UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F53G12.4F53G12.41.0000000000000001e-162chrI 135,809
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3dsl-2W09G12.1n/achrIV 1,203,808dsl-2 encodes a putative transmembrane protein whose extracellular domain has single DSL and EGF domains in series, somewhat like Delta/LAG-2; DSL-2 belongs to a nematode-specific family of Delta/LAG-2-like proteins that includes DSL-1, -2, -3, -5, -6, and -7.
4cyp-34A2T10H4.11n/achrV 15,290,031C. elegans CYP-34A2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
5srw-60T11F1.1n/achrII 2,960,240C. elegans SRW-60 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
6C49A1.10C49A1.10n/achrI 14,243,227contains similarity to Mus musculus Proteinase activated receptor 3 precursor (PAR-3) (Thrombin receptor-slike 2) (Coagulation factor II receptor-like 2).; SW:PAR3_MOUSE
7cdr-3C54D10.2n/achrV 12,416,844C. elegans CDR-3 protein; contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
8glb-31Y57G7A.9n/achrII 1,300,864glb-31 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
9asf-1F10G7.3n/achrII 4,702,628C. elegans ASF-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF04729 Anti-silencing protein, ASF1-like contains similarity to Interpro domains IPR006818 (Anti-silencing protein, ASF1-like), IPR017282 (Histone deposition protein Asf1)
10C28G1.2C28G1.2n/achrX 8,837,092contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
11T24B8.4T24B8.4n/achrII 9,067,183contains similarity to Pfam domain PF02205 WH2 motif contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003124 (Actin-binding WH2)
12C35D10.12C35D10.12n/achrIII 4,873,622contains similarity to Pfam domains PF08242 (Methyltransferase domain) , PF08241 (Methyltransferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR011644 (Haem NO binding), IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR013216 (Methyltransferase type 11)
13K03H4.1K03H4.1n/achrV 13,151,458contains similarity to Helicobacter pylori Transposase OrfB.; TR:Q93C83
14Y41E3.11Y41E3.11n/achrIV 15,045,860contains similarity to Pfam domain PF00622 SPRY domain contains similarity to Interpro domains IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY)
15Y17D7C.1Y17D7C.1n/achrV 18,709,792contains similarity to Trypanosoma brucei Hypothetical protein.; TR:Q7YVJ9
16T09B9.2T09B9.2n/achrX 9,763,139contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter), IPR004745 (Na(+)-dependent inorganic phosphate cotransporter)
17E02C12.9E02C12.9n/achrV 9,374,371contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
18cyp-33D1K05D4.4n/achrV 16,174,796C. elegans CYP-33D1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR008071 (Cytochrome P450, E-class, group I, CYP2J-like), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
19srw-108R11G11.5n/achrV 528,386C. elegans SRW-108 protein ;
20str-33C24B9.1n/achrV 2,729,388C. elegans STR-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21osm-9B0212.5n/achrIV 3,554,256The osm-9 gene encodes a capsaicin receptor homolog involved in sensory responses to a subset of chemical stimuli and to ASH neuron-mediated osmotic and mechanical stimuli; OSM-9 is also involved in adaptation to volatile odorants and salts.
22T16A9.4T16A9.4n/achrV 14,218,017T16A9.4 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; while T16A9.4 has no clear orthologs in other organisms, it falls into a group of proteins that includes the classical neprilysins found in mammals (e.g., PEX [OMIM:307800] and the enkephalin cleaving enzymes).
23F54E4.3F54E4.3n/achrX 14,634,171contains similarity to Melanoplus sanguinipes entomopoxvirus ORF MSV230 hypothetical protein.; TR:Q9YVL2
24C29H12.6C29H12.6n/achrII 6,116,301
25F36F12.7F36F12.7n/achrV 2,099,700
26Y48B6A.10Y48B6A.10n/achrII 14,215,677contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
27ceh-31C33D12.1n/achrX 3,069,626ceh-31 encodes a protein containing a homeobox domain.
28C44B12.3C44B12.3n/achrIV 1,105,091
29nhr-215T07C5.4n/achrX 12,699,419C. elegans NHR-215 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
30nhr-217T09E11.2n/achrI 12,341,975C. elegans NHR-217 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
31fbxa-199T06E6.3n/achrV 15,398,082srx-40 encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
32T01C3.2T01C3.2n/achrV 14,991,380T01C3.2 encodes a divergent ortholog of Drosophila melanogaster E(Y)2 and budding yeast Sus1p; by orthology, T01C3.2 is predicted to enable both transcriptional activation and silencing in chromatin; however, T01C3.2 has no obvious function in mass RNAi assays.
33set-6C49F5.2n/achrX 11,972,276set-6 encodes a putative histone H3 lysine-9 methyltransferase; SET-6 has no non-nematode orthologs, but several paralogs (SET-13, SET-15, SET-19, SET-20, SET-21, and SET-32); neither set-6(tm1611) nor set-6(RNAi) have any obvious phenotypes.
34C33B4.2C33B4.2n/achrII 11,371,111contains similarity to Aristolochia gigantea RPB140 (EC 2.7.7.6) (DNA-directed RNA polymerase beta chain)s(Fragment).; TR:O48912
35T07F8.2T07F8.2n/achrII 7,145,876contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
36spe-12T02E1.1n/achrI 8,225,426C. elegans SPE-12 protein ;
37W08F4.7W08F4.7n/achrII 576,333
38F58H7.2F58H7.2n/achrIV 942,839contains similarity to Pfam domain PF01425 Amidase contains similarity to Interpro domains IPR000120 (Amidase signature enzyme), IPR015830 (Amidase, fungi type)
39srg-25T09D3.5n/achrV 5,343,042C. elegans SRG-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
40nhr-125R02D1.1n/achrV 4,322,934C. elegans NHR-125 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
41lips-10F14E5.5n/achrII 8,440,581C. elegans LIPS-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
42T07C12.8T07C12.8n/achrV 9,954,532contains similarity to Interpro domain IPR000998 (MAM)
43T20B6.3T20B6.3n/achrIII 2,899,911contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR000817 (Prion protein), IPR008119 (Dense granule Gra6 protein)
44cdd-1C47D2.2n/achrX 8,209,904cdd-1 encodes a cytidine deaminase that contains a zinc-binding region; expressed in the intestine.
45Y56A3A.6Y56A3A.6n/achrIII 11,874,979contains similarity to Interpro domains IPR003072 (Orphan nuclear receptor, NOR1 type), IPR000694 (Proline-rich region), IPR002951 (Atrophin)
46inft-1F58B6.2n/achrIII 1,107,561C. elegans INFT-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02181 Formin Homology 2 Domain contains similarity to Interpro domains IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003104 (Actin-binding FH2 and DRF autoregulatory)
47F29B9.10F29B9.10n/achrIV 4,659,258contains similarity to Interpro domain IPR001911 (Ribosomal protein S21)
48F44D12.2F44D12.2n/achrIV 10,015,214contains similarity to Pfam domain PF01064 Activin types I and II receptor domain contains similarity to Interpro domain IPR000472 (TGF-beta receptor/activin receptor, type I/II)
49srz-14K05D4.3n/achrV 16,184,163C. elegans SRZ-14 protein ;
50C11D9.1C11D9.1n/achrI 4,424,085contains similarity to Pfam domain PF00621 RhoGEF domain contains similarity to Interpro domains IPR000219 (Dbl homology (DH) domain), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)