UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F16G10.8F16G10.82e-102chrII 2,382,692contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
2jkk-1F35C8.3n/achrX 5,370,204jkk-1 encodes a member of the MAP kinase kinase superfamily that affects synaptic vesicle localization and is required in type-D motor neurons for normal locomotion; can function in the Hog1 MAP kinase pathway I in yeast as an activator of JNK and is expressed in most neurons
3srh-60W10G11.9n/achrII 3,585,242C. elegans SRH-60 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4fbxa-41F52D2.1n/achrX 1,949,939This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
5srw-124C44C3.1n/achrV 2,977,215C. elegans SRW-124 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
6dhs-16C10F3.2n/achrV 5,984,592dhs-16 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
7F14H8.4F14H8.4n/achrV 15,024,402contains similarity to Clostridium acetobutylicum Protein containing a domain related to multimeric flavodoxin WrbAsfamily.; TR:Q97H25
8F20E11.5F20E11.5n/achrV 17,461,590contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domain IPR005098 (Protein of unknown function DUF281)
9srsx-17F58D7.1n/achrV 5,929,015C. elegans SRSX-17 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
10F47B7.5F47B7.55e-24chrX 3,768,291contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
11F56C3.7F56C3.7n/achrX 1,370,660
12nhr-187F47C10.4n/achrV 3,861,996C. elegans NHR-187 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
13old-1C08H9.5n/achrII 9,867,626old-1 encodes a receptor protein tyrosine kinase; old-1 activity is required for stress resistance and regulation of adult lifespan: old-1 mRNA expression is upregulated in response to stress and in daf-2 and age-1 mutant backgrounds; likewise, overexpression of old-1 in wild-type animals extends lifespan and increases resistance to heat and UV irradiation; an OLD-1::GFP fusion protein is expressed in the anterior region of worms, in neuronal, hypodermal, and pharyngeal tissues, as well as in the proximal region of the male gonad; expression is visible in young adults and appears to increase as animals age and in response to heat, starvation, or UV irradiation.
14C03E10.1C03E10.1n/achrV 11,291,855contains similarity to Anopheles quadrimaculatus NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 (EC 1.6.5.3).; SW:NU4M_ANOQU
15F29A7.8F29A7.8n/achrII 2,757,825contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
16nhr-190F48G7.11n/achrV 641,845C. elegans NHR-190 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
17B0310.3B0310.3n/achrX 512,692
18hlh-27C17C3.10n/achrII 5,540,531C. elegans HLH-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
19C24A11.5C24A11.5n/achrI 5,385,191
20Y75B8A.34Y75B8A.34n/achrIII 12,360,286contains similarity to Homo sapiens Kappa-type opioid receptor; ENSEMBL:ENSP00000265572
21R10A10.1R10A10.1n/achrI 6,418,689
22C08H9.11C08H9.11n/achrII 9,858,792contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
23F16G10.13F16G10.134e-35chrII 2,395,441contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
24tba-5F16D3.1n/achrI 8,355,612tba-5 encodes one of nine C. elegans alpha tubulins; by homology, TBA-5 is predicted to be a component of microtubules; as loss of tba-5 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, TBA-5 likely functions redundantly with other alpha tubulins as a basic component of cellular architecture that may play additional roles in processes such as cell division, cell movement, and intracellular transport.
25srw-4F37B4.8n/achrV 2,887,985C. elegans SRW-4 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
26F22D6.8F22D6.8n/achrI 7,099,204
27str-38T23D5.2n/achrV 15,731,518C. elegans STR-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28srb-16F58A6.6n/achrII 5,149,697C. elegans SRB-16 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF03125 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
29str-141F47G9.2n/achrV 11,323,048C. elegans STR-141 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30F37H8.2F37H8.2n/achrII 11,173,534contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Structural maintenance of chromosomes (SMC) protein; SGD:YOL034W
31glr-3K10D3.1n/achrI 7,119,675glr-3 encodes a protein that contains a ligand-gated ion channel domain and a receptor family ligand binding domain with similarity to kainate-selective ionotropic glutamate receptor 2 (human GRIK2); expressed in the RIA neuron.
32C06B3.7C06B3.7n/achrV 13,910,615contains similarity to Streptococcus agalactiae Tn5252, relaxase.; TR:Q8DZ67
33srj-6F31F4.8n/achrV 653,904C. elegans SRJ-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34F55D12.1F55D12.1n/achrI 7,884,957contains similarity to Brachydanio rerio Hypothetical protein.; TR:Q803L4
35clec-198C49C3.13n/achrIV 17,349,079C. elegans CLEC-198 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
36nhr-150C06B8.1n/achrV 15,480,433C. elegans NHR-150 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
37Y57A10B.6Y57A10B.6n/achrII 12,391,276contains similarity to Pfam domain PF07149 Pes-10 contains similarity to Interpro domain IPR009819 (Pes-10)
38gcy-23T26C12.4n/achrIV 3,286,107gcy-23 encodes a receptor-type guanylyl cyclase that, along with gcy-8 and gcy-18, constitutes a subfamily of guanylyl cyclase genes in C. elegans; gcy-23 functions redundantly with gcy-8 and gcy-18, and upstream of tax-4, to regulate thermotaxis via the AFD thermosensory neurons, although of the three guanylyl cyclases required, genetic analyses suggest that GCY-18 is the primary guanylyl cyclase required; in addition, loss of gcy-23 activity via RNAi results in lifespan extension; GCY-23 is expressed exclusively in the AFD thermosensory neurons, where it localizes to sensory endings.
39hlh-10ZK682.4n/achrV 9,281,043C. elegans HLH-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
40nhr-268K06B4.6n/achrV 15,690,903C. elegans NHR-268 protein
41R05G6.5R05G6.5n/achrIV 7,509,013contains similarity to Pfam domain PF05186 Dpy-30 motif contains similarity to Interpro domains IPR001564 (Nucleoside diphosphate kinase, core), IPR007858 (Dpy-30)
42ttx-3C40H5.5n/achrX 11,766,841ttx-3 encodes a LIM homeodomain protein required for functions of the interneuron AIY, including thermosensory behavior and olfactory learning.
43T24A6.16T24A6.16n/achrV 3,562,186contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
44T10E9.5T10E9.5n/achrI 6,522,462
45F26A1.7F26A1.7n/achrIII 4,819,598
46nas-39F38E9.2n/achrX 16,464,603C. elegans NAS-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (2), PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF00431 (CUB domain) (4), PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR015446 (Bone morphogenetic protein 1/tolloid-like protein), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006210 (EGF), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013091 (EGF calcium-binding)
47C08B6.10C08B6.10n/achrV 10,126,265contains similarity to Interpro domains IPR006030 (Molluscan rhodopsin C-terminal tail), IPR000694 (Proline-rich region)
48nkat-1F28H6.3n/achrX 14,139,007nkat-1 encodes kynurenine aminotransferase III, an ortholog of mammalian KAT3; nkat-1(RNAi) animals have no obvious phenotype.
49C34D1.1C34D1.1n/achrV 13,224,279contains similarity to Pfam domain PF00751 (DM DNA binding domain)
50F45E12.6F45E12.6n/achrII 7,313,979