UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1fkh-8F40H3.40chrII 6,190,440fkh-8 encodes one of 15 C. elegans forkhead transcription factors; loss of fkh-8 activity via RNAi has been reported to result in either no defects or a weakly penetrant aldicarb resistance phenotype; an FKH-8 reporter fusion is expressed in nerve cells in the head and tail ganglia of both males and hermaphrodites with expression beginning in the later stages of embryogenesis and continuing through adulthood.
2T10B5.4T10B5.4n/achrV 1,871,195contains similarity to Pfam domain PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family contains similarity to Interpro domains IPR000182 (GCN5-related N-acetyltransferase), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
3C05E11.3C05E11.3n/achrX 4,580,554contains similarity to Mus musculus Lysosomal-associated transmembrane protein 4A (Golgi 4-transmembranesspanning transporter) (Mouse transporter protein) (MTP).; SW:Q60961
4M03F8.6M03F8.6n/achrV 5,954,355contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
5gpa-7R10H10.5n/achrIV 10,406,114gpa-7 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases that affects egg laying and response to water- soluble odorants; it is expressed in excitable cells.
6F41C3.6F41C3.6n/achrII 4,735,969
7F25D1.2F25D1.2n/achrV 10,531,704contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
8C43H6.3C43H6.3n/achrX 2,408,512contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
9C50F2.8C50F2.8n/achrI 3,903,318contains similarity to Pfam domains PF00018 (SH3 domain) , PF00625 (Guanylate kinase) contains similarity to Interpro domains IPR008144 (Guanylate kinase), IPR008145 (Guanylate kinase/L-type calcium channel region), IPR001452 (Src homology-3), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
10lim-7C04F1.3n/achrI 5,721,019lim-7 encodes a LIM homeodomain protein; a lim-7 mutation can result in lethality or sterility; lim-7 reporter fusion are specifically expressed in the somatic gonadal sheath cells during the L4 larval stage and continuing through adulthood.
11T02G5.2T02G5.2n/achrII 7,095,853contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR001023 (Heat shock protein Hsp70)
12K12H6.7K12H6.7n/achrII 2,835,833
13Y48E1B.11Y48E1B.11n/achrII 13,596,085
14srbc-16C45H4.1n/achrV 2,182,614C. elegans SRBC-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
15F30B5.7F30B5.7n/achrIV 4,230,520contains similarity to Pfam domain PF02535 ZIP Zinc transporter contains similarity to Interpro domain IPR003689 (Zinc/iron permease)
16fbxb-101Y63D3A.3n/achrI 14,088,963C. elegans FBXB-101 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
17unc-42F58E6.10n/achrV 9,766,975unc-42 encodes a paired-like homeodomain protein of the Q50 class; UNC-42 is required to specify the fate of ASH sensory neurons, AVA, AVD, and AVE interneurons, and a subset of motor neurons; unc-42 mutants fail to express cell-surface receptors required for differentiated neuronal function (sra-6, srb-6, glr-1, glr-5, and glr-6); UNC-42 is also required for AVKR and HSNL growth cones to follow the PVPR and PVQL pioneer axons, for axonal outgrowth in the backward command interneurons AVA, AVD, and AVE, and for inhibition of ectopic FMRFamide-positive and GABAergic axons; unc-42 mutants are defective in mechanosensation, backward motion, and regulation of egg-laying.
18glb-4C09H10.8n/achrII 11,110,315glb-4 encodes a globin; glb-4 transcription is higher in L3 and dauers than in young adults; glb-4 is required for embryonic viability, fertility, vulval development, and normal distal tip cell migration in mass RNAi assays.
19R08C7.1R08C7.1n/achrIV 4,451,940
20F37C12.1F37C12.1n/achrIII 7,186,028contains similarity to Pfam domain PF04502 Family of unknown function (DUF572) contains similarity to Interpro domain IPR007590 (Protein of unknown function DUF572)
21F53G2.1F53G2.1n/achrII 2,492,698contains similarity to Interpro domain IPR001611 (Leucine-rich repeat)
22lin-32T14F9.5n/achrX 2,229,639lin-32 encodes a basic helix-loop-helix transcription factor that is required for development of several types of neurons, including the touch receptor neurons and the male sensory ray neurons.
23str-118F57A8.3n/achrV 10,052,955C. elegans STR-118 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24unc-119M142.1n/achrIII 10,907,547unc-119 encodes a novel protein that is highly conserved amongst metazoans; unc-119 activity is required for proper development of the nervous system, including axonal branching and fasciculation, and hence, for normal movement, chemosensation, and feeding; unc-119 is expressed pan-neuronally beginning in the early embryo (~60 cells) and continuing through adulthood; although the molecular function of UNC-119 is not yet known, human UNC119, which can rescue C. elegans unc-119 mutant animals, is reported to function as a receptor-associated activator of signal transduction; thus, UNC-119 may be part of a signal transduction pathway that mediates axonal patterning in response to external developmental cues.
25Y51A2B.2Y51A2B.2n/achrV 18,375,467contains similarity to Pfam domain PF04789 Protein of unknown function (DUF621) contains similarity to Interpro domain IPR006874 (Protein of unknown function DUF621)
26sdz-19F45E6.6n/achrX 12,502,884C. elegans SDZ-19 protein ;
27C35A11.3C35A11.3n/achrV 5,374,943contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein MUC5AC (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000371671
28clec-18F56H6.8n/achrI 12,302,280C. elegans CLEC-18 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
29T04F8.3T04F8.3n/achrX 11,658,991contains similarity to Staphylococcus phage 44AHJD Hypothetical protein.; TR:Q859L9
30F26D2.13F26D2.13n/achrV 16,435,139contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
31sto-6Y71H9A.2n/achrX 11,634,381C. elegans STO-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01145 SPFH domain / Band 7 family contains similarity to Interpro domains IPR001107 (Band 7 protein), IPR001972 (Stomatin)
32R05G6.5R05G6.5n/achrIV 7,509,013contains similarity to Pfam domain PF05186 Dpy-30 motif contains similarity to Interpro domains IPR001564 (Nucleoside diphosphate kinase, core), IPR007858 (Dpy-30)
33fbxa-153B0391.5n/achrV 15,608,029fbxa-153 encodes a protein with an N-terminal F-box domain and a C-terminal FTH domain; FBXA-153 has no obvious non-nematode orthologs; FBXA-153 shares N-terminal UNC-13 binding, and thus may share at least some functions, with ERI-1, W04D2.6, and Y55F3AM.13; FBXA-153 has no obvious function in mass RNAi assays.
34sdz-35ZC239.12n/achrII 3,208,304C. elegans SDZ-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
35F08B6.3F08B6.3n/achrI 6,759,203contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR008080 (Parvalbumin), IPR000886 (Endoplasmic reticulum, targeting sequence)
36F28B3.4F28B3.4n/achrI 4,937,314contains similarity to Pfam domain PF06464 DMAP1-binding Domain contains similarity to Interpro domains IPR010506 (DMAP1-binding), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
37coh-1K08A8.3n/achrX 7,470,222coh-1 encodes a RAD21 homolog that affects embryonic viability and is believed to affect cohesion of sister chromatids in somatic cells; expressed in the distal tip cells of the gonad, embryonic, and somatic cells
38T23F11.4T23F11.4n/achrIII 4,664,270contains similarity to Interpro domain IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
39kal-1K03D10.1n/achrI 14,135,394kal-1 encodes a cell surface protein that contains a WAP-type protease inhibitor domain and Type III fibronectin domains and is the C. elegans ortholog of human KAL-1, mutated in the X-linked form of the neurological disorder Kallmann syndrome; in C. elegans, both kal-1 loss-of-function mutations and kal-1 overexpression result in similar phenotypes that indicate KAL-1 activity is required for epithelial morphogenesis and axon branching; kal-1 transcriptional reporters reveal expression beginning in the 50-cell stage embryo in 2-3 cells with later embryonic expression in at least 8-10 AB-derived ventral neuroblasts that are a substrate for migrating epidermal cells during ventral enclosure; later expression in larvae and adults is restricted to anterior neurons, including AIY, AIZ, RID, M5, ASI, and labial sensory neurons, ventral nerve cord motorneurons, midbody neurons HSN, CAN, and PVM, tail neurons DVB, DVC, and PDB, and the nonneuronal excretory cell as well as in uterine muscles; in the AIY interneurons, kal-1 is part of a gene battery whose expression is under the control of the CEH-10 and TTX-3 Paired and LIM-type homeodomains, respectively.
40C50B6.9C50B6.9n/achrV 13,337,122contains similarity to Rattus norvegicus Abhydrolase domain-containing protein 10, mitochondrial precursors(EC 3.4.-.-).; SW:Q5I0K5
41dyf-8C43C3.3n/achrX 9,700,112dyf-8 encodes a protein predicted to form a cell-surface ligand with a zona pellucida domain; DYF-8 is required for permeability of amphid and phasmid neurons to external dyes, chemotaxis to ammonium chloride, avoidance of high osmotic stimuli, male mating, and dauer formation.
42K04G11.4K04G11.4n/achrX 14,351,065contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001680 (WD40 repeat), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR001632 (G-protein, beta subunit), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
43R160.6R160.6n/achrX 4,372,098
44ZC190.6ZC190.6n/achrV 8,675,924
45rsr-1F28D9.1n/achrI 11,179,945C. elegans RSR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01480 PWI domain contains similarity to Interpro domains IPR002483 (Splicing factor PWI), IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5), IPR002185 (Dopamine D4 receptor)
46ZK112.5ZK112.5n/achrIII 7,738,805
47rom-2C48B4.2n/achrIII 9,593,829C. elegans ROM-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF01694 (Rhomboid family) , PF00036 (EF hand) contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR002610 (Peptidase S54, rhomboid), IPR017213 (Peptidase S54, rhomboid, metazoan)
48F57C9.6F57C9.6n/achrI 4,823,394contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
49F56C3.4F56C3.4n/achrX 1,360,874
50F16H11.2F16H11.2n/achrX 4,662,854contains similarity to Tetrahymena thermophila SB210 Putative uncharacterized protein.; TR:Q23LR2