UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1hil-3F22F1.13e-37chrX 8,159,562C. elegans HIL-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00538 linker histone H1 and H5 family contains similarity to Interpro domains IPR003993 (Treacher Collins syndrome, treacle), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR005819 (Histone H5), IPR005818 (Histone H1/H5)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3C33D9.5C33D9.5n/achrIV 8,779,611C33D9.5 encodes a predicted coiled-coil protein; as loss of C33D9.5 activity via large-scale RNAi results in no obvious abnormalities, the precise role of C33D9.5 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
4C31H5.6C31H5.6n/achrI 9,045,096contains similarity to Pfam domains PF08840 (BAAT / Acyl-CoA thioester hydrolase C terminal) , PF04775 (Acyl-CoA thioester hydrolase / Bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase) contains similarity to Interpro domains IPR006862 (Acyl-CoA thioester hydrolase/bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase), IPR014940 (BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase C-terminal), IPR016662 (Acyl-CoA thioesterase, long chain)
5ceh-43C28A5.4n/achrIII 4,448,260A homeobox protein of the Distal-less (Dll) class that is required for development of the anterior hypdermis during embryonic morphogenesis for cell adhesion; also affects embryonic and larval viability; it is predominantly expressed in the head hypdodermis, neuronal support cells and CAN neurons.
6ppt-1F44C4.5n/achrV 6,625,504ppt-1 encodes the C. elegans palmitoyl protein thioesterase-1 ortholog; by homology PPT-1 is predicted to function in degradation of palmitoylated proteins and ppt-1 mutations result in loss of enzymatic activity from mixed-stage extracts; in C. elegans, ppt-1 activity is essential for mitochondrial organization and biogenesis in neuronal and muscle cells, as well as for proper timing of the onset of both the L4-to-adult molt and egg laying; ppt-1 is also required for normal egg-laying behavior and for a fully normal adult
7T19C3.3T19C3.3n/achrIII 612,715
8cut-3F22B5.3n/achrII 8,445,930C. elegans CUT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
9W04A8.4W04A8.4n/achrI 13,842,557contains similarity to Pfam domain PF01612 3'-5' exonuclease contains similarity to Interpro domains IPR002562 (3'-5' exonuclease), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
10F53C3.5F53C3.5n/achrII 3,900,316contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
11F20C5.6F20C5.6n/achrIV 8,772,362contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Viral A-type inclusion protein, putative.; TR:A2DLG0
12C05A9.2C05A9.2n/achrX 10,843,605contains similarity to Human adenovirus type 4 E3 29.7 kDa protein.; TR:Q8BEL2
13Y7A9D.1Y7A9D.1n/achrIV 16,381,762contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
14ins-2ZK75.2n/achrII 5,988,821ins-2 encodes an insulin-like peptide.
15clec-78F47C12.2n/achrIV 3,990,320C. elegans CLEC-78 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) (2), PF00059 (Lectin C-type domain) , PF00057 (Low-density lipoprotein receptor domain class A) contains similarity to Interpro domains IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002353 (Type II antifreeze protein)
16unc-129C53D6.2n/achrIV 9,004,103The unc-129 gene encodes a member of the TGF-beta family of secreted growth factor signaling molecules; UNC-129 is required for proper axonal guidance of commissural motorneurons and for proper migration of the distal tip cells of the somatic gonad; UNC-129 is expressed in dorsal body wall muscle and at present does not appear to act through the known TGF-beta type I and II receptors.
17ttr-20F36A4.8n/achrIV 4,246,321C. elegans TTR-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
18sri-74F33H12.4n/achrII 2,581,954C. elegans SRI-74 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000576 (Proton/sugar symporter, LacY)
19T26C12.3T26C12.3n/achrIV 3,273,332contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR013753 (Ras)
20ZC168.2ZC168.2n/achrIV 10,728,759contains similarity to Pfam domain PF01147 Crustacean CHH/MIH/GIH neurohormone family contains similarity to Interpro domain IPR001166 (Crustacean neurohormone)
21ZK418.3ZK418.3n/achrIII 7,070,514contains similarity to Homo sapiens Transmembrane protein 17; ENSEMBL:ENSP00000335094
22R07C3.11R07C3.11n/achrII 908,164
23W02A11.3W02A11.3n/achrI 12,739,603contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR000694 (Proline-rich region), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
24skr-21K08H2.1n/achrX 13,226,159The skr-21 gene encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae that has no known function in vivo, since skr-21(RNAi) animals are at least superficially normal.
25F10E7.1F10E7.1n/achrII 7,127,780contains similarity to Pfam domain PF06542 Protein of unknown function (DUF1114) contains similarity to Interpro domain IPR009497 (Protein of unknown function DUF1114)
26ZC443.2ZC443.2n/achrV 12,810,803contains similarity to Listeria innocua Hypothetical protein lin2372.; TR:Q929A5
27ZK675.4ZK675.4n/achrII 7,911,649contains similarity to Homo sapiens Nuclear pore glycoprotein p62; ENSEMBL:ENSP00000305503
28F57A8.1F57A8.1n/achrV 10,045,776contains similarity to Interpro domain IPR009058 ()
29F13C5.2F13C5.2n/achrX 595,125contains similarity to Pfam domains PF02178 (AT hook motif) , PF00439 (Bromodomain) contains similarity to Interpro domains IPR000116 (High mobility group proteins HMG-I and HMG-Y), IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR001487 (Bromodomain)
30fbxb-71F40F4.1n/achrX 3,263,537This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
31C49C3.8C49C3.8n/achrIV 17,335,930contains similarity to Interpro domains IPR006570 (SPK), IPR009057 (Homeodomain-like)
32C14A6.2C14A6.2n/achrV 18,151,568contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
33his-24M163.32e-21chrX 14,490,530The his-24 gene encodes a histone H1 isoform (H1.1) that is essential for chromatin silencing and germline development.
34F37A4.3F37A4.3n/achrIII 6,719,158
35ces-2ZK909.4n/achrI 14,963,425ces-2 encodes a basic region leucine-zipper (bZIP) transcription factor, most similar in sequence and binding specificity to the PAR (proline- and acid-rich) subfamily of bZIP proteins; ces-2 is required to activate programmed cell death in the sister cells of the serotoninergic neurosecretory motor (NSM) neurons, and is transcriptionally inhibited by activated LET-60(G12V).
36T27E4.1T27E4.1n/achrV 9,093,497contains similarity to Interpro domain IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB)
37T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
38T20F5.4T20F5.4n/achrI 3,914,059
39F53C3.3F53C3.3n/achrII 3,903,698contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
40lips-6ZK617.2n/achrIV 12,014,941C. elegans LIPS-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domains IPR002918 (Lipase, class 2), IPR008262 (Lipase, active site)
41EGAP4.1EGAP4.1n/achrX 8,727,142
42C33E10.1C33E10.1n/achrX 17,305,742This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
43W10D9.1W10D9.1n/achrII 454,887
44W02C12.1W02C12.1n/achrIV 4,011,101contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (10), PF07699 (GCC2 and GCC3) (4), PF07974 (EGF-like domain) (5), PF02494 (HYR domain) contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR003410 (Hyalin), IPR001791 (Laminin G), IPR001759 (Pentaxin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase), IPR003645 (Follistatin-like, N-terminal)
45C45B11.2C45B11.2n/achrV 11,043,313contains similarity to Pfam domain PF06441 ()
46F53C3.4F53C3.4n/achrII 3,902,067contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
47C31H5.5C31H5.5n/achrI 9,048,863contains similarity to Mus musculus Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 2 (Eukaryoticstranslation initiation factor 2 beta subunit) (eIF-2-beta).; SW:IF2B_MOUSE
48cut-6M142.2n/achrIII 10,913,915C. elegans CUT-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF00100 (Zona pellucida-like domain) , PF00092 (von Willebrand factor type A domain) contains similarity to Interpro domains IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
49B0294.1B0294.1n/achrX 1,897,093
50C17H1.4C17H1.4n/achrI 13,111,470contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Smooth muscle caldesmon, putative.; TR:A2FBI1