10.8T10B10.8n/achrX 15,163,702contains similarity to Pfam domain PF01501 Glycosyl transferase family 8 contains similarity to Interpro domain IPR002495 (Glycosyl transferase, family 8)
7sup-10R09G11.1n/achrX 17,529,998C. elegans SUP-10 protein ;
8cah-2D1022.8n/achrII 7,481,896cah-2 encodes a predicted carbonic anhydrase.
9K02D3.1K02D3.1n/achrX 13,707,203contains similarity to Clostridium acetobutylicum Transcriptional regulator, AcrR family.; TR:Q97IH3
10T05C1.3T05C1.3n/achrII 4,488,577
11F02H6.7F02H6.7n/achrIV 14,227,256contains similarity to Interpro domain IPR000884 (Thrombospondin, type I)
12C53A5.6C53A5.6n/achrV 14,544,748contains similarity to Pfam domains PF01344 (Kelch motif) (5), PF00097 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)) , PF07646 (Kelch motif) (4)contains similarity to Interpro domains IPR011043 (Galactose oxidase/kelch, beta-propeller), IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR006652 (Kelch repeat type 1), IPR011498 (Kelch repeat type 2), IPR015916 (Galactose oxidase, beta-propeller), IPR013089 (Kelch related), IPR006651 (Kelch), IPR015915 (Kelch-type beta propeller)
13Y26E6A.2Y26E6A.2n/achrX 13,911,881This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
14C54D10.5C54D10.5n/achrV 12,430,253contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
15F52E1.9F52E1.9n/achrV 8,398,736contains similarity to Interpro domain IPR011332 (Ribosomal protein, zinc-binding)
16T24A6.7T24A6.7n/achrV 3,525,734contains similarity to Pfam domain PF08719 Domain of unknown function (DUF1768) contains similarity to Interpro domain IPR012816 (Conserved hypothetical protein CHP02464)
17srv-7T22B7.5n/achrX 5,643,888C. elegans SRV-7 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
18C26B2.7C26B2.7n/achrIV 8,016,527
19F41C6.4F41C6.4n/achrX 6,874,202
20R04B5.6R04B5.6n/achrV 10,086,268contains similarity to Pfam domains PF00107 (Zinc-binding dehydrogenase) , PF08240 (Alcohol dehydrogenase GroES-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR013149 (Alcohol dehydrogenase, zinc-binding), IPR011032 (GroES-like), IPR013154 (Alcohol dehydrogenase GroES-like), IPR002085 (Alcohol dehydrogenase superfamily, zinc-containing), IPR011597 (GroES-related), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR002328 (Alcohol dehydrogenase, zinc-containing, conserved site)
21W03F9.1W03F9.1n/achrV 125,395contains similarity to Pfam domain PF03367 ZPR1 zinc-finger domain contains similarity to Interpro domain IPR004457 (Zinc finger, ZPR1-type)
22F08D12.4F08D12.4n/achrII 2,778,750contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
23fbxa-3T08E11.7n/achrII 1,819,483This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
24F21G4.3F21G4.3n/achrX 9,896,105contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
25ser-5F16D3.7n/achrI 8,385,819F16D3.7 encodes a homolog of mammalian alpha-adrenergic receptors that is expressed in vulval and bodywall muscle cells, intestine, and head neurons; heterologously expressed F16D3.7 has no effect on adenylate cyclase signalling; F16D3.7 has no obvious function in RNAi assays of brood size, egg laying, pharyngeal pumping, locomotion, or male mating.
26D1044.5D1044.5n/achrIII 5,524,267
27C56A3.6C56A3.6n/achrV 13,554,913contains similarity to Pfam domain PF00036 (EF hand)
28W05H5.3W05H5.3n/achrII 12,446,465contains similarity to Pfam domain PF01384 Phosphate transporter family contains similarity to Interpro domain IPR001204 (Phosphate transporter)
29T01C3.1T01C3.1n/achrV 14,989,266contains similarity to Pfam domains PF00169 (PH domain) , PF06920 (Dedicator of cytokinesis) contains similarity to Interpro domains IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR010703 (Dedicator of cytokinesis)
30F30A10.1F30A10.1n/achrI 9,473,896contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
31B0564.4B0564.4n/achrIV 13,112,036contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
32C30E1.7C30E1.7n/achrX 16,915,205
33fbxa-23T12B5.13n/achrIII 948,457C. elegans FBXA-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
34ZK697.1ZK697.1n/achrV 1,753,103
35srx-2R03H4.2n/achrV 9,010,093C. elegans SRX-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
36egl-2F16B3.1n/achrV 1,294,353egl-2 encodes a voltage-gated potassium channel that affects egg laying, muscle activation, defecation, mechanosensation, and chemosensation; expressed in the intestinal muscle, AFD, ALN, AQR, ASE, AWC, BAG, IL2, PLN, PQR, and URX neurons as well as a subset of sensory neurons in the male tail.
37C02F5.3C02F5.3n/achrIII 8,246,494contains similarity to Pfam domains PF01926 (GTPase of unknown function) , PF02824 (TGS domain) contains similarity to Interpro domains IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR002917 (GTP-binding protein, HSR1-related), IPR006073 (GTP1/OBG), IPR004095 (TGS), IPR006074 (GTP1/OBG, conserved site)
38snf-6M01G5.5n/achrIII 1,526,486snf-6 encodes a member of the sodium:neurotransmitter symporter family.
39str-161T08B6.3n/achrIV 4,903,231C. elegans STR-161 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40F28E10.2F28E10.2n/achrIV 4,563,722contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF07974 (EGF-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular)
41nhr-273T12C9.1n/achrII 4,436,140C. elegans NHR-273 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
42F15E11.5F15E11.5n/achrV 2,343,260contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
43F01F1.14F01F1.14n/achrIII 5,882,603
44M60.6M60.6n/achrX 8,250,273
45srh-3K04F1.5n/achrV 1,683,835C. elegans SRH-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001024 (Lipoxygenase, LH2)
46F54C8.4F54C8.4n/achrIII 9,442,492contains similarity to Pfam domain PF00782 Dual specificity phosphatase, catalytic domain contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR000340 (Protein-tyrosine phosphatase, dual specificity)
47R10E11.5R10E11.5n/achrIII 9,787,703contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ77065, highly similar to Homo sapiens golgi autoantigen, golgin subfamily a, 4 (GOLGA4), mRNA; ENSEMBL:ENSP00000349305
48sma-3R13F6.9n/achrIII 6,862,404sma-3 encodes a Smad protein; during development, SMA-3 functions as part of a DBL-1/SMA-6 TGF-beta-related signaling pathway that controls body size and male tail sensory ray and spicule formation; sma-3 is widely expressed at all developmental stages, beginning during embryogenesis, continuing through all larval stages, and seen very strongly in adult hermaphrodites and males; a SMA-3::GFP is detected in the pharynx, intestine, and hypodermis and localizes to the nucleus; sma-3 expression in the hypodermis is necessary and sufficient for normal body size; SMA-3 can physically interact with the LIN-31 forkhead transcription factor.
49B0348.2B0348.2n/achrV 46,173contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
50C04E6.3C04E6.3n/achrV 5,920,241