UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F32B4.8F32B4.80chrI 11,504,367contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN)
2F56H6.1F56H6.1n/achrI 12,281,908contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
3fbxb-48F45C12.13n/achrII 1,718,632C. elegans FBXB-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
4F32D8.3F32D8.3n/achrV 10,887,380F32D8.3 encodes a putative secreted TIL-domain protease inhibitor paralogous to SWM-1, ISL-1, and the products of 11 other C. elegans genes; F32D8.3 and its relatives are collectively similar to other TIL-domain protease inhibitors from nematodes, insects, and vertebrates; F32D8.3 has no obvious function in mass RNAi assays.
5C06E1.8C06E1.8n/achrIII 8,596,527contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
6ZK673.4ZK673.4n/achrII 10,453,965ZK673.4 encodes a protein with a THAP or THAP-like domain; other proteins with such domains include LIN-15A, LIN-15B, LIN-36, and HIM-17 (which all interact with LIN-35/Rb), as well as CDC-14B, CTB-1, GON-14, and ~100 other proteins such as Drosophila P element transposase and human nuclear proapoptotic factor THAP1.
7nhr-18F44C8.3n/achrV 2,228,092The nhr-18 gene encodes a member of the superfamily of nuclear receptors, which is one of the most abundant class of transcriptional regulators; nuclear receptors have a well conserved DNA binding domain and a less conserved C-terminal ligand binding domain; the human homolog of nhr-18, CYP21, when mutated leads to congenital adrenal hyperplasia (OMIM:201910).
8C11D2.1C11D2.1n/achrIV 6,191,401
9F35E8.13F35E8.13n/achrV 15,925,673contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
10nhr-211T01G6.5n/achrV 488,034C. elegans NHR-211 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
11skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
12pap-1Y32F6A.3n/achrV 10,444,197pap-1 encodes a poly (A) polymerase; large-scale RNAi screens indicate that PAP-1 activity is essential for reproduction, embryonic and larval development, proper body morphology, normal rates of growth, and coordinated locomotion.
13T10B11.2T10B11.2n/achrI 6,934,027contains similarity to Pfam domain PF00781 Diacylglycerol kinase catalytic domain (presumed) contains similarity to Interpro domain IPR001206 (Diacylglycerol kinase, catalytic region)
14clec-59ZK666.5n/achrII 10,478,656C. elegans CLEC-59 protein; contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
15srw-15C41G6.3n/achrV 15,231,194C. elegans SRW-15 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
16str-262C05E4.13n/achrV 752,054C. elegans STR-262 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17T15B7.11T15B7.11n/achrV 6,816,458contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
18tag-199F45E4.4n/achrIV 7,612,783C. elegans TAG-199 protein ; contains similarity to Trypanosoma brucei Putative uncharacterized protein.; TR:Q4GZ45
19try-2C07G1.1n/achrIV 8,213,133try-2 encodes a homolog of human TRYP1 and ELA2; mutation of human TRYP1 or ELA2 leads, respectively, to hereditary pancreatitis (OMIM:276000) or cyclic haematopoiesis (OMIM:162800).
20C13F10.6C13F10.6n/achrV 7,220,078
21T25C8.1T25C8.1n/achrIII 13,611,268contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR000577 (Carbohydrate kinase, FGGY)
22srx-56C03G6.2n/achrV 7,374,979C. elegans SRX-56 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
23F23F1.6F23F1.6n/achrII 36,279contains similarity to Pfam domain PF00324 Amino acid permease contains similarity to Interpro domains IPR004755 (Cationic amino acid transport permease), IPR004841 (Amino acid permease-associated region), IPR002293 (Amino acid/polyamine transporter I)
24srz-100T25E12.11n/achrV 16,732,494C. elegans SRZ-100 protein ;
25C50H2.4C50H2.4n/achrV 9,917,432contains similarity to Arabidopsis thaliana Putative cytochrome P450.; TR:Q9LQ26
26skr-16C42D4.6n/achrIV 7,169,011The skr-16 gene encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae that has no known function in vivo, since skr-16(RNAi) animals are at least superficially normal.
27pld-1C04G6.3n/achrII 5,087,755C. elegans PLD-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00169 (PH domain) , PF00614 (Phospholipase D Active site motif) (2), PF00787 (PX domain) contains similarity to Interpro domains IPR016555 (Phospholipase D, eukaryota), IPR001683 (Phox-like), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR001736 (Phospholipase D/Transphosphatidylase), IPR015679 (Phospholipase D)
28F07A11.1F07A11.1n/achrII 11,589,926contains similarity to Homo sapiens Trichohyalin; ENSEMBL:ENSP00000357794
29F21F8.2F21F8.2n/achrV 8,275,167contains similarity to Pfam domain PF00026 Eukaryotic aspartyl protease contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001461 (Peptidase A1)
30Y6E2A.5Y6E2A.5n/achrV 15,717,512contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domain IPR007883 (Protein of unknown function DUF713)
31acbp-5T12D8.3n/achrIII 13,640,695C. elegans ACBP-5 protein; contains similarity to Pfam domains PF00023 (Ankyrin repeat) (2), PF00887 (Acyl CoA binding protein) contains similarity to Interpro domains IPR014352 (FERM/acyl-CoA-binding protein, 3-helical bundle), IPR002110 (Ankyrin), IPR000582 (Acyl-CoA-binding protein, ACBP)
32pde-5C32E12.2n/achrI 5,198,010C. elegans PDE-5 protein; contains similarity to Pfam domains PF01590 (GAF domain) , PF00233 (3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase) contains similarity to Interpro domains IPR002073 (3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase), IPR003018 (GAF), IPR003607 (Metal-dependent phosphohydrolase, HD region)
33taf-3C11G6.1n/achrX 16,334,113taf-3 encodes the C. elegans ortholog of mammalian TAF3(TAFII140), a component of the RNA polymerase II TFIID transcription complex; TAF-3 contains a histone fold-like domain in its N-terminus and by homology, is predicted to function in transcriptional regulation; however, as loss of taf-3 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of taf-3 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
34C15B12.2C15B12.2n/achrX 6,464,379
35sra-25T26E3.9n/achrI 12,687,150C. elegans SRA-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
36twk-2T12C9.3n/achrII 4,447,199twk-2 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; the precise role of TWK-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known, but TWK-2 may function redundantly with other TWK channels; TWK-2 is expressed in a subset of neurons.
37aph-1VF36H2L.1n/achrI 9,232,806aph-1 encodes an unfamiliar protein predicted to have seven transmembrane domains; APH-1 is a component of the GLP-1/LIN-12 (Notch) pathway, is required maternally for embryonic viability, and also affects morphogenesis, egg laying, germ line proliferation, and translocation of APH-2 to the cell surface; with PEN-2, APH-1 is required for Notch pathway signaling, gamma-secretase cleavage of beta-amyloid precursor protein, and presenilin protein accumulation.
38Y51B9A.8Y51B9A.8n/achrII 9,399,270contains similarity to Pfam domains PF04942 (CC domain) (2), PF01549 (ShK domain-like) contains similarity to Interpro domains IPR007026 (Domian of unknown function, DUF-CC), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
39thoc-3F32H2.4n/achrI 8,972,046C. elegans THOC-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
40ztf-11F52F12.6n/achrI 9,907,414C. elegans ZTF-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF01530 Zinc finger, C2HC type contains similarity to Interpro domain IPR002515 (Zinc finger, C2HC-type)
41F14H12.8F14H12.8n/achrX 4,363,765
42ZK686.1ZK686.1n/achrIII 7,773,406contains similarity to Interpro domain IPR004038 (Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45)
43T14B4.8T14B4.8n/achrII 6,720,967
44srd-26T02B5.4n/achrV 14,162,174C. elegans SRD-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45F32D8.2F32D8.2n/achrV 10,884,916contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domain IPR004245 (Protein of unknown function DUF229)
46cyb-2.1Y43E12A.1n/achrIV 10,986,675C. elegans CYB-2.1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00134 (Cyclin, N-terminal domain) , PF02984 (Cyclin, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR006670 (Cyclin), IPR011028 (Cyclin-like), IPR013763 (Cyclin-related), IPR006671 (Cyclin, N-terminal), IPR004367 (Cyclin, C-terminal), IPR014400 (Cyclin, A/B/D/E)
47cyp-13A10ZK1320.4n/achrII 9,661,820C. elegans CYP-13A10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II)
48srab-17T11A5.2n/achrV 9,867,491C. elegans SRAB-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
49thk-1Y43C5A.5n/achrIV 10,280,490C. elegans THK-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00265 Thymidine kinase contains similarity to Interpro domain IPR001267 (Thymidine kinase)
50F47B8.6F47B8.6n/achrV 14,329,569contains similarity to Drosophila heteroneura Aminopeptidase N (Fragment).; TR:O61534