UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F21F8.2F21F8.23.0000000000000004e-75chrV 8,275,167contains similarity to Pfam domain PF00026 Eukaryotic aspartyl protease contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001461 (Peptidase A1)
2srh-167F57G8.3n/achrV 16,334,360C. elegans SRH-167 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3F22D3.5F22D3.5n/achrII 6,938,664
4srj-14C03G6.3n/achrV 7,371,464C. elegans SRJ-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5ZC190.10ZC190.10n/achrV 8,696,074
6D1014.4D1014.4n/achrV 8,134,170
7ZK1240.4ZK1240.4n/achrII 2,315,354
8T01C8.3T01C8.3n/achrX 16,781,536
9fbxa-145F48C1.2n/achrI 5,320,402This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
10F14H12.7F14H12.7n/achrX 4,362,080
11Y52B11A.8Y52B11A.8n/achrI 11,033,190contains similarity to Interpro domains IPR016090 (Phospholipase A2), IPR013090 (Phospholipase A2, active site)
12srx-39C03A7.6n/achrV 5,157,191C. elegans SRX-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF00001 (7 transmembrane receptor (rhodopsin family)) , PF01748 (Caenorhabditis serpentine receptor-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR013305 (ABC transporter, ABCB2), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
13C54G10.1C54G10.1n/achrV 14,641,219contains similarity to Homo sapiens similar to secreted gel-forming mucin; ENSEMBL:ENSP00000328427
14asna-2F47G3.2n/achrX 2,383,478C. elegans ASNA-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02374 Anion-transporting ATPase contains similarity to Interpro domain IPR003348 (Anion-transporting ATPase)
15srbc-26F40D4.7n/achrV 17,172,551C. elegans SRBC-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
16F37B12.3F37B12.3n/achrII 9,040,539contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
17F29C4.6F29C4.6n/achrIV 120,551contains similarity to Pfam domain PF01171 PP-loop family contains similarity to Interpro domains IPR011063 (PP-loop), IPR012089 (PP-loop ATPase, YdaO-related), IPR000541 (Protein of unknown function UPF0021), IPR014729 (Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold)
18T01G6.10T01G6.10n/achrV 502,683contains similarity to Pfam domains PF01370 (NAD dependent epimerase/dehydratase family) , PF00106 (short chain dehydrogenase) contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR001509 (NAD-dependent epimerase/dehydratase), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
19R11G11.14R11G11.14n/achrV 522,961contains similarity to Pfam domains PF04083 (ab-hydrolase associated lipase region) , PF00561 (alpha/beta hydrolase fold) contains similarity to Interpro domains IPR006693 (AB-hydrolase associated lipase region), IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR008262 (Lipase, active site)
20T27F6.4T27F6.4n/achrI 12,485,310contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Mid-Two Like 1; SGD:YGR023W
21C46A5.5C46A5.5n/achrIV 7,758,797
22C17H12.2C17H12.2n/achrIV 6,788,223contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG7289-PA;; FLYBASE:CG7289
23srsx-12C13D9.5n/achrV 4,980,446C. elegans SRSX-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
24B0250.4B0250.4n/achrV 20,456,958contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
25Y49E10.21Y49E10.21n/achrIII 12,458,332contains similarity to Nanoarchaeum equitans DNA double-strand break repair rad50 ATPase.; SW:P62135
26C46E10.8C46E10.8n/achrII 3,726,646contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR003604 (Zinc finger, U1-type), IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
27F59B10.2F59B10.2n/achrII 10,508,511contains similarity to Interpro domains IPR003993 (Treacher Collins syndrome, treacle), IPR005819 (Histone H5)
28Y57G7A.8Y57G7A.8n/achrII 1,291,464
29F35F10.10F35F10.10n/achrV 3,304,887contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
30B0564.2B0564.2n/achrIV 13,107,893contains similarity to Pfam domain PF03171 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily contains similarity to Interpro domain IPR005123 (2OG-Fe(II) oxygenase)
31F07H5.7F07H5.7n/achrII 8,793,642
32srg-5T12A2.11n/achrIII 6,263,078C. elegans SRG-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
33srz-78C09G12.3n/achrIV 3,492,493C. elegans SRZ-78 protein ;
34F28A10.5F28A10.5n/achrII 850,172contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
35C09H5.1C09H5.1n/achrV 8,082,547
36F52C6.4F52C6.4n/achrII 1,923,563contains similarity to Pfam domain PF00240 Ubiquitin family contains similarity to Interpro domain IPR000626 (Ubiquitin)
37B0238.7B0238.7n/achrV 5,261,699contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
38ubc-21C06E2.3n/achrX 8,870,667C. elegans UBC-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00179 Ubiquitin-conjugating enzyme contains similarity to Interpro domains IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2), IPR009060 (UBA-like), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like), IPR015940 (Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal, eukaryote)
39F15H10.6F15H10.6n/achrV 10,411,166contains similarity to Mycoplasma pneumoniae Oligopeptide transport ATP-binding protein oppF.; SW:OPPF_MYCPN
40C04E6.3C04E6.3n/achrV 5,920,241
41bath-27F14D2.1n/achrII 3,360,782C. elegans BATH-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
42F58E1.7F58E1.7n/achrII 1,678,353contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
43uev-3F26H9.7n/achrI 9,311,457uev-3 encodes a ubiquitin-conjugating enzyme (UBC or E2) variant that contains the UBC motif, but lacks the critical active-site cysteine residue necessary for catalytic activity; as loss of UEV-3 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of UEV-3 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; based on similarity to Saccharomyces cerevisiae and human proteins, however, UEV-3 may play a role in cell cycle control or response to stress or DNA damage.
44ZK795.1ZK795.1n/achrIV 12,551,089contains similarity to Pfam domain PF03770 Inositol polyphosphate kinase contains similarity to Interpro domain IPR005522 (Inositol polyphosphate kinase)
45AH10.2AH10.2n/achrV 14,157,204contains similarity to Plasmodium falciparum RIFIN.; TR:Q8I211
46Y37A1B.8Y37A1B.8n/achrIV 14,022,381contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
47R160.2R160.2n/achrX 4,376,697
48F26H9.4F26H9.4n/achrI 9,306,326contains similarity to Pfam domain PF01467 Cytidylyltransferase contains similarity to Interpro domains IPR005248 (Probable nicotinate-nucleotide adenylyltransferase), IPR014729 (Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold), IPR004820 (Cytidylyltransferase)
49math-7C16C4.12n/achrII 1,885,961C. elegans MATH-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
50B0563.5B0563.5n/achrX 9,146,762