UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F53F4.13F53F4.132e-49chrV 13,611,622contains similarity to Agrobacterium tumefaciens Flagellar motor protein.; TR:Q8U9I2
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3R06A10.1R06A10.1n/achrI 1,087,211contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
4tag-209R06F6.11n/achrII 10,787,542C. elegans TAG-209 protein ;
5F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
6nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
7F28A12.3F28A12.3n/achrV 8,641,003
8F15A4.6F15A4.6n/achrII 12,472,359contains similarity to Pfam domains PF04942 (CC domain) , PF01549 (ShK domain-like) (2)contains similarity to Interpro domains IPR007026 (Domian of unknown function, DUF-CC), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
9ZK822.4ZK822.4n/achrIV 11,927,183contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
10sdz-8C55A6.5n/achrV 11,515,643C. elegans SDZ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
11C33G8.4C33G8.40.00002chrV 7,006,530
12cyp-14A5F08F3.7n/achrV 5,422,142cyp-14A5 encodes a member of the cytochrome P450 family.
13F41G3.10F41G3.10n/achrII 6,749,016contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
14F52E1.2F52E1.2n/achrV 8,411,177contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR001304 (C-type lectin), IPR002353 (Type II antifreeze protein)
15C01G10.6C01G10.6n/achrV 15,087,952contains similarity to Staphylococcus aureus Staphylococcal secretory antigen ssaA2 precursor.; SW:Q6GED5
16F35H10.3F35H10.3n/achrIV 8,326,450
17C01G10.4C01G10.4n/achrV 15,089,864contains similarity to Staphylococcus aureus Staphylococcal secretory antigen ssaA2 precursor.; SW:Q5HDQ9
18fipr-14F13E9.2n/achrIV 10,877,191C. elegans FIPR-14 protein; contains similarity to Interpro domain IPR005137 (Photosystem I assembly BtpA)
19C11E4.2C11E4.2n/achrX 9,588,345contains similarity to Pfam domain PF00255 Glutathione peroxidase contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR000889 (Glutathione peroxidase)
20W04E12.7W04E12.7n/achrV 19,731,742contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
21glr-5ZC196.7n/achrV 8,718,671glr-5 encodes a kainate (non-NMDA)-type ionotropic glutamate receptor subunit; GLR-5 activity is required for normal brood sizes, especially at high temperatures; GLR-5 is expressed in neurons.
22F59G1.4F59G1.4n/achrII 5,900,345contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
23C14C6.2C14C6.2n/achrV 563,724contains similarity to Pfam domains PF04942 (CC domain) , PF01549 (ShK domain-like) (2)contains similarity to Interpro domains IPR007026 (Domian of unknown function, DUF-CC), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
24ctl-1Y54G11A.6n/achrII 14,304,828ctl-1 encodes one of three C. elegans catalases; CTL-1 exhibits catalase activity in vitro, and thus likely functions in vivo as an antioxidant enzyme that protects cells from reactive oxygen species; ctl-1 activity contributes to the extended lifespan seen in daf-2 mutant animals; in addition, ctl-1 expression is negatively regulated by DAF-2-mediated insulin signaling; as CTL-1 does not possess a C-terminal peroxisomal targeting signal (PTS), it is predicted to be a cytosolic catalase.
25ins-6ZK84.6n/achrII 6,000,649ins-6 encodes predicted type-beta insulin-like molecule that lacks a C peptide domain; expressed throughout development and in some neurons beginning in the two-fold elongated embryo.
26clec-199C30H6.1n/achrIV 17,352,393C. elegans CLEC-199 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
27F35B12.4F35B12.4n/achrV 11,609,661contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
28T16G1.7T16G1.7n/achrV 12,933,975T16G1.7 is orthologous to the human gene ALIAS DLC1~CANDIDATE TUMOR SUPPRESSOR GENE (DLEC1; OMIM:604050), which when mutated leads to disease.
29bbs-2F20D12.3n/achrIV 7,935,876bbs-2 is orthologous to human BBS2 (OMIM:606151, mutated in Bardet-Biedl syndrome 2); while the function of BBS-2 is unknown, it shares conserved domains with its human paralogs BBS1 and BBS7, which also are mutated in other Bardet-Biedl syndromes.
30F40F8.4F40F8.4n/achrII 11,139,746contains similarity to Interpro domain IPR001680 (WD40 repeat)
31T02D1.6T02D1.6n/achrIV 17,410,914contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002232 (5-Hydroxytryptamine 6 receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
32mec-9C50H2.3n/achrV 9,911,331mec-9 encodes a predicted extracellular protein containing six EGF-like repeats,five Kunitz-type protease inhibitor domains, and a glutamic acid-rich region possibly involved in protein-protein interactions; mec-9 encodes two proteins, only one of which, MEC-9L, appears to be required for normal mechanosensory response to gentle touch and proper functioning of the touch receptor neurons; mec-9 interacts genetically with mec-5, which encodes a unique C. elegans collagen secreted by the hypodermis; MEC-9L is expressed and secreted by the touch receptor neurons.
33H04M03.12H04M03.12n/achrIV 5,900,480
34C49G7.6C49G7.6n/achrV 4,041,399
35F12A10.5F12A10.5n/achrII 5,481,296contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR001125 (Recoverin), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR008080 (Parvalbumin), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin))
36F56H11.6F56H11.6n/achrIV 9,528,961contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
37clec-256Y17D7B.6n/achrV 18,772,129C. elegans CLEC-256 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
38dod-6T20G5.7n/achrIII 10,197,925C. elegans DOD-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
39mec-18C52B9.9n/achrX 4,272,688mec-18 encodes a protein similar to firefly luciferase and plant protein 4-coumarate coA ligase; mec-18 is involved in sensory mechanotransduction; genetic interactions with other mec genes suggest that mec-18 may be involved in negative regulation of the degenerin channel in the touch receptor neurons; mec-18 is expressed exclusively in the touch cells.
40K08D8.3K08D8.3n/achrIV 12,905,268contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
41nhr-120C25B8.6n/achrX 6,638,552C. elegans NHR-120 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
42grsp-2T28C6.1n/achrIV 8,817,412C. elegans GRSP-2 protein; contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR000817 (Prion protein), IPR008119 (Dense granule Gra6 protein), IPR001151 (GPR6 orphan receptor)
43clec-89C09D1.2n/achrI 4,072,314C. elegans CLEC-89 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
44glb-3C06H2.5n/achrV 11,139,410glb-3 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
45C05E7.3C05E7.3n/achrX 12,946,010contains similarity to Triticum aestivum Cold acclimation protein WCOR410b.; TR:P93607
46T27A10.2T27A10.2n/achrX 3,586,399
47ZC132.9ZC132.9n/achrV 4,318,616
48C24B5.1C24B5.1n/achrV 9,193,748contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
49nhr-63C06C6.4n/achrV 16,003,610C. elegans NHR-63 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
50M117.1M117.1n/achrIV 11,816,824contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001958 (Tetracycline resistance protein, TetA), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)