UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F29G6.1F29G6.10chrX 11,506,067contains similarity to Pfam domains PF00050 (Kazal-type serine protease inhibitor domain) (15), PF07648 (Kazal-type serine protease inhibitor domain) (16)contains similarity to Interpro domains IPR000118 (Granulin), IPR002350 (Proteinase inhibitor I1, Kazal), IPR003884 (Factor I membrane attack complex), IPR001239 (Proteinase inhibitor I1, Kazal metazoa), IPR011497 (Protease inhibitor, Kazal-type)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3C45G3.4C45G3.4n/achrI 9,219,134contains similarity to Dictyostelium discoideum Prespore-specific protein (Fragment).; TR:O97140
4B0410.1B0410.1n/achrX 2,894,901
5F46B3.8F46B3.8n/achrV 20,618,293contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
6ZC132.6ZC132.6n/achrV 4,309,736
7F46F5.15F46F5.15n/achrII 788,813
8ZK1073.1ZK1073.1n/achrX 16,126,525contains similarity to Pfam domain PF03096 Ndr family contains similarity to Interpro domain IPR004142 (Ndr)
9H35N09.2H35N09.2n/achrX 8,604,813
10F13E9.4F13E9.4n/achrIV 10,895,888contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domains IPR000775 (Bindin), IPR008119 (Dense granule Gra6 protein), IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
11T07A5.1T07A5.1n/achrIII 10,304,668contains similarity to Pfam domain PF06828 Fukutin-related contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
12magi-1K01A6.2n/achrIV 11,721,610C. elegans MAGI-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) (4), PF00397 (WW domain) (2), PF00625 (Guanylate kinase) contains similarity to Interpro domains IPR008144 (Guanylate kinase), IPR008145 (Guanylate kinase/L-type calcium channel region), IPR002349 (WW), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF), IPR001202 (WW/Rsp5/WWP)
13C43H6.6C43H6.6n/achrX 2,397,074contains similarity to Pfam domains PF00059 (Lectin C-type domain) , PF00431 (CUB domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
14M03D4.3M03D4.3n/achrIV 6,111,524
15B0205.10B0205.10n/achrI 10,709,574contains similarity to Interpro domains IPR000893 (Luteovirus ORF6 protein), IPR000694 (Proline-rich region)
16F25E2.1F25E2.1n/achrX 803,494contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
17Y39A1A.8Y39A1A.8n/achrIII 10,627,062contains similarity to Pfam domain PF03083 MtN3/saliva family contains similarity to Interpro domain IPR004316 (MtN3 and saliva related transmembrane protein)
18F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
19T28H10.1T28H10.1n/achrV 12,504,477contains similarity to Pfam domain PF01648 4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily contains similarity to Interpro domain IPR008278 (4'-phosphopantetheinyl transferase)
20Y116A8C.1Y116A8C.1n/achrIV 16,901,344contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
21nhr-158C17E7.6n/achrV 3,872,180C. elegans NHR-158 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
22C18E9.10C18E9.10n/achrII 8,959,611contains similarity to Pfam domain PF07770 SFT2-like protein contains similarity to Interpro domain IPR011691 (SFT2-like)
23C05D9.4C05D9.4n/achrX 1,108,239
24M02B1.2M02B1.2n/achrIV 12,846,951contains similarity to Melanoplus sanguinipes entomopoxvirus ORF MSV233 hypothetical protein.; TR:Q9YVK8
25srw-10ZC482.6n/achrIII 12,755,860C. elegans SRW-10 protein ;
26Y37E11B.7Y37E11B.7n/achrIV 3,599,789
27str-92F59A1.3n/achrV 17,675,766C. elegans STR-92 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28C32B5.3C32B5.3n/achrII 981,863
29grk-2W02B3.2n/achrIII 678,078grk-2 encodes a serine/threonine protein kinase that is most closely related to G protein-coupled receptor (GPCR) kinases; in C. elegans, grk-2 activity is required in chemosensory neurons for normal calcium influx during chemosensation, but is not required for GPCR downregulation; in regulating chemosensation, GRK-2 likely acts upstream of the ODR-3/G alpha protein, as overexpression of ODR-3 can rescue abnormal avoidance behavior in grk-2 mutants; GRK-2 is broadly expressed in the adult nervous system, with expression beginning as early as the 20-30-cell stage of embryonic development and continuing into adulthood.
30srt-4C29G2.4n/achrV 2,578,859C. elegans SRT-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
31srz-6T21B4.1n/achrII 12,492,894C. elegans SRZ-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
32C12D5.4C12D5.4n/achrV 7,672,548
33Y5F2A.3Y5F2A.3n/achrIV 11,069,794contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
34C17G1.1C17G1.1n/achrX 9,919,758contains similarity to Trypanosoma rangeli Kinetoplastid membrane protein 11.; TR:Q7YZC6
35C44E12.1C44E12.1n/achrX 7,598,320contains similarity to Pfam domains PF01546 (Peptidase family M20/M25/M40) , PF07687 (Peptidase dimerisation domain) contains similarity to Interpro domains IPR011650 (Peptidase M20, dimerisation), IPR002933 (Peptidase M20)
36C56G7.2C56G7.2n/achrIII 3,387,880This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
37C49F5.5C49F5.5n/achrX 11,986,477contains similarity to Pfam domain PF02135 TAZ zinc finger contains similarity to Interpro domain IPR000197 (Zinc finger, TAZ-type)
38clec-27Y102A5B.1n/achrV 16,855,370C. elegans CLEC-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
39srbc-15F15E11.10n/achrV 2,346,927C. elegans SRBC-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
40C17B7.12C17B7.12n/achrV 3,353,590
41K09C4.7K09C4.7n/achrX 3,272,932
42T02G6.1T02G6.1n/achrI 11,796,907contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I4U4
43T27F2.2T27F2.2n/achrV 11,633,391T27F2.2 encodes a homolog of human SIPA1/EHBP1L1 (OMIM:602180) and its paralogs.
44srx-79C01G10.2n/achrV 15,098,590C. elegans SRX-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
45F58G11.4F58G11.4n/achrV 13,674,239contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
46C17B7.8C17B7.8n/achrV 3,322,428C17B7.8 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; C17B7.8 has no clear orthologs in other organisms.
47nhr-241Y69H2.8n/achrV 18,700,186C. elegans NHR-241 protein
48F21E9.6F21E9.6n/achrX 1,356,015
49sre-39F10G7.7n/achrII 4,688,304C. elegans SRE-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
50Y54C5A.1Y54C5A.1n/achrII 4,140,997