UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F22F4.4F22F4.41.9999999999999998e-26chrX 6,000,544
2F55B11.4F55B11.4n/achrIV 14,430,213contains similarity to Interpro domain IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
3tag-347C25G4.4n/achrIV 12,453,128C. elegans TAG-347 protein; contains similarity to Pfam domains PF01342 (SAND domain) , PF02178 (AT hook motif) contains similarity to Interpro domains IPR000116 (High mobility group proteins HMG-I and HMG-Y), IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR010919 (SAND-like), IPR000770 (SAND)
4C06G4.4C06G4.4n/achrIII 7,977,442
5R11E3.1R11E3.1n/achrIV 4,790,837contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
6acl-13F08G5.2n/achrIV 12,411,312C. elegans ACL-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01553 Acyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002123 (Phospholipid/glycerol acyltransferase)
7F59A6.3F59A6.3n/achrII 5,009,745contains similarity to Interpro domains IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR016060 (Complement control module)
8C01H6.6C01H6.6n/achrI 7,223,298C01H6.6 encodes a predicted transmembrane protein orthologous to human ACDP1-ACDP4 and S. cerevisiae MAM3, and paralogous to C33D12.2, C52D10.12, M02F4.3, R04E5.2, and R13G10.4; by orthology with MAM3, C01H6.6 may participate in metal homoeostasis; C01H6.6, MAM3, and ACDP1-ACDP4 belong to a family of proteins (sharing an ACD domain) from bacteria, yeast, plants, and metazoa; murine Acdp1 is a plasma membrane protein; bacterial proteins containing the ACD domain include CorC from Salmonella typhimurium, which is involved in magnesium and cobalt efflux; C01H6.6 has no obvious function in RNAi assays.
9F49F1.8F49F1.8n/achrIV 4,132,560contains similarity to Pfam domain PF00098 Zinc knuckle contains similarity to Interpro domains IPR013084 (Zinc finger, CCHC retroviral-type), IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
10F22B3.8F22B3.8n/achrIV 11,423,572contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
11W07B8.3W07B8.3n/achrV 1,125,705
12Y49E10.4Y49E10.4n/achrIII 12,379,686contains similarity to Pfam domain PF00085 Thioredoxin contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR005788 (Disulphide isomerase), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
13K02B2.3K02B2.3n/achrIV 5,938,425contains similarity to Pfam domain PF04678 Protein of unknown function, DUF607 contains similarity to Interpro domain IPR006769 (Protein of unknown function DUF607)
14K11H3.2K11H3.2n/achrIII 9,846,887contains similarity to Homo sapiens Uveal autoantigen; ENSEMBL:ENSP00000314556
15F57G4.9F57G4.9n/achrV 17,644,291contains similarity to Xenopus laevis Putative uncharacterized protein.; TR:Q08AY0
16C17G10.3C17G10.3n/achrII 5,583,865
17K06A1.3K06A1.3n/achrII 6,442,625contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
18ZK1037.6ZK1037.6n/achrV 15,326,789contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
19C18H2.4C18H2.4n/achrIII 7,697,463C18H2.4 is orthologous to the human gene GLOMULIN (FAP48; OMIM:601749), which when mutated leads to disease.
20F26H9.8F26H9.8n/achrI 9,322,465contains similarity to Pfam domains PF01501 (Glycosyl transferase family 8) , PF06427 (UDP-glucose:Glycoprotein Glucosyltransferase) contains similarity to Interpro domains IPR000886 (Endoplasmic reticulum, targeting sequence), IPR009448 (UDP-glucose:Glycoprotein Glucosyltransferase), IPR002495 (Glycosyl transferase, family 8)
21W04A4.2W04A4.2n/achrI 13,683,368contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein FLJ90033; TR:Q8N2R3
22grl-22W03A5.3n/achrIII 5,413,566grl-22 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central proline-rich low-complexity region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
23T03F6.4T03F6.4n/achrIII 13,387,131contains similarity to Pfam domain PF00646 F-box domain contains similarity to Interpro domain IPR001810 (Cyclin-like F-box)
24Y37D8A.8Y37D8A.8n/achrIII 12,867,161contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
25lec-4C44F1.3n/achrIII 3,772,356lec-4 encodes a predicted galectin that exhibits sugar binding properties in vitro.
26F25E2.2F25E2.2n/achrX 808,888contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
27ncr-1F02E8.6n/achrX 4,476,155ncr-1 encodes a large transmembrane glycoprotein with a patched-like domain that is orthologous to human NPC1 (OMIM:257220, mutated in Niemann-Pick type C disease); NCR-1 and NPC1 are eukaryotic members of the resistance-nodulation-division (RND) family of membrane permeases, and have a putative sterol-sensing domain; by homology, NCR-1 is predicted to function in intracellular cholesterol and glycolipid trafficking; in C. elegans, NCR-1 is required for growth and survival in the absence of cholesterol, newly hatched ncr-1 mutant larvae grow poorly on cholesterol-free medium and die at the L1 or L2 stage; NCR-1 is also involved in negative regulation of dauer formation, being required redundantly with NCR-2, a second C. elegans NPC1-like protein, for preventing constitutive dauer formation; dauer formation in ncr-1; ncr-2 double mutants is suppressed by mutations in daf-12, which encodes a steroid hormone receptor, and by overexpression of daf-9, which encodes a cytochrome P450, suggesting that NCR-1 and NCR-2 may function to transport a sterol precursor that is metabolized by DAF-9 to then serve as the DAF-12 ligand.
28lgc-12R13A5.4n/achrIII 7,563,273C. elegans LGC-12 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
29F35E8.6F35E8.6n/achrV 15,912,576contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
30H05L14.1H05L14.1n/achrI 7,974,757contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
31F59B2.5F59B2.5n/achrIII 9,001,107contains similarity to Pfam domain PF01399 PCI domain contains similarity to Interpro domains IPR013143 (PCI/PINT associated module), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR000717 (Proteasome component region PCI)
32F42A9.3F42A9.3n/achrIV 8,617,701
33W04E12.7W04E12.7n/achrV 19,731,742contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
34F59A3.7F59A3.7n/achrI 5,517,931
35F54C9.3F54C9.3n/achrII 8,566,635contains similarity to Homo sapiens BA424I5.1; TR:Q9H4Q7
36R155.3R155.3n/achrIII 1,973,361contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR003016 (2-oxo acid dehydrogenase, lipoyl-binding site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
37C50C3.2C50C3.2n/achrIII 8,185,577contains similarity to Pfam domains PF00435 (Spectrin repeat) (4), PF00036 (EF hand) contains similarity to Interpro domains IPR002017 (Spectrin repeat), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
38B0454.6B0454.6n/achrII 3,034,446contains similarity to Pfam domain PF00324 Amino acid permease contains similarity to Interpro domains IPR004841 (Amino acid permease-associated region), IPR002293 (Amino acid/polyamine transporter I)
39Y39A1A.18Y39A1A.18n/achrIII 10,692,438contains similarity to Methanosarcina mazei Transcriptional regulator, MerR family.; TR:Q8PSB2
40exl-1F26H11.5n/achrII 14,412,734exl-1 encodes a putative chloride intracellular channel (CLIC) paralogous to EXC-4; transgenic EXL-1 can partially rescue the exc-4(rh133) mutant phenotype when its expression is driven with an exc-4 promoter; EXL-1 is localized to lysosomes in intestinal cells and coelomocytes, endoplasmic reticulum in coelomocytes, Golgi apparatus in muscle and the neurons PVD and CAN, plasma membrane in muscle arms, and to dense bodies linking muscle cytoskeleton to hypodermis through muscle cell membranes; EXL-1 has an N-terminal PTM domain required for its membrane targeting, and a C-terminal domain resembling omega-type glutathione-S-transferases; EXL-1 has no known function in vivo, and exl-1(ok857) mutants have no obvious phenotype.
41C38C6.5C38C6.5n/achrII 14,631,497contains similarity to Interpro domain IPR001574 (Ribosome-inactivating protein)
42F57G4.5F57G4.5n/achrV 17,642,359contains similarity to Mus musculus Dentin sialophosphoprotein precursor (Dentin matrix protein-3) (DMP-s3) [Contains: Dentin phosphoprotein (Dentin phosphophoryn) (DPP);sDentin sialoprotein (DSP)].; SW:DSPP_MOUSE
43nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
44F26A3.5F26A3.5n/achrI 7,669,167contains similarity to Clostridium tetani Conserved protein.; TR:Q890T1
45K07A1.4K07A1.4n/achrI 9,589,308contains similarity to Mycobacterium tuberculosis TcrZ protein (Fragment).; TR:Q50810
46F49E11.2F49E11.2n/achrIV 13,037,470contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
47F44D12.7F44D12.7n/achrIV 10,035,774contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
48rnh-1.1ZK1290.6n/achrII 7,526,915C. elegans RNH-1.1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00075 RNase H contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold), IPR002156 (Ribonuclease H)
49B0432.7B0432.7n/achrII 271,677contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
50C07G1.6C07G1.6n/achrIV 8,209,489