UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F36H12.17F36H12.171e-95chrIV 5,277,187
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3C41D11.3C41D11.3n/achrI 4,430,732contains similarity to Interpro domain IPR001041 (Ferredoxin)
4T21H3.5T21H3.5n/achrV 1,159,760
5ZK470.4ZK470.4n/achrX 4,139,617
6R119.5R119.5n/achrI 391,462contains similarity to Pfam domain PF01135 Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase (PCMT) contains similarity to Interpro domain IPR000682 (Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase)
7H03G16.1H03G16.1n/achrX 15,054,187contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
8srw-14C41G6.8n/achrV 15,226,687C. elegans SRW-14 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000975 (Interleukin-1)
9F19G12.3F19G12.3n/achrX 1,425,941contains similarity to Pfam domain PF02170 PAZ domain contains similarity to Interpro domain IPR003100 (Argonaute and Dicer protein, PAZ)
10Y39F10A.2Y39F10A.2n/achrII 780,543contains similarity to Pfam domain PF06079 Apyrase contains similarity to Interpro domain IPR009283 (Apyrase)
11srw-26T05G11.3n/achrV 15,931,865C. elegans SRW-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
12srw-73T03E6.6n/achrV 16,587,756C. elegans SRW-73 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
13F17C11.6F17C11.6n/achrV 10,955,512contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q9ZT77
14srh-48C06C3.6n/achrII 9,384,056C. elegans SRH-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15F44F1.2F44F1.2n/achrI 13,253,455
16str-108F10A3.13n/achrV 16,166,795C. elegans STR-108 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17Y32B12C.1Y32B12C.1n/achrV 16,607,269contains similarity to Interpro domain IPR002625 (Smr protein/MutS2 C-terminal)
18T05C1.5T05C1.5n/achrII 4,490,625contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
19C53B7.6C53B7.6n/achrX 6,868,654
20K04F1.13K04F1.13n/achrV 1,652,895contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
21str-119C13B7.5n/achrV 2,427,301C. elegans STR-119 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22tag-263C11E4.3n/achrX 9,590,518C. elegans TAG-263 protein; contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
23scl-18T12A7.3n/achrIV 11,754,015C. elegans SCL-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site)
24ncx-6C07A9.4n/achrIII 9,712,021ncx-6 encodes a putative Na[+]/Ca[2+] exchanger of uncertain stoichiometry and affinity, orthologous to human SLC24A6 and paralogous to NCX-7/-10; NCX-6 may function intracellularly; NCX-6 has tandem Calx-alpha domains predicted to carry out ion transport; NCX-6 has no obvious function in mass RNAi assays.
25str-190C18B10.7n/achrV 7,477,853C. elegans STR-190 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26srt-62T27C10.2n/achrI 10,900,411C. elegans SRT-62 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
27T04F3.4T04F3.4n/achrV 11,762,441contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
28C18D4.3C18D4.3n/achrV 17,532,536contains similarity to Acetobacter diazotrophicus FixX.; TR:Q9FA07
29C31H1.7C31H1.7n/achrIV 5,809,426
30F28A10.7F28A10.7n/achrII 845,493contains similarity to Interpro domain IPR013090 (Phospholipase A2, active site)
31srg-30W02F12.7n/achrV 6,717,559C. elegans SRG-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
32srv-34F13A7.3n/achrV 16,373,569C. elegans SRV-34 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000355 (Chemokine receptor)
33C10E2.4C10E2.4n/achrX 16,750,349
34nhr-271T03E6.3n/achrV 16,579,462C. elegans NHR-271 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
35sru-11Y45F10B.6n/achrIV 13,586,085C. elegans SRU-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
36str-170T08B6.7n/achrIV 4,878,848C. elegans STR-170 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37str-185R08C7.7n/achrIV 4,428,740C. elegans STR-185 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38mel-26ZK858.4n/achrI 9,134,137mel-26 encodes a MATH and BTB/POZ domain-containing protein that functions as a novel substrate-specific adaptor of the CUL-3-containing E3 ubiquitin ligase; MEL-26 is required maternally for formation of mitotic spindles in the early embryo, and as a component of a ubiquitin ligase complex, for degradation of the microtubule-severing protein MEI-1 at the meiosis to mitosis transition; MEL-26 is also required maternally for embryonic morphogenesis; since MEL-26 contains a meprin-associated Traf homology (MATH) domain, it might be involved in apoptosis.
39M153.3M153.3n/achrX 12,143,295contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
40T10E9.8T10E9.8n/achrI 6,540,502
41sri-65F13A7.8n/achrV 16,387,488C. elegans SRI-65 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000883 (Cytochrome c oxidase, subunit I)
42gcy-27C06A12.4n/achrIV 17,436,419C. elegans GCY-27 protein; contains similarity to Pfam domains PF00211 (Adenylate and Guanylate cyclase catalytic domain) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001054 (Adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
43cyp-25A6K06B9.1n/achrIV 4,197,909C. elegans CYP-25A6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR000044 (Mycoplasma lipoprotein (MG045))
44srh-38C31B8.11n/achrV 2,921,646C. elegans SRH-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45srx-137F09F3.13n/achrV 13,863,436C. elegans SRX-137 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
46T01H10.8T01H10.8n/achrX 12,134,602T01H10.8 encodes a BEACH domain-containing protein that is orthologous to the mammalian lysosomal trafficking regulator LYST which when mutated leads to Chediak-Higashi syndrome (CHS, OMIM:606897).
47W03H9.1W03H9.1n/achrII 14,148,639contains similarity to Pfam domain PF06918 Protein of unknown function (DUF1280) contains similarity to Interpro domain IPR009689 (Protein of unknown function DUF1280)
48srg-44F31E9.2n/achrV 17,329,671C. elegans SRG-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
49srw-53T05G11.7n/achrV 15,944,112C. elegans SRW-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
50C18A11.4C18A11.4n/achrX 8,046,427contains similarity to Interpro domain IPR000980 (SH2 motif)