UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F39E9.6F39E9.62e-31chrII 3,311,104F39E9.6 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F39E9.6 has no clear orthologs in other organisms.
2F55C12.6F55C12.6n/achrII 5,875,271contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
3F55D12.2F55D12.2n/achrI 7,892,099contains similarity to Interpro domains IPR002017 (Spectrin repeat), IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal)
4srj-11T28A11.12n/achrV 3,242,029C. elegans SRJ-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5F29D10.3F29D10.3n/achrI 8,844,238contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold)
6T28A11.20T28A11.20n/achrV 3,272,236T28A11.20 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; T28A11.20 has no clear orthologs in other organisms.
7nspc-9F42F12.1n/achrX 12,343,078C. elegans NSPC-9 protein ;
8F55A4.4F55A4.4n/achrX 1,025,409contains similarity to Pfam domain PF00035 Double-stranded RNA binding motif contains similarity to Interpro domains IPR001159 (Double-stranded RNA binding), IPR014720 (Double-stranded RNA-binding-like)
9nhr-177F16B4.1n/achrV 1,611,519C. elegans NHR-177 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
10glb-7C23H5.2n/achrIV 2,124,416glb-7 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
11mdt-1.2T23C6.1n/achrX 17,152,950C. elegans MDT-1.2 protein ;
12T08D2.8T08D2.8n/achrX 196,174contains similarity to Pfam domain PF02985 HEAT repeat contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000357 (HEAT), IPR016024 (Armadillo-type fold)
13nhr-266F56H1.2n/achrI 5,738,931C. elegans NHR-266 protein; contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
14twk-44Y71H9A.1n/achrX 11,625,639C. elegans TWK-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B), IPR013099 (Ion transport 2)
15W06A11.2W06A11.2n/achrII 4,060,321
16F09A5.3F09A5.3n/achrX 13,151,561contains similarity to Plasmodium falciparum Normocyte-binding protein 1.; TR:Q8WRS5
17srw-22T10H4.3n/achrV 15,269,194C. elegans SRW-22 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
18C43F9.7C43F9.7n/achrIV 10,593,293contains similarity to Xanthomonas campestris Hypothetical protein XCC1495.; TR:Q8PAI8
19T14E8.2T14E8.2n/achrX 6,542,867contains similarity to Interpro domain IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich)
20F54D10.9F54D10.9n/achrII 3,830,742contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
21T23H2.4T23H2.4n/achrI 6,455,456
22acr-14T05C12.2n/achrII 8,175,996acr-14 encodes a protein that contains neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding and transmembrane domains.
23nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
24sri-12T22H2.1n/achrI 11,700,163C. elegans SRI-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25srx-111T24E12.4n/achrII 3,758,519C. elegans SRX-111 protein ;
26C47F8.6C47F8.6n/achrI 12,320,092contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
27ZK858.2ZK858.2n/achrI 9,123,812contains similarity to Homo sapiens Selenoprotein V; ENSEMBL:ENSP00000333956
28srsx-11C13D9.4n/achrV 4,978,533C. elegans SRSX-11 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
29clec-50W04E12.8n/achrV 19,749,271C. elegans CLEC-50 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR000480 (Glutelin), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002353 (Type II antifreeze protein)
30F02D10.6F02D10.6n/achrX 13,450,586contains similarity to Cryptophlebia leucotreta granulosis virus Hypothetical protein.; TR:Q7T5R9
31Y39A1A.16Y39A1A.16n/achrIII 10,680,725This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
32fbxb-68F09C3.3n/achrI 14,286,378This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
33T08G5.1T08G5.1n/achrV 14,019,744contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein that may function as a cochaperone, as suggested by the presence of a DnaJ-like domain; SGD:YNL227C
34srg-69F09E5.4n/achrII 5,356,499C. elegans SRG-69 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
35C29G2.2C29G2.2n/achrV 2,590,606contains similarity to Homo sapiens Isoform 2 of Prothymosin alpha; HI:HIT000331385
36F40A3.7F40A3.7n/achrV 7,897,725contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
37F16H6.8F16H6.8n/achrV 18,214,941contains similarity to Mycoplasma capricolum CLPA/CLPB family (Fragment).; TR:Q49064
38K08H2.3K08H2.3n/achrX 13,237,815contains similarity to Rattus norvegicus Inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase C.; TR:Q80ZG2
39C13A2.5C13A2.5n/achrV 7,277,113contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
40sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41srsx-36T26E4.15n/achrV 15,808,853C. elegans SRSX-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
42K03D7.8K03D7.8n/achrV 17,490,522
43F26D2.15F26D2.15n/achrV 16,438,363contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
44srw-130T24A6.14n/achrV 3,547,931C. elegans SRW-130 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
45F36D1.5F36D1.5n/achrI 11,266,244contains similarity to Homo sapiens Melastatin 1; TR:O75560
46pcbd-1T10B11.1n/achrI 6,951,540T10B11.1 is orthologous to the human gene PTERIN-4-ALPHA-CARBINOLAMINE DEHYDRATASE (PCBD or TCF1; OMIM:126090), which when mutated leads to hyperphenylalaninemia with primapterinuria.
47H03E18.2H03E18.2n/achrX 8,514,766
48F38H4.10F38H4.10n/achrIV 11,861,497contains similarity to Pfam domain PF03637 Mob1/phocein family contains similarity to Interpro domain IPR005301 (Mob1/phocein)
49fkh-10C25A1.2n/achrI 10,164,375fkh-10 encodes one of 15 forkhead transcriptional regulators encoded by the C. elegans genome; by homology, FKH-10 is predicted to function as a transcription factor that regulates gene expression during development; however, as loss of fkh-10 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, the precise role of FKH-10 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; nevertheless, reporter gene studies indicate that throughout larval and adult stages, fkh-10 expression is detected almost exclusively in six pairs of neuronal nuclei near the terminal bulb of the pharynx, suggesting that FKH-10 may have a specific function in neuronal differentiation.
50C36C9.1C36C9.1n/achrX 1,684,665contains similarity to Dictyostelium discoideum Similar to Homo sapiens (Human). Dentin sialophosphoprotein [Contains:sDentin phosphoprotein (Dentin phosphophoryn) (DPP); Dentinssialoprotein (DSP)].; TR:Q869X8