UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F10E7.10F10E7.100chrII 7,114,773contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3cyp-43A1E03E2.1n/achrX 5,716,005C. elegans CYP-43A1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
4ZK430.1ZK430.1n/achrII 4,428,903contains similarity to Pfam domain PF08146 BP28CT (NUC211) domain contains similarity to Interpro domains IPR012954 (BP28, C-terminal), IPR016024 (Armadillo-type fold)
5F09C8.1F09C8.1n/achrX 16,161,517contains similarity to Pfam domain PF00657 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase contains similarity to Interpro domains IPR001087 (Lipase, GDSL), IPR013830 (Esterase, SGNH hydrolase-type)
6T07C12.11T07C12.11n/achrV 9,961,427contains similarity to Interpro domain IPR006578 (MADF)
7dcs-1Y113G7A.9n/achrV 20,084,683dcs-1 encodes a scavenger mRNA decapping enzyme; dcs-1 exhibits hydrolase activity in vitro, with specificity for 7meGMP in its primary nucleoside monophosphate binding site; dcs-1 is the upstream gene in an operon with fre-1, which encodes an NADPH-dependent flavin reductase; reporter fusions using dcs-1 upstream sequence direct expression throughout the life cycle in neurons and pharyngeal muscle; expression is present in dauer larvae and enhanced by heat shock.
8rcq-5E03A3.2n/achrIII 4,055,367C. elegans RCQ-5 protein; contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) , PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR004589 (DNA helicase, ATP-dependent, RecQ type), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
9hmt-1W09D6.6n/achrIII 11,095,634hmt-1 encodes a predicted transmembrane half-molecule ATP-binding cassette (ABC) transporter orthologous to Schizosaccharomyces pombe heavy metal tolerance factor 1 (SpHMT1), an ATP-dependent phytochelatin transporter; HMT-1 is required for cadmium detoxification and by homology, is predicted to promote sequestration of heavy metal-containing phytochelatins into intracellular vacuoles to protect cells from potential damage.
10Y6B3B.9Y6B3B.9n/achrI 13,743,033contains similarity to Pfam domain PF04031 Las1-like contains similarity to Interpro domain IPR007174 (Las1-like)
11F40G12.7F40G12.7n/achrV 14,275,984contains similarity to Pfam domain PF06887 Protein of unknown function (DUF1265) contains similarity to Interpro domain IPR009676 (Protein of unknown function DUF1265)
12W02A11.1W02A11.1n/achrI 12,731,353contains similarity to Pfam domain PF08704 tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit contains similarity to Interpro domain IPR014816 (tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit)
13Y45F10D.2Y45F10D.2n/achrIV 13,774,081contains similarity to Homo sapiens Similar to Suppressor protein SRP40; VG:OTTHUMP00000170311
14F48G7.12F48G7.12n/achrV 644,981contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
15Y4C6B.6Y4C6B.6n/achrIV 5,347,749The Y4C6B.6 gene encodes a homolog of the human gene GLCM, which when mutated leads to Gaucher disease type I (OMIM:230800).
16clec-226R10D12.5n/achrV 13,947,830C. elegans CLEC-226 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold)
17taf-2Y37E11B.4n/achrIV 3,588,951taf-2 encodes a member of the peptidase M1 family, a predicted aminopeptidase with similarity to human TBP-associated factor 2.
18W04B5.4W04B5.4n/achrIII 2,408,633W04B5.4 encodes a putative mitochondrial ribosomal protein L30 that inhibits DHC-1 in vivo; W04B5.4 is orthologous to human MRPL3; W04B5.4(RNAi) suppresses the lethality of conditional dhc-1 mutations, as well as the spindle length and cytokinesis defects of dhc-1(or195), indicating that W04B5.4 negatively regulates dynein; W04B5.4 is required for embryonic and larval development in mass RNAi assays.
19F31D5.5F31D5.5n/achrII 4,199,547contains similarity to Pfam domain PF01825 Latrophilin/CL-1-like GPS domain contains similarity to Interpro domain IPR000203 (GPS)
20pbo-4K09C8.1n/achrX 10,956,107pbo-4 encodes a sodium/proton exchanger (also known as nhx-7), with a potential Ca[2+]/calmodulin binding domain in its C-terminal cytosolic region that could mediate calcium signaling; PBO-4 is expressed in the basolateral membrane of posterior intestinal cells; PBO-4 is required for normal posterior body muscle contraction (pBoc) during the defecation cycle; PBO-4 is thought to prevent intracellular acidification by catalysing the electroneutral exchange of extracellular sodium for an intracellular proton; specifically, PBO-4 may enable intercellular signals from intestinal cells (by secreting protons which then might activate PBO-5 in adjacent muscle cells).
21B0412.3B0412.3n/achrIII 802,243contains similarity to Pfam domain PF07919 Protein of unknown function (DUF1683) contains similarity to Interpro domain IPR012880 (Protein of unknown function DUF1683, C-terminal)
22H11E01.2H11E01.2n/achrX 1,623,360contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
23Y51H1A.2Y51H1A.2n/achrII 13,867,372contains similarity to Pfam domain PF02759 RUN domain contains similarity to Interpro domain IPR004012 (RUN)
24clec-187ZK896.6n/achrIV 12,870,360C. elegans CLEC-187 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
25C01F1.2C01F1.2n/achrII 4,300,243C01F1.2 is orthologous to the human gene SCO (CYTOCHROME OXIDASE DEFICIENT, YEAST) HOMOLOG 1 (SCO1; OMIM:603644), which when mutated leads to early-onset hepatic failure; the C01F1.2 protein is predicted to be mitochondrial with 68% accuracy.
26E02C12.6E02C12.6n/achrV 9,370,290contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
27srd-43R04D3.9n/achrX 13,304,796C. elegans SRD-43 protein ;
28Y32B12B.1Y32B12B.1n/achrV 16,536,916contains similarity to Leptospira kirschneri serovar grippotyphosa Hypothetical protein.; TR:Q8KWV2
29Y45F10D.6Y45F10D.6n/achrIV 13,797,043
30dapk-1K12C11.4n/achrI 1,316,902C. elegans DAPK-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00531 (Death domain) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00023 (Ankyrin repeat) (8)contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011029 (DEATH-like), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR002110 (Ankyrin), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000488 (Death)
31nhr-254ZK6.5n/achrV 393,883C. elegans NHR-254 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
32cdh-10C45G7.5n/achrIV 2,449,940cdh-10 encodes a member of the cadherin superfamily.
33R02E12.4R02E12.4n/achrX 4,005,562contains similarity to Pfam domains PF03148 (Tektin family) , PF00097 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR000435 (Tektin), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
34nhr-166C49D10.2n/achrII 3,881,165C. elegans NHR-166 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
35srt-15C50H11.10n/achrV 3,060,908C. elegans SRT-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
36T03G6.3T03G6.3n/achrX 2,613,474contains similarity to Pfam domain PF01663 Type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase contains similarity to Interpro domains IPR017849 (Alkaline phosphatase-like, alpha/beta/alpha), IPR002591 (Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase/phosphate transferase), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
37C52B9.8C52B9.8n/achrX 4,300,505contains similarity to Pfam domains PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) , PF07529 (HSA) , PF04851 (Type III restriction enzyme, res subunit) , PF00176 (SNF2 family N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR006935 (Restriction endonuclease, type I, R subunit/Type III, Res subunit), IPR013999 (HAS subgroup), IPR014012 (Helicase/SANT-associated, DNA binding), IPR000330 (SNF2-related), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR006562 (HSA), IPR005448 (Voltage-dependent calcium channel, P/Q-type, alpha-1 subunit), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
38folt-1C06H2.4n/achrV 11,142,257folt-1 encodes a folate transporter required for folate uptake; FOLT-1 is orthologous to human SLC19A1 (OMIM:600424), SLC19A2 (OMIM:603941, mutated in thiamine-responsive megaloblastic anemia syndrome), and SLC19A3 (OMIM:606152, mutated in biotin-responsive basal ganglia disease); heterologously expressed FOLT-1 transports folate in vitro; FOLT-1 activity is acid-dependent, is sodium-independent, and is inhibited by folate derivatives, sulfasalazine, or anion transport inhibitors such as 4,4''-diisothio-cyanatostilbene-2,2''-disulphonic acid (DIDS); folt-1(ok1460) and folt-1(RNAi) animals show significantly lowered folate uptake; folt-1 is expressed in several tissues, including (most strongly) pharynx and posterior intestine, as well as head, body wall, and vulva muscles, and gonad sheath cells; FOLT-1's intestinal expression diminishes with age from larvae to adults; both FOLT-1 intestinal expression and whole-animal folate uptake are lowered in folate-supplemented food media; FOLT-1 has no obvious function in mass RNAi assays, perhaps because of genetic redundancy with its paralogs FOLT-2 and FOLT-3; however, folt-1(ok1460) mutants are sluggish and sterile, which might instead indicate that FOLT-1 is required for locomotion and fertility.
39nlp-17Y45F10A.5n/achrIV 13,505,484C. elegans NLP-17 protein ;
40F53H1.3F53H1.3n/achrIV 1,334,268contains similarity to Pfam domain PF07792 Protein of unknown function (DUF1630) contains similarity to Interpro domain IPR012860 (Protein of unknown function DUF1630)
41Y57G11A.4Y57G11A.4n/achrIV 14,484,352contains similarity to Interpro domain IPR005018 (DOMON related)
42lgc-40T24D8.1n/achrX 2,362,451C. elegans LGC-40 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
43ZK250.2ZK250.2n/achrII 1,949,294contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
44C06H5.6C06H5.6n/achrV 17,884,381contains similarity to Pfam domains PF00083 (Sugar (and other) transporter) , PF07690 (Major Facilitator Superfamily) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
45F13E6.5F13E6.5n/achrX 10,696,500contains similarity to Pfam domain PF01569 PAP2 superfamily contains similarity to Interpro domains IPR000326 (Phosphatidic acid phosphatase type 2/haloperoxidase), IPR016118 (Phosphatidic acid phosphatase/chloroperoxidase, N-terminal)
46Y45G12B.3Y45G12B.3n/achrV 2,691,488contains similarity to Pfam domain PF01266 FAD dependent oxidoreductase contains similarity to Interpro domains IPR006076 (FAD dependent oxidoreductase), IPR000447 (FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase), IPR016040 (NAD(P)-binding)
47try-10F15B9.5n/achrV 13,011,526C. elegans TRY-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00089 Trypsin contains similarity to Interpro domains IPR001314 (Peptidase S1A, chymotrypsin), IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
48Y43F4B.7Y43F4B.7n/achrIII 13,310,326contains similarity to Pfam domain PF01490 Transmembrane amino acid transporter protein contains similarity to Interpro domains IPR013057 (Amino acid transporter, transmembrane), IPR003568 (Cytochrome c-type biogenesis protein CcmF)
49T10D4.6T10D4.6n/achrII 3,121,247contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR010993 (Sterile alpha motif homology), IPR009057 (Homeodomain-like)
50F22H10.4F22H10.4n/achrX 16,684,977