UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1clec-156F26A1.112.0000000000000003e-120chrIII 4,842,010C. elegans CLEC-156 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3grd-8C37C3.4n/achrV 7,843,402grd-8 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central low-complexity proline-rich domain, and a C-terminal Ground domain; GRD-8 is expressed in larval intestine and neurons; the grd-8 gene is directly bound by DAF-12 and requires DAF-12 for full transcription; GRD-8's Ground domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins; GRD-8 is weakly required for normal molting; GRD-8 is also required for normal adult alae formation, growth to full size, locomotion, and male tail development; all of these requirements may reflect common defects in cholesterol-dependent hedgehog-like signalling or in vesicle trafficking.
4sru-35C33D9.4n/achrIV 8,789,328C. elegans SRU-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
5nhr-169C54C8.1n/achrI 12,443,002C. elegans NHR-169 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
6nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
7C56G7.3C56G7.3n/achrIII 3,391,206contains similarity to Pfam domain PF04727 ELMO/CED-12 family contains similarity to Interpro domain IPR006816 (Engulfment and cell motility, ELM)
8F18A12.6F18A12.6n/achrII 3,401,335F18A12.6 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F18A12.6 has no clear orthologs in other organisms.
9ZK402.2ZK402.2n/achrX 1,403,926contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
10fbxa-213Y37H2C.3n/achrV 18,268,033This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
11R07H5.10R07H5.10n/achrIV 11,214,469contains similarity to Pfam domain PF07716 Basic region leucine zipper contains similarity to Interpro domains IPR011700 (Basic leucine zipper), IPR004827 (Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor)
12hlh-4T05G5.2n/achrIII 9,738,064C. elegans HLH-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR015660 (Achaete-scute transcription factor related), IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR000694 (Proline-rich region), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
13lge-1K09C8.4n/achrX 10,968,138C. elegans LGE-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01501 Glycosyl transferase family 8 contains similarity to Interpro domain IPR002495 (Glycosyl transferase, family 8)
14F41E6.1F41E6.1n/achrV 8,624,595
15F15D3.8F15D3.8n/achrI 11,580,950contains similarity to Methanocaldococcus jannaschii Chromosome partition protein smc homolog.; SW:Q59037
16acr-21F27B3.2n/achrIII 6,584,504acr-21 encodes an alpha subunit of nicotinic acetylcholine receptor (nAChR); ACR-21 is a highly divergent member of the 'ACR-16' class of nAChR subunits, which includes ACR-7, ACR-9, ACR-10, ACR-11, ACR-14, ACR-15, ACR-16, and ACR-19, and is most closely related to the alpha-7 subunits of vertebrate nAChRs.
17srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18M04D8.5M04D8.5n/achrIII 10,032,724contains similarity to Periplaneta americana Large conductance calcium activated potassium channel pSlo spliceforms1-5A.; TR:Q8I9V1
19stdh-1C06B3.4n/achrV 13,907,215stdh-1 encodes a putative steroid dehydrogenase required for normally short lifespan; STDH-1 is orthologous to human HSD17B3 (OMIM:605573, mutated in pseudohermaphroditism), HSD17B12 (OMIM:609574), and HSDL1, and paralogous to LET-767 and STDH-2/-4; STDH-1 is expressed in larval intestine, and in both larval and adult body wall muscle and neurons.
20F59H6.2F59H6.2n/achrII 2,021,048
21F28F9.3F28F9.3n/achrIV 3,831,378
22F40G12.2F40G12.2n/achrV 14,260,215contains similarity to Interpro domain IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site)
23C51E3.6C51E3.6n/achrV 10,165,329contains similarity to Pfam domain PF00860 Permease family contains similarity to Interpro domain IPR006043 (Xanthine/uracil/vitamin C permease)
24F21A9.2F21A9.2n/achrI 3,707,420contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
25gly-15C54C8.11n/achrI 12,463,985gly-15 encodes a protein similar to 2/I N-acetylglucosaminyltransferase; gly-15 expressed only in cellular processes that are probably part of the secretory network of the G2 gland cells.
26srt-25C16D9.7n/achrV 8,257,371C. elegans SRT-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
27T19D2.3T19D2.3n/achrX 3,939,726
28F47G6.2F47G6.2n/achrI 1,475,611contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
29T20G5.4T20G5.4n/achrIII 10,213,504contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
30srw-66Y57G7A.4n/achrII 1,270,733C. elegans SRW-66 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
31F16F9.1F16F9.1n/achrX 8,448,780contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
32C45G9.8C45G9.8n/achrIII 5,052,953
33B0041.1B0041.1n/achrI 4,665,314
34K09H11.4K09H11.4n/achrV 5,724,796contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2839-PA;; FLYBASE:CG2839
35fbxa-155C05B5.6n/achrIII 10,008,970C. elegans FBXA-155 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
36srw-23F49A5.8n/achrV 16,874,669C. elegans SRW-23 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
37C01A2.6C01A2.6n/achrI 13,382,132contains similarity to Dictyostelium discoideum Putative uncharacterized protein.; TR:Q54BK4
38H40L08.3H40L08.3n/achrX 15,073,031contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Viral A-type inclusion protein, putative.; TR:A2EJ43
39F35D11.1F35D11.1n/achrII 4,627,370
40T22E5.6T22E5.6n/achrX 6,415,238contains similarity to Interpro domain IPR002016 (Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial)
41C18F10.2C18F10.2n/achrIII 6,274,532contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Sporulation-specific protein 15.; SW:Q10411
42col-132C39E9.9n/achrIV 13,090,324C. elegans COL-132 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
43Y57G7A.1Y57G7A.1n/achrII 1,299,102
44F56F3.3F56F3.3n/achrIII 4,458,938contains similarity to Drosophila dasycnemia Wingless (Fragment).; TR:O46305
45srsx-38T26E4.14n/achrV 15,806,689C. elegans SRSX-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
46F56D5.9F56D5.9n/achrIV 9,420,446contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR001357 (BRCT)
47srh-212T22F3.6n/achrV 3,596,155C. elegans SRH-212 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001463 (Sodium:alanine symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48T08G3.7T08G3.7n/achrV 16,464,369contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
49clec-39T25E12.7n/achrV 16,740,408C. elegans CLEC-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
50spe-38Y52B11A.1n/achrI 10,965,401C. elegans SPE-38 protein ;