UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F49C12.12F49C12.126e-53chrIV 9,320,583contains similarity to Homo sapiens RNase K; VG:OTTHUMP00000182776
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3fbxb-47F58E1.14n/achrII 1,702,944This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
4R04A9.5R04A9.5n/achrX 386,590
5Y75B8A.5Y75B8A.5n/achrIII 12,116,403contains similarity to Interpro domain IPR000372 (Leucine-rich repeat, cysteine-rich flanking region, N-terminal)
6B0454.9B0454.9n/achrII 3,053,483contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domain IPR005020 (Protein of unknown function DUF278)
7taf-4R119.6n/achrI 385,688taf-4 encodes a TAFII (TBP(TATA-binding protein)-associated factor) that is orthologous to human TAF4 (hTAFII130); TAF-4 is predicted to be a component of the TFIID mRNA transcription complex and is generally required for early embryonic mRNA transcription; consistent with this observation, taf-4(RNAi) results in embryonic lethality at the ~100-cell stage with little cell differentiation, similar to the loss of AMA-1/RNA polymerase II activity; TAF-4 is detected in nuclei in the adult germline, oocytes, and embryo, from the 2-cell stage through early morphogenesis.
8btb-12ZC204.3n/achrII 1,655,685C. elegans BTB-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
9W10G11.3W10G11.3n/achrII 3,562,186contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
10clec-118W04H10.4n/achrII 610,423C. elegans CLEC-118 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
11ZK154.5ZK154.5n/achrX 7,785,505contains similarity to Homo sapiens Isoform 4 of Target of Nesh-SH3 precursor; ENSEMBL:ENSP00000373190
12rhgf-2T08H4.1n/achrII 4,124,087C. elegans RHGF-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00621 RhoGEF domain contains similarity to Interpro domains IPR000219 (Dbl homology (DH) domain), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR015721 (Rho GTP exchange factor)
13W08F4.11W08F4.11n/achrII 593,637
14C18A3.2C18A3.2n/achrII 5,719,035contains similarity to Pfam domain PF02535 ZIP Zinc transporter contains similarity to Interpro domain IPR003689 (Zinc/iron permease)
15K05F6.4K05F6.4n/achrII 1,544,461This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
16H10E21.2H10E21.2n/achrIII 10,398contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
17hlh-3T24B8.6n/achrII 9,086,866hlh-3 encodes a basic helix-loop-helix transcription factor homologous to Drosophila Achaete-scute; in vitro, HLH-3 can heterodimerize, and bind an E-box-containing probe, with HLH-2, the C. elegans E/daughterless ortholog with which it is coexpressed in the nuclei of embryonic neuronal precursors.
18E02H9.1E02H9.1n/achrIII 2,468,952
19srh-148K08G2.5n/achrV 15,857,580C. elegans SRH-148 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20F53F8.1F53F8.1n/achrV 20,682,534The F53F8.1 gene encodes a homolog of human WT1, which when mutated leads to Wilms tumour (OMIM:194070).
21ZK1055.3ZK1055.3n/achrV 6,590,794
22C15C8.6C15C8.6n/achrV 12,750,756contains similarity to Ancylostoma duodenale NADH dehydrogenase subunit 2 (Fragment).; TR:Q8SKS9
23C15C7.6C15C7.6n/achrX 3,169,031contains similarity to Interpro domain IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5)
24fbxa-137T27B7.7n/achrV 2,280,414C. elegans FBXA-137 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
25irx-1C36F7.1n/achrI 9,538,707irx-1 encodes a homeodomain-containing protein that is most similar to members of the Iroquois subclass of TALE (three amino acid loop extension) superclass atypical homeodomain proteins; IRX-1 is predicted to function as a transcriptional regulator during development, but as loss of irx-1 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of irx-1 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
26ttb-1W03F9.5n/achrV 160,090C. elegans TTB-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00382 (Transcription factor TFIIB repeat) (2), PF08271 (TFIIB zinc-binding) contains similarity to Interpro domains IPR006670 (Cyclin), IPR000812 (Transcription factor TFIIB related), IPR011028 (Cyclin-like), IPR013763 (Cyclin-related), IPR013150 (Transcription factor TFIIB, cyclin-related), IPR013137 (Zinc finger, TFIIB-type)
27C43H6.4C43H6.4n/achrX 2,405,689
28srw-103ZK697.5n/achrV 1,718,354C. elegans SRW-103 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
29srw-117C44C3.6n/achrV 2,982,800C. elegans SRW-117 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
30ing-3Y51H1A.4n/achrII 13,879,211Y51H1A.4 is orthologous to the human gene P33ING1B (ING1; OMIM:601566), which when mutated leads to disease.
31srj-37F48G7.1n/achrV 639,279C. elegans SRJ-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32T21B4.3T21B4.3n/achrII 12,495,897contains similarity to Pfam domain PF01681 C6 domain contains similarity to Interpro domain IPR002601 (Protein of unknown function C6)
33srx-97F19B10.7n/achrII 3,667,915C. elegans SRX-97 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
34tsp-17C02F12.1n/achrX 3,682,658C. elegans TSP-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin)
35F54E7.6F54E7.6n/achrIII 5,660,439
36T05B4.10T05B4.10n/achrV 4,120,294contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
37pax-1K07C11.1n/achrV 8,225,481C. elegans PAX-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00292 'Paired box' domain contains similarity to Interpro domains IPR001523 (Paired box protein, N-terminal), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR009057 (Homeodomain-like)
38R10D12.7R10D12.7n/achrV 13,950,209contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
39F01G10.9F01G10.9n/achrIV 10,257,677contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
40M199.2M199.2n/achrIV 15,109,806contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
41Y53C12B.6Y53C12B.6n/achrII 9,723,099contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
42nhr-78F36A4.14n/achrIV 4,276,441C. elegans NHR-78 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
43str-82B0213.8n/achrV 3,975,447C. elegans STR-82 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
44F43C1.5F43C1.5n/achrIII 4,229,767contains similarity to Pfam domain PF02845 CUE domain contains similarity to Interpro domains IPR003892 (Ubiquitin system component Cue), IPR009060 (UBA-like)
45srd-40F17A2.12n/achrX 12,324,508C. elegans SRD-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46W03F11.5W03F11.5n/achrI 2,217,759n/a
47F49E12.8F49E12.8n/achrII 8,393,450contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0335; TR:O15044
48R04B3.2R04B3.2n/achrX 2,472,601The R04B3.2 gene encodes an ortholog of the human gene LYSOSOMAL GLYCOSYLASPARAGINASE (AGA; OMIM:208400), which when mutated leads to aspartylglucosaminuria (OMIM:208400).
49T06G6.5T06G6.5n/achrI 12,716,111contains similarity to Interpro domain IPR007087 (Zn-finger, C2H2 type)
50F53A2.3F53A2.3n/achrIII 13,338,285contains similarity to Streptococcus agalactiae Hypothetical protein.; TR:Q8E5X9