UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F48B9.2F48B9.26e-148chrX 2,173,341
2ttr-12F46B3.4n/achrV 20,603,550C. elegans TTR-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
3C56A3.3C56A3.3n/achrV 13,533,300C56A3.3 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that C56A3.3 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
4F41H10.2F41H10.2n/achrIV 5,381,978
5W05B10.3W05B10.3n/achrV 12,661,622contains similarity to Melanoplus sanguinipes entomopoxvirus ORF MSV209 putative vaccinia A21L homolog, similar to SW:P20996.; TR:Q9YVN3
6C32E8.1C32E8.1n/achrI 3,796,427contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
7F14H12.3F14H12.3n/achrX 4,344,919contains similarity to Pfam domain PF00090 Thrombospondin type 1 domain contains similarity to Interpro domains IPR008085 (Thrombospondin, subtype 1), IPR000884 (Thrombospondin, type I)
8lact-1F46H5.8n/achrX 7,259,241lact-1 encodes a beta-lactamase domain-containing protein.
9M01G12.2M01G12.2n/achrI 12,133,121contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
10F42G8.9F42G8.9n/achrIV 8,117,087
11F36D3.5F36D3.5n/achrV 16,512,428contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
12C49C8.1C49C8.1n/achrIV 8,655,687contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
13wrt-3F38E11.7n/achrIV 9,476,571wrt-3 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a Wart domain, and a region of low-complexity sequence; WRT-3 is expressed in the trinucleate pharyngeal gland cell g1 beginning at the three-fold stage of embryogenesis, in seam cells and hypodermis, and in single muscle cells and the distal tip cells of late stage larvae and adults; the Wart domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins; WRT-3 is required for normal growth to full size and locomotion; both of these requirements may reflect common defects in cholesterol-dependent hedgehog-like signalling or in vesicle trafficking.
14clec-155T04A8.3n/achrIII 4,684,119C. elegans CLEC-155 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
15C34C12.4C34C12.4n/achrIII 3,468,832contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein C4orf34; ENSEMBL:ENSP00000295958
16T23F6.1T23F6.1n/achrIV 12,720,397contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
17Y54G9A.4Y54G9A.4n/achrII 13,714,353contains similarity to Pfam domain PF02535 ZIP Zinc transporter contains similarity to Interpro domain IPR003689 (Zinc/iron permease)
18F26A3.5F26A3.5n/achrI 7,669,167contains similarity to Clostridium tetani Conserved protein.; TR:Q890T1
19C10A4.1C10A4.1n/achrX 7,417,182contains similarity to Pfam domain PF05699 hAT family dimerisation domain contains similarity to Interpro domain IPR008906 (HAT dimerisation)
20R05A10.7R05A10.7n/achrIV 14,161,499contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
21C36H8.1C36H8.1n/achrIV 12,743,886contains similarity to Pfam domains PF03134 (TB2/DP1, HVA22 family) , PF00635 (MSP (Major sperm protein) domain) contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000535 (Major sperm protein), IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
22M117.4M117.4n/achrIV 11,832,142contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
23B0280.11B0280.11n/achrIII 7,137,323contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
24Y39A1A.14Y39A1A.14n/achrIII 10,649,949contains similarity to Pfam domain PF03587 Nep1 ribosome biogenesis protein contains similarity to Interpro domain IPR005304 (Suppressor Mra1)
25clec-152F10F2.6n/achrIII 4,633,383C. elegans CLEC-152 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
26T10E9.3T10E9.3n/achrI 6,536,631contains similarity to Pfam domain PF03351 DOMON domain contains similarity to Interpro domains IPR005018 (DOMON related), IPR013050 (DOMON)
27elo-7F56H11.3n/achrIV 9,530,584The elo-7 gene encodes a paralog of elo-1 and elo-2, each of which encodes a polyunsaturated fatty acid (PUFA) elongase; ELO-7 has no known function in vivo.
28srg-56C24B9.10n/achrV 2,736,901C. elegans SRG-56 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
29fbxa-90Y102A5C.19n/achrV 16,967,704This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
30K11C4.1K11C4.1n/achrV 6,897,709contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
31cyp-14A1K09A11.2n/achrX 13,266,131C. elegans CYP-14A1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
32sre-42Y57A10B.4n/achrII 12,385,670C. elegans SRE-42 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR001356 (Homeobox)
33marc-6F55A3.1n/achrI 10,803,251C. elegans MARC-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
34tre-4F15A2.2n/achrX 13,473,950C. elegans TRE-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01204 Trehalase contains similarity to Interpro domains IPR001661 (Glycoside hydrolase, family 37), IPR000886 (Endoplasmic reticulum, targeting sequence), IPR008928 (Six-hairpin glycosidase-like)
35C38C6.5C38C6.5n/achrII 14,631,497contains similarity to Interpro domain IPR001574 (Ribosome-inactivating protein)
36fbxa-96H03G16.4n/achrX 15,059,361This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
37H12D21.5H12D21.5n/achrV 14,894,419contains similarity to Interpro domains IPR001307 (Thiosulfate sulfurtransferase), IPR000463 (Cytosolic fatty-acid binding protein), IPR001763 (Rhodanese-like)
38R09B5.12R09B5.12n/achrV 1,455,855contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core)
39sre-1B0495.1n/achrII 7,710,540sre-1 encodes a putative seven transmembrane chemoreceptor; an SRE-1::GFP reporter is expressed in the ADL and ASJ amphid sensory neurons.
40C55A6.7C55A6.7n/achrV 11,519,888contains similarity to Interpro domains IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
41abt-1C24F3.5n/achrIV 10,210,507abt-1 encodes a predicted ATP-binding cassette (ABC) transporter that is a member of the ABCA subfamily of transport proteins; ABT-1 is predicted to function as a transmembrane protein that couples energy to transport of various molecules across membranes, but as loss of abt-1 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of abt-1 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
42srj-39F38H12.1n/achrV 4,105,406C. elegans SRJ-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43pad-1Y18D10A.13n/achrI 12,890,677The pad-1 gene encodes a highly conserved, but unfamiliar, protein that is required for embryonic development.
44aman-3F48C1.1n/achrI 5,327,364aman-3 encodes a Co(II)-activated alpha-mannosidase II, orthologous to human MAN2C1; AMAN-3 is predicted to remove mannose residues from the N-linked oligosaccharides of glycoproteins; AMAN-3 contains three predicted N-glycosylation sites; AMAN-3 is biochemically active in vitro, with a pH optimum of 6.5; AMAN-3 requires either Co(II) or Mn(II) for activity, preferring the former ion; since aman-2(tm1078) mutants almost completely lack paucimannosidic glycans, the function of AMAN-3 in vivo is unclear.
45F59A3.7F59A3.7n/achrI 5,517,931
46sri-36F33H12.5n/achrII 2,584,688C. elegans SRI-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47srz-45Y6G8.1n/achrV 17,593,282C. elegans SRZ-45 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
48Y39A1A.18Y39A1A.18n/achrIII 10,692,438contains similarity to Methanosarcina mazei Transcriptional regulator, MerR family.; TR:Q8PSB2
49W01B6.4W01B6.4n/achrIV 10,075,527contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000173 (Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase)
50W03A5.2W03A5.2n/achrIII 5,407,000W03A5.2 is orthologous to the human gene UNKNOWN (PROTEIN FOR MGC:19580) (GGCX; OMIM:137167), which when mutated leads to disease.